GGRNA ver.2 Help | Advanced search | Japanese    Previous release (v1)

2024-03-28 17:49:17, GGRNA : RefSeq release 222 (Jan, 2024)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with green background. Overlapping matches are dark colored.

PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC125683587 (LOC125683587), ncRNA. (2779 bp)
agtaggtcacagtgacctacttttttaattttgcagatattcaaatttcacattttcaattttagatgcatattttgggcactgtaaaacctaggatcatcaaactttgtcagttgatgcgtcttcagtcttcggtttgtgtcgaccaaagagtaggtcaccgtgaccttcttttggtatttgacagctaaattactatatttcagacactatttgacctataatcatcaaactttgtcagttgatgcatcttgagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctact...tgttcaccaaaaagtaggtcaccatgacctacttttggaattggacggctatatttatataattcagatactatttgacctacagtcatcaaactttgtcagttgttgggtcttgcatgtttgaagggtgttgacgaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaatttgacggctatatttatatatttcagatactatttgacctacagtcatcaaactttgtcagttgatgggtcttgcatgttcggagttcgctgaccaaaaggtaggtcaacatgacctacgattggaatttg...
position 1318 1464 1623 1902 2030 2158 2414 2541
XR_008802991.1 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Saccostrea echinata uncharacterized LOC133190573 (LOC133190573), mRNA. (3656 bp)
gagaacgtcaactaaaaagtaggtcaccttgacctactttttgaattttatggctaatgtttttcaaaacaattaaggtcattaattcgaatactgagaggtttagaatcattaaatcttgtaagatgatgcatcttggggccatgaaacatatttattaaaaagtaggtcaaagtgaccttctttttgaactttgcagt...ggtcctcggagtaagtcaactgaaaagtaggtcaccgtgacctacttttgaaaatttatggctttaattaaatatttttcaggtattaattggcttagaatcatcaaactttgtcagttgatgcatcttgggtccttggagtatgacaactgaaaggtaggtcaccttgacctacttttgaaattttatggctgtattta...tcttgggtcttcggagtaggtcgactgaaaagtaggtcactttgacctaatttatgactttagttaaatatttcaggtactaattggcttagaatcatcaaactttgtcagttgatgcatcttgggtcctcggagtacaacacctgaaaagtaggtcactgtgacctacttttgaaaatttatggcttttattaaatatt...
position 1387 1533 1938 2323 2442 2570 2904
XM_061326275.1 - Saccostrea echinata - NCBI
PREDICTED: Saccostrea echinata uncharacterized LOC133200437 (LOC133200437), ncRNA. (353 bp)
experiment="COORDINATES: polyA evidence [ECO:0006239]" /db_xref="GeneID:133200437" ORIGIN // atgattctaagccagaaagtacctaagatacttaaataaagtcataaaatgtcaaaagtaggtcaccgtgacctactttttggtcgacattttccgaaaacccaagatgcatcaactgacaaagtttgacaattctaagccaataagttcctgagatacttaaatatagccataaaatgtcaaaataggtcatggtgacctactttttggttgacattctccgaaaacccaagatgcatcaactgacaaagtttgatgattctaagccaataagtacctaagatacgtaaatatagccataaaatgtcaaaagtaggtcactgtgacctactttttggtcgatgttttccgaa
position 60 187 315
XR_009722940.1 - Saccostrea echinata - NCBI
PREDICTED: Saccostrea echinata uncharacterized LOC133179799 (LOC133179799), ncRNA. (1186 bp)
caatctatcctaagacccaagatgcatcaactgacaaagtttgatgattcttagccagttagggctgaagatatttaaatgtaactataaaatactataagtaggtcatggtgacctactttttgattgaaattttctgaggacacaagatgcattaattgacatagattgatgattctaagtcaataagtacttgagatattcaaaagtgggtcacagtgacctactttttggtcaacattctccaaaatcccaaggtgcataaactcacaacgtttgacaattctaagccaataagtaccctagaatacttaaatatagccataaatgtcacaagtaggtcaccgtgacctatattttgatcatcattctctgagaacccaagatgcatcaaataacaaaatttggtgattctaaaactctcggtgtctgaaataatgggattaaatgttttagaaaagattagccataaaattcaaaaagtaggtcacgatgacctacttttaagttgatgttatttgtggacccaagatgcaccaactgacaaagttttatgatcataggccttaaagtgtccaaaatatgcctccaattcaattt...
position 156 392 538
XR_009720176.1 - Saccostrea echinata - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis metallo-beta-lactamase domain-containing protein 1-like (LOC125659624), transcript variant X3, mRNA. (4451 bp)
tgtcaagttgtctcaaaagtaggtcacggtgacctactttttgaattttgcaggtatttattttaaaattaattttgatgcatatcttggacactttgaagcctatgatcatcaaaacttgtcagttggtggatcatgggaccttgaaatgtgtcaactgaaaaataggtcaccgtgacctactttctgaattttatggc...gcatgtccaaagggtgttgaccaaaaagtaggtcaccctgacctacttttggaattggacggctatatttatataattcagatactatttgacctacagtcatcaaactttgtcagttgttgggtcttacatgtttgaagggtgttgatgaaaaagtaggtcaccttgacctactttttgaatttgacggctatatttat...gcatgttcggagttcgctgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaagatcattaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattcttaggatttaacta...
position 2896 3042 3189 3468 3724 3980 4107
XM_048891361.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC125651708 (LOC125651708), ncRNA. (5282 bp)
agtaggtcacagtgacctactttttgaattttgcagatattcaaatttcacattttcaattttagatgcatattttgggcactgtaaaacctaggatcatcaaactttgtcagttgatgcgtcttcagtcttcggtttgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccgtgacctacttttggtatttgacagctaaattactatatttcacacactatttgacctacaatcatcaaactttgtcagttgatgcatcttgagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctact...tgttgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaattggacggctatatttatatatttcagatactatttgacctacagtcatcaaactttgtcagttgatgggtcttgcatgttcggagttcgctgaccagaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattc...
position 1581 1727 1875 2154 2282 2666 2793
XR_008803060.1 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis metallo-beta-lactamase domain-containing protein 1-like (LOC125659624), transcript variant X2, mRNA. (4476 bp)
tgtcaagttgtctcaaaagtaggtcacggtgacctactttttgaattttgcaggtatttattttaaaattaattttgatgcatatcttggacactttgaagcctatgatcatcaaaacttgtcagttggtggatcatgggaccttgaaatgtgtcaactgaaaaataggtcaccgtgacctactttctgaattttatggc...gcatgtccaaagggtgttgaccaaaaagtaggtcaccctgacctacttttggaattggacggctatatttatataattcagatactatttgacctacagtcatcaaactttgtcagttgttgggtcttacatgtttgaagggtgttgatgaaaaagtaggtcaccttgacctactttttgaatttgacggctatatttat...gcatgttcggagttcgctgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaagatcattaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattcttaggatttaacta...
position 2921 3067 3214 3493 3749 4005 4132
XM_048891360.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis metallo-beta-lactamase domain-containing protein 1-like (LOC125659624), transcript variant X1, mRNA. (4503 bp)
tgtcaagttgtctcaaaagtaggtcacggtgacctactttttgaattttgcaggtatttattttaaaattaattttgatgcatatcttggacactttgaagcctatgatcatcaaaacttgtcagttggtggatcatgggaccttgaaatgtgtcaactgaaaaataggtcaccgtgacctactttctgaattttatggc...gcatgtccaaagggtgttgaccaaaaagtaggtcaccctgacctacttttggaattggacggctatatttatataattcagatactatttgacctacagtcatcaaactttgtcagttgttgggtcttacatgtttgaagggtgttgatgaaaaagtaggtcaccttgacctactttttgaatttgacggctatatttat...gcatgttcggagttcgctgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaagatcattaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattcttaggatttaacta...
position 2948 3094 3241 3520 3776 4032 4159
XM_048891359.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 1-like (LOC125680598), mRNA. (4549 bp)
agtaggtcacagtgacctactttttgaattttgcagatattcaaatttcacattttcaattttagatgcatattttgggcactgtaaaacctaggatcatcaaactttgtcagttgatgcgtcttcagtcttcggtttgtgttgaccaaaaagtaggtcaccgtgacctacttttggtatttgacagctaaattactatatttcagacactatttgacctacaatcatcaaactttgtcagttgatgcatcttgagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctact...tgtcgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaattggacggctatatttatataattcagatactatttgacctacagtcatcaaactttgtcagttgatgggtcttgcatgttcggagttcgctgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattc...
position 42 189 468 596 724 1236
XM_048920279.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Saccostrea echinata 3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase-like (LOC133177755), mRNA. (5390 bp)
tatcatgttgactcaaaagtaggtcatgatgacctactttttaaattttgcggccattctttttcaaaatgatttagaggcatattttgaacaatttaaggcctatgatcattaaactttgtcagttgatgtatcttgggtcctcgaagtacgtcaactaaaaaataggtcaccttgacctactttttgaattttatggc...aaacatatttattaaatagtaggtcacaatgacctgctttttgaactttgcaggcattcgatttcaaagcattttagaggcataatttggacattttaaggcctatgatcataaaactttgtaagttgatgcatcttggatcctcagaaaacgtcaactgaaaagtaggtcactgtgacctgtgtcaatttatatgacta...gggtcttcgaagtaggttgactgaaaagtaggtcaccgtgacctacttttgaaaatttatggcattatttaaatattactggtacttattggcttagaatcatcagactttgtcagttgatgcatctttggtcctcagagtacaacaactgaaaagtaggtcaccatgacctactttttgaaaatttatggctttaatta...
position 3829 3975 4121 4267 4393 4648
XM_061312660.1 - Saccostrea echinata - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC125666634 (LOC125666634), mRNA. (4951 bp)
aaagtaggtcatggtgacctactttttgaatttcgcaggtaattattatgaaatggattttgatgaatatcttggacacttttgagcctatgatcatcaaaagttgtcaattgatggatcatgggaccttgaactgcatcatgtaaaaagtaggtcaccatgacctactttctgaattttatggctaatcatttatatatacattttaggttgttatttcagataccaagaggtttagaatcatcaaaccttgtaagttgatgcgtctagaggccttgaaacatatttataaaaaaaaagtaggtcacagtgacctacttttgaatttttgcagacattcaaatttcacattttcaattttagatgcatattttggacactatgaaagctaggatcatcaaactttgttagttgatgcatcttgagtcttcatagtttgttcaccaaaaagtaggtcactgtgacctacttttggaatttgacgtctatattttaatatttcagatactatttgacttacaattatcaaactttgtcagttgttgcattttgagtcttcagagtgtgttgactaaaaagtaggtcaccgtgacctatttt...
position 1469 1615 1765 1916 2044
XM_048899828.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ruditapes philippinarum uncharacterized LOC132713846 (LOC132713846), ncRNA. (908 bp)
caatcatcctatgaagtttgaatattgtgggctaaatggaactaaagttatgctcaagaaactgttttcaaattctaagtaatagtgaccttgacctttgaccttgtgaccccaaaatcaataggggtattctacccaatatggacaatcatcctatgaagtttgaacactgtgggccaaatagaacttaagttatgctccggaaactgttttcagttctaaggtcataatgaccttgacctttgacctgtgaccccaaaatctaaaggggtcttctaccaaatatggacaatcatcctatgaagtttgaacactgtaggacaaatggaacttaagttatgctccagaaactgttttcagttttaaggtcatagtgaccttgacctttgaccttgtgaccccaaaatcaataggggtcttctaccaaatatggacaatcatcctatgaagtttgaacactgtgggccaaaatgaacttaagttatgctccggaaactgttttcagttttaaggtcatagtgaccttgacctttgaccttatgacccaaaagtcaataggggtcttcaacccaatatggacaatcatcctatgaagtttga...
position 255 399
XR_009623496.1 - Ruditapes philippinarum (Manila clam) - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis carboxypeptidase A4-like (LOC125651525), transcript variant X2, mRNA. (6829 bp)
agtaggtcacagtgacctactttttgaattttgcagatattcaaatttcacattttcaattttagatgcatattttgggcactgtaaaacctaggatcatcaaactttgtcagttgatgcgtcttcagccttcggtttgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccgtgacctacttttggtatttgacagctaaattactatatttcagacactatttgacctacaatcatcaaactttgtcagttgatgcatcttgagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctact...tgttgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaattggacggctatatttatatatttcagatactatttgacctacagtcatcaaactttgtcagttgatgggtcttgcatgttcggagttcgctgaccagaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacactgacctacttttttttaattc...
position 5161 5307 5454 5733 5861 6245 6372
XM_048880160.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Saccostrea echinata ecdysteroid-phosphate phosphatase-like (LOC133172352), mRNA. (7866 bp)
ggtcgactaaaaagtaggtcacagtgacctacttttgaaatttatggctttaattaaatatatggggtactaattggctttgaatcatcaaactttgtcagttgatgacttttgggtcttcggagtaggtcgactaaaaagtaggtcaccatgacctacttgcaaaaatttatggctttaattaaatattttgggtactaattggcttagaatcataaaactttgtcagttcatgtgtcttgggtcctcggagtgcaacaactgaaaagtaggtcatggtgacctacttttgaaaattta...agattgactgaaaagtaggtcactgtgacctacttttgaaaatttatggcttcaattaaatattttcggtacttattggcttagaatcatcaaactttgtcagtcgatgtatctttggtcctcggagtacagcaactgaaaagtaggtcaccgtgacctacttttgaaaatttatggctttaattaaatatttcaggtactaattggcttaaaatcaaactttgtcaattgatgcatcttgggtccttggagtacaacaattgaaaagtaggtcactttgacctacttataaaattttat...
position 5142 5288 5434 5749 6261 6389 6514
XM_061307220.1 - Saccostrea echinata - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis carboxypeptidase A4-like (LOC125651525), transcript variant X1, mRNA. (7310 bp)
agtaggtcacagtgacctactttttgaattttgcagatattcaaatttcacattttcaattttagatgcatattttgggcactgtaaaacctaggatcatcaaactttgtcagttgatgcgtcttcagccttcggtttgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccgtgacctacttttggtatttgacagctaaattactatatttcagacactatttgacctacaatcatcaaactttgtcagttgatgcatcttgagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctact...tgttgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaattggacggctatatttatatatttcagatactatttgacctacagtcatcaaactttgtcagttgatgggtcttgcatgttcggagttcgctgaccagaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacactgacctacttttttttaattc...
position 5642 5788 5935 6214 6342 6726 6853
XM_048880159.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis RING finger protein 145-like (LOC125658441), transcript variant X1, mRNA. (6236 bp)
aagtaggtcacagtgacctactttttgaattttgcagatattcaaatttcacattttcaattttagatgcatattttgggcactgtaaaacctaggatcatcaaactttgtcagttgatgcatcttcgtcttcggtttgtgtcgaccaaaagtaggtcaccgtgacctacttttggtatttgacagctaaattactatatttcagacactatttgacctacaatcatcaaactttgacagttgatgcatcttgagtcaacggagtgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccttgacctactt...tgttgacgaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaatttgacggctatatttatatatttcagatactatttgacctacagtcatcaaactttgtcagttgatgggtcttgcatgttcggagttcgatgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatattaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattc...
position 4709 4855 5002 5279 5790 5917
XM_048889708.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis RING finger protein 145-like (LOC125658441), transcript variant X2, mRNA. (6300 bp)
aagtaggtcacagtgacctactttttgaattttgcagatattcaaatttcacattttcaattttagatgcatattttgggcactgtaaaacctaggatcatcaaactttgtcagttgatgcatcttcgtcttcggtttgtgtcgaccaaaagtaggtcaccgtgacctacttttggtatttgacagctaaattactatatttcagacactatttgacctacaatcatcaaactttgacagttgatgcatcttgagtcaacggagtgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccttgacctactt...tgttgacgaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaatttgacggctatatttatatatttcagatactatttgacctacagtcatcaaactttgtcagttgatgggtcttgcatgttcggagttcgatgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatattaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattc...
position 4773 4919 5066 5343 5854 5981
XM_056150591.1 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC125678734 (LOC125678734), transcript variant X9, mRNA. (7174 bp)
tgtcaagttgtctcaaaagtaggtcacggtgacctactttttgaattttgcaggtatttattttaaaattaattttgatgcatatcttggacactttgaagcctatgatcatcaaaacttgtcagttggtggatcatgggaccttgaaatgcgtcaactgaaaaataggtcaccgtgacctactttctgaattttatggc...gagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctacttttggcatttgacagttatatttatatatttcagtcactaattgacctacaatcatcaaactttgacagttgatgcatcttgagtctacggagtgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaatttgacggctatatttat...gcatgttcggagttcgctgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattcttaggatttaacta...
position 5122 5268 5416 5695 5823 6208
XM_048917404.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC125678734 (LOC125678734), transcript variant X1, mRNA. (7186 bp)
tgtcaagttgtctcaaaagtaggtcacggtgacctactttttgaattttgcaggtatttattttaaaattaattttgatgcatatcttggacactttgaagcctatgatcatcaaaacttgtcagttggtggatcatgggaccttgaaatgcgtcaactgaaaaataggtcaccgtgacctactttctgaattttatggc...gagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctacttttggcatttgacagttatatttatatatttcagtcactaattgacctacaatcatcaaactttgacagttgatgcatcttgagtctacggagtgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaatttgacggctatatttat...gcatgttcggagttcgctgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattcttaggatttaacta...
position 5134 5280 5428 5707 5835 6220
XM_048917405.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC125678734 (LOC125678734), transcript variant X4, mRNA. (7215 bp)
tgtcaagttgtctcaaaagtaggtcacggtgacctactttttgaattttgcaggtatttattttaaaattaattttgatgcatatcttggacactttgaagcctatgatcatcaaaacttgtcagttggtggatcatgggaccttgaaatgcgtcaactgaaaaataggtcaccgtgacctactttctgaattttatggc...gagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctacttttggcatttgacagttatatttatatatttcagtcactaattgacctacaatcatcaaactttgacagttgatgcatcttgagtctacggagtgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaatttgacggctatatttat...gcatgttcggagttcgctgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattcttaggatttaacta...
position 5163 5309 5457 5736 5864 6249
XM_048917399.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC125678734 (LOC125678734), transcript variant X3, mRNA. (7217 bp)
tgtcaagttgtctcaaaagtaggtcacggtgacctactttttgaattttgcaggtatttattttaaaattaattttgatgcatatcttggacactttgaagcctatgatcatcaaaacttgtcagttggtggatcatgggaccttgaaatgcgtcaactgaaaaataggtcaccgtgacctactttctgaattttatggc...gagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctacttttggcatttgacagttatatttatatatttcagtcactaattgacctacaatcatcaaactttgacagttgatgcatcttgagtctacggagtgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaatttgacggctatatttat...gcatgttcggagttcgctgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattcttaggatttaacta...
position 5165 5311 5459 5738 5866 6251
XM_048917398.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127879514 (LOC127879514), transcript variant X2, ncRNA. (2109 bp)
tcaaggtcacgatgacccgaaatagttaaatggtttccggatgataactcaagaacgcttaggcctaggatcatgtaacttcataggtacattgatcataactcgtagatgacccctattgattttcaggtcactaggtcaaaggtcaaggtcacgatgacctgaaatagtaaaatggtttccggatgataactcaagaacgcttaggcctaggatcatgaaacttcataggtacattgatcatgactcgtagatgacccctattgattttcaggtcactaggtcaaaggtcaaggtcacagtgacctgaaatagtaaaatggtttctggatgataactcaagaacgcttaggcctaggatcatgaaacttcataggtacattgatcatgactcgtagatgacccctattgattttcaggtcactaggtcaaaggtcaaggtcacggtgacctgaaatagtaaaatggtttctggatgataactcaagaacgcttatgcctaggatcatgaaacttcataggtacattgatcatgactcgtagatgacccctattgattttcaggtcactaggtcaaaggtcaaggtcacggtgacctga...
position 669 814 959
XR_008049130.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC125678734 (LOC125678734), transcript variant X8, mRNA. (7283 bp)
tgtcaagttgtctcaaaagtaggtcacggtgacctactttttgaattttgcaggtatttattttaaaattaattttgatgcatatcttggacactttgaagcctatgatcatcaaaacttgtcagttggtggatcatgggaccttgaaatgcgtcaactgaaaaataggtcaccgtgacctactttctgaattttatggc...gagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctacttttggcatttgacagttatatttatatatttcagtcactaattgacctacaatcatcaaactttgacagttgatgcatcttgagtctacggagtgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaatttgacggctatatttat...gcatgttcggagttcgctgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattcttaggatttaacta...
position 5231 5377 5525 5804 5932 6317
XM_048917403.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC125678734 (LOC125678734), transcript variant X7, mRNA. (7353 bp)
tgtcaagttgtctcaaaagtaggtcacggtgacctactttttgaattttgcaggtatttattttaaaattaattttgatgcatatcttggacactttgaagcctatgatcatcaaaacttgtcagttggtggatcatgggaccttgaaatgcgtcaactgaaaaataggtcaccgtgacctactttctgaattttatggc...gagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctacttttggcatttgacagttatatttatatatttcagtcactaattgacctacaatcatcaaactttgacagttgatgcatcttgagtctacggagtgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaatttgacggctatatttat...gcatgttcggagttcgctgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattcttaggatttaacta...
position 5301 5447 5595 5874 6002 6387
XM_048917401.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC125678734 (LOC125678734), transcript variant X6, mRNA. (7365 bp)
tgtcaagttgtctcaaaagtaggtcacggtgacctactttttgaattttgcaggtatttattttaaaattaattttgatgcatatcttggacactttgaagcctatgatcatcaaaacttgtcagttggtggatcatgggaccttgaaatgcgtcaactgaaaaataggtcaccgtgacctactttctgaattttatggc...gagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctacttttggcatttgacagttatatttatatatttcagtcactaattgacctacaatcatcaaactttgacagttgatgcatcttgagtctacggagtgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaatttgacggctatatttat...gcatgttcggagttcgctgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattcttaggatttaacta...
position 5313 5459 5607 5886 6014 6399
XM_048917402.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC130054058 (LOC130054058), mRNA. (4269 bp)
aaactttgatattttgcttagtataaggactaggatcatcaaattttgtcagttgatgcatcttaggacctaatatcatgttgtctcaaaagtaggtcatggtgacctattttttaatttcgcaggtaattattattaaatggattttgatgcatatcttggacacttttgagcctatgatcatcaaaagttgtcagttg...aggttgttatttcagataccgagaggtttagaatcatcaaaccttgtaagttgatgcgtctagaggcctcaaaacatatttatttaaaaaagtaggtcacggtgacctactttttttaattttgcagacattcaaatttcacattttcaatcagtttagatgcatattttggacactatgaaagctaggatcatcaaact...agtcttcagagtgtgttgactaaaacgtaggtcaccgtgacctatttttggattttgacggctatatttgaatatttcagatactatttgacttacaatcatcaaacttttgtcagttgatgggtcttgagtcttcagagtgtgtcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctacttttggaatttgacgtttatatctga...
position 134 428 693 822
XM_056162355.1 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC125678734 (LOC125678734), transcript variant X2, misc_RNA. (7058 bp)
tgtcaagttgtctcaaaagtaggtcacggtgacctactttttgaattttgcaggtatttattttaaaattaattttgatgcatatcttggacactttgaagcctatgatcatcaaaacttgtcagttggtggatcatgggaccttgaaatgcgtcaactgaaaaataggtcaccgtgacctactttctgaattttatggc...gagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctacttttggcatttgacagttatatttatatatttcagtcactaattgacctacaatcatcaaactttgacagttgatgcatcttgagtctacggagtgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaattggacggctatatttat...gcatgttcggagttcgctgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattcttaggatttaacta...
position 5134 5280 5428 5707 5835 6092
XR_008800251.1 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC125678734 (LOC125678734), transcript variant X5, mRNA. (7911 bp)
tgtcaagttgtctcaaaagtaggtcacggtgacctactttttgaattttgcaggtatttattttaaaattaattttgatgcatatcttggacactttgaagcctatgatcatcaaaacttgtcagttggtggatcatgggaccttgaaatgcgtcaactgaaaaataggtcaccgtgacctactttctgaattttatggc...gagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctacttttggcatttgacagttatatttatatatttcagtcactaattgacctacaatcatcaaactttgacagttgatgcatcttgagtctacggagtgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaatttgacggctatatttat...gcatgttcggagttcgctgaccaaaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctatatttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattcttaggatttaacta...
position 5859 6005 6153 6432 6560 6945
XM_048917400.2 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Haliotis rufescens uncharacterized LOC124143575 (LOC124143575), transcript variant X2, mRNA. (3073 bp)
ttcacttttttattatatatttaatctcatttcatgtgacagacatgcgactggagactccagcatctgatcgattgttctttttaatttcgctgcggttaaccgatacatattaacctcccaagaagacggagaagaaatgtttgttattttaacataaatgaaaggcgtctcttatacagatataaatatcccaaaatcccaagcaagtctgtgacctgctgtactggtctgaaggcgaggtcactgtgacctgctgtactggtctgaaagcgaggtcactgtgacctgctgtactggtctgaaggcgaggtcactgtgacctgctgtactggtctgaagacgaggtcacagtgacctgctgtactggtctgatggcgaggtcactgtgacctgctgtactggtctgatggcgaggtcactgtgacctgctgtactggtctgatggcgaggtcacagtgacctgctgtactggtctgatggcgaggtcacagtgacctgctgtactggtctgatggcgaggtcactgtaacctgctgtactggtctgatggcgaggtcactgtaacctgcagtactggtctgaaggcgaggtcactgt...
position 2225 2330
XM_046512601.2 - Haliotis rufescens (red abalone) - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis two pore channel protein 1-like (LOC125664453), mRNA. (8631 bp)
agtaggtcacagtgacctactttttgaattttgcagatattcaaatttcacattttcaattttagatgcatattttgggcactgtaaaacctaggatcatcaaactttgtcagttgatgcgtcttcagtcttcggtttgtgtcgaccaaaaagtaggtcaccgtgacctacttttggtatttgacagctaaattactatatttcagacactatttgacctacaatcatcaaactttgtcagttgatgcatcttgagtcttcggagtgtatcgaccaaaaagtaggtcactgtgacctact...tgttgaccaaaaagtaggtcaccttgacctacttttggaattggacggctatatttatatatttcagatactatttgacctacagtcatcaaactttgtcagttgatgggtcttgcatgttcggagttcgctgaccagaaagtaggtcaccatgacctacgattggaatttgacagctaattttcaatattcagatactaattggcttaaaatcatcaaactttgtcagttgatatttcttgggttctcaaaatgtgtaaaccaaaaagtaggtcacattgacctactttttttgaattc...
position 3688 3834 3982 4261 4389 4773 4900
XM_056151036.1 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Haliotis rufescens uncharacterized LOC124143575 (LOC124143575), transcript variant X1, mRNA. (3634 bp)
ttcacttttttattatatatttaatctcatttcatgtgacagacatgcgactggagactccagcatctgatcgattgttctttttaatttcgctgcggttaaccgatacatattaacctcccaagaagacggagaagaaatgtttgttattttaacataaatgaaaggcgtctcttatacagatataaatatcccaaaatcccaagcaagtctgtgacctgctgtactggtctgaaggcgaggtcactgtgacctgctgtactggtctgaaagcgaggtcactgtgacctgctgtactggtctgaaggcgaggtcactgtgacctgctgtactggtctgaagacgaggtcacagtgacctgctgtactggtctgatggcgaggtcactgtgacctgctgtactggtctgatggcgaggtcactgtgacctgctgtactggtctgatggcgaggtcacagtgacctgctgtactggtctgatggcgaggtcacagtgacctgctgtactggtctgatggcgaggtcactgtaacctgctgtactggtctgatggcgaggtcactgtaacctgcagtactggtctgaaggcgaggtcactgt...
position 2786 2891
XM_046512600.2 - Haliotis rufescens (red abalone) - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127875043 (LOC127875043), ncRNA. (315 bp)
LOC127875043" /product="uncharacterized LOC127875043" /experiment="COORDINATES: polyA evidence [ECO:0006239]" /db_xref="GeneID:127875043" ORIGIN // ggtcaaggtcactgtgaccttaaatgttaaaatgttaaaattgttataactttggtatgcttggacatagagtcttcaaacttgacatgaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcgaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactggtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaaa
position 6 281
XR_008047228.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Ostrea edulis uncharacterized LOC130047798 (LOC130047798), ncRNA. (2314 bp)
catcaactgacaaagtttgatgattgtaagtcaaatggtatctgaaatattcaaatatagccgccaaaatccaaaaataggtcacggtgacctacattttaggcaacacaatctgaagactcaacatgcattaactgacaaagtttgataattgtaagtcaaatagtatctgaaatattaaaatataggcgtcaaattccaaaagtaggtcacggtgatctactatttggtcaacaaactatgaagactcaagatgcatcaactgacaaagtttgatgatcctagctttcatagtgtccaaaatatgcatctaaaattgaaaatgtgaaatttgaatgtctgcaaaattcaaaaagtaggtcactgtgacctacttttttttttataaatatgtttcgaggcctctagacgcatcaacttacatgatttgatgattataaacctctcaatatctgaaataacaacctaaaatgtattcataaatgattagccataaaattcagaaagtaggtcatggtgacctacttttcacatgacgcagttgaaggtcctatgttccatcaactgacaacttttgatgatcatacgctcaaaagtgtc...
position 648 927 1078
XR_008796613.1 - Ostrea edulis - NCBI
PREDICTED: Sebastes umbrosus solute carrier family 45 member 3 (LOC119475566), mRNA. (4402 bp)
acaaacagacacttagacccggtaagggtcaaggtcaccgtgacctcacgtccgtcccattctggtgaaatctcaggaacgccttgagctaatttcttcaaatttggcagaaacttcctcttggaatcaaggatgaactcattagattttggtagtcaaaggtcaaggtcactgtgaccttacatccgtctcattctcatgaaagcattatctcaggaacactttgagcaaatgtcttcaaatttggtacaaacttccacttcgactcaaggttgaactgattaggtcaaaggtcactctgacctcacgtccgtcccattctagtgacatctcaggaacgccttcagcgaattccttcaaattttgcaccaacatccacttcaacaaggatgaacttattatattttgtttgatgaaggtcaaaggtcaccgtgactttacgactgtcccattctcgtgatattttgggatcgccttgatcaaatttcctcgaatttggcgtaaacatccatttcatcaaggtgaagtgattaaatttttttggttaaaggtcaaggtcaccatgacctcacactcgtcccattctcatgaaatcttggg...
position 2181 2281 2540 2804
XM_037748436.1 - Sebastes umbrosus (honeycomb rockfish) - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127874579 (LOC127874579), ncRNA. (956 bp)
catgaaggttggccaggattaacagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaagttcttatttcatggtataactttggtatgcttggacctagagtcttcaaacttgacatgaaggttggccaggattaacagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttcaatataaaaaatgttaaagttgttataactttggtatgcttggacctagagtcttgaaacttgacatgaaggttggccataactagttagtaaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaagttcttatttcatggtataactttggtatgcttggacctagagtcttcaaacttgacatgaaggttggccaggattaacagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtgaaggtcaccgtgaccttcaatataaaaatgttaaagttgttataactttggtatgcttggacctagagtcttgaaacttg...
position 137 593
XR_008046999.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127867709 (LOC127867709), ncRNA. (1081 bp)
gaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcattctaaggtcaaggtcactgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaagttcttataactttggtgggtaaaaatgttaaagttcttattccatgttataactttggtatgcttgtacctagagtcttcaaacttgacataaaggttggccagtactagaagatcaccactgctcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttcaatgttaaaatgttaaaattgttataactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcgaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactggtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaaa
position 140 1047
XR_008043623.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127847562 (LOC127847562), ncRNA. (441 bp)
ORIGIN // aatgttaaagttcttatttcatggtataactttggtatgcttggacctagagtcttcaaacttgacatgaaggttggccaggattaacagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttcaatataaaaaatgttaaagttgttataactttggtatgcttggacctagagtcttgaaacttgacatgaaggttggccataactagttagtaaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtccaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactggtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaaa
position 131 407
XR_008034039.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127868082 (LOC127868082), ncRNA. (1189 bp)
tgaaggtcaaggtcactgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaagttgttataactttggtatgcttggacctagagtcttgaaacttgacatgaaggttggccagaactagtaagtaaccactggacatttcaaggtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaagttcttatttcatgttataactttggtatgcttgtacctagagtcttcaaacttgaaataaagattggccagtactagaagatgaccactggtcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttaaatgttaaaattgttataactttggtatgcttggacatagagtcttcaaacttgacatgaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcgaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactggtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaa...
position 142 1155
XR_008043876.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127838520 (LOC127838520), ncRNA. (1112 bp)
ttcaaacttgacataaaggttggccagtactagaagatcaccactgctcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttcaatgttaaaatgttaaaattgttataactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaacttaaatgttaaaatgttaaaattgttgtaactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcgaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactggtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaaaaatgttt
position 14 1081
XR_008029839.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127864982 (LOC127864982), ncRNA. (1225 bp)
gaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcattctaaggtcaaggtcactgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaagttcttataactttggtaggtaaaaatgttaaagttcttattccatgttataactttggtatgcttgtacctagagtcttcaaacttgacataaaggttggccagtactagaagatcaccactgctcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttcaatgtaaaaatgttaaaattgttataactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcgaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactggtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaaa
position 138 1191
XR_008042418.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Sebastes umbrosus FXYD domain containing ion transport regulator 5 (fxyd5), transcript variant X1, mRNA. (1260 bp)
gggattggaagtgggataaagatttcgtctatggtgagaagctacatttgactgtgtttttatgtctgtccagtccatccaacgcctggagggaattccttcaaatttggcacaaacttcaacttggacttgtggatgaacgaattcaattttggtggtcaaaggtcactgtgacctcacgtccatcccaatcgtgatatctcaagaacgccttgaaggaatttcttcaaacttggcacaaacgtccgcttttactcaaggataaagtgattacatttagatgttcaaaggtcgaggtcactgtgacctcacgtctgtcccattctcatgctatctcaagaatgccttgaacgaatttcttcaaatctggcacaaacatccaattggactttaactgttaactgtttacaatttggtggtcaaaggtcattgtgacctcacaaaaaaacatttttggctttaactcaaggatccaaatgttaaatatgacaatttcacacaaatgtggaataggataaaatgatgaagtgatgaccttttagacagacatggatgtaaactgcaacttgactggctggcggaggcatacaaccgctaagt...
position 802 1063
XM_037785583.1 - Sebastes umbrosus (honeycomb rockfish) - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127842430 (LOC127842430), ncRNA. (1038 bp)
ttcaaacttgacataaaggttggccagtactagaagatcaccactgctcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttcaatgttaaaatgttaaaattgttataactttggtacgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaacttaaatgttaaaatgttaaaattgttgtaactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcgaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactggtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaaa
position 128 1004
XR_008031621.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127832704 (LOC127832704), ncRNA. (1232 bp)
ttcaaacttgacataaaggttggccagtactagaagatcaccactgctcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttcaatgttaaaatgttaaaattgttataactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaacttaaatgttaaaatgttaaaattgttgtaactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcgaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactggtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaaa
position 131 1198
XR_008027069.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Mya arenaria uncharacterized LOC128230181 (LOC128230181), transcript variant X1, mRNA. (2877 bp)
aaggtcacagtgaccttgaatgataaaaggttgtccgagtgataactcgacaatgcctgaacccatggccctcaaacttgacatggaggcttagcctgaccagtagatgacccctattcattttaaggttcttcgggccaatggttaaggtcaaagtgacctttaatgatagaaggttgtcttagtgataactagacaatgcctgcaccaatggccctcaaacttgacttagaggttgggccgaggacccctctcgattttgggggtcatcaagtcaaaagtcaaggtcaccgtgacctt...tcatggtcacagtgaccttaaatgcgaaaatgttcttagagtgataacttgacaatgcctgcacctttggccctcaaacatgacttgggggttgggcctgacctgtagatgaccccttttatttaaggggtcatcaaaggtcaaggtcacactgaccttgaactctgaaagcttttctgtgtgataaactgacaatgcctgcacccatgaccctcaaacttgacatttaggttttgggtcaccagttgatgacgcctttggattttgaggtcaaaggtcatggtcataactcatattcat...
position 1089 1391 1528 1909
XM_052942238.1 - Mya arenaria - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127848324 (LOC127848324), ncRNA. (1345 bp)
ttcaaacttgaaataaagattggccagtactagaagatgaccactggtcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttcaatgttaaaatgttaaaattgttataactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaacttaaatgttaaaatgttaaaattgttgtaactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcgaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactggtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaaa
position 132 1311
XR_008034456.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127861862 (LOC127861862), ncRNA. (1522 bp)
gaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcattctaaggtcaaggtcactgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaagttcttataactttggtaggtaaaaatgttaaagttcttattccatgttataactttggtatgcttgtacctagagtcttcaaacttgacataaaggttggccagtactagaagatcaccactgctcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttcaatgttaaaatgttaaaattgttataactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcgaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactggtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaaa
position 135 1488
XR_008040326.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127864259 (LOC127864259), ncRNA. (1368 bp)
agtcttcaaacttgacataaaggttggccagtactagaagatcaccactgctcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttcaatgttaaaattgttataactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaacttaaatgttaaaatgttaaaattgttgtaactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcgaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactggtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaaa
position 131 1334
XR_008041653.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127861563 (LOC127861563), ncRNA. (1270 bp)
ttcaaacttgaaataaagattggccagtactagaagatgaccactggtcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttcaatgttaaaatgttaaaattgttataactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaacttaaatgttaaaatgttaaaattgttgtaactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcgaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactagtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaaattcttatttcatggtataactttcttatgcttggacttacagtcttcaaactggac...
position 135 1014
XR_008040261.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127859856 (LOC127859856), ncRNA. (1372 bp)
ttcaaacttgaaataaagattggccagtactagaagatgaccactggtcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttaaatgttaaaatgttaaaattgttataactttggtatgcttggacatagagtcttcaaacttgacatgaaggtttgcaagcacactaagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaacttaaatgttaaaatgttaaaattgttgtaactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcgaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactggtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaaa
position 158 1338
XR_008039478.1 - Dreissena polymorpha - NCBI
PREDICTED: Dreissena polymorpha uncharacterized LOC127859887 (LOC127859887), ncRNA. (1377 bp)
ttcaaacttgacataaaggttggccagtactagaagatcaccactgctcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaccttcaatgttaaaatgttaaaattgttataactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttcaatgtcattcatttgaaggtcaaggtcactgtgaacttaaatgttaaaatgttaaaattgttgtaactttggtatgcttggacctagaatctcaaacttgacgtaaaggtttgcaagcacacttagatgaccactggtcatttcaaggtcattcatttgaaggtcgaggtcactgtgaccttggatgtaaatatgttaaagttgttaatactttggtatgcttagacctagagtcttcaaacttgatatgaaggttggccagaactagtagatgaccactggtcattttaaggtcaaggtcaccgtgaccttgaatgtaaaaatgttaaaa
position 132 1343
XR_008039513.1 - Dreissena polymorpha - NCBI

Data Export:

Maximum 10000 results can be retrieved as Tab-delimited text or JSON format.

Debug Info:

Redirect URI : http://ggrna.dbcls.jp/iubboth%3aaggtcannrtgacct
lang : en | div : | spe : | query_string : iubboth:aggtcannrtgacct | format : html | download :

0.000 | 0.000 | search_start;
0.232 | 0.232 | count_done; http://172.18.8.71:7700/v1/refsub/query?q=((nt:aggtcaaaatgacct)%7C(nt:aggtcaatatgacct)%7C(nt:aggtcaagatgacct)%7C(nt:aggtcaacatgacct)%7C(nt:aggtcataatgacct)%7C(nt:aggtcattatgacct)%7C(nt:aggtcatgatgacct)%7C(nt:aggtcatcatgacct)%7C(nt:aggtcagaatgacct)%7C(nt:aggtcagtatgacct)%7C(nt:aggtcaggatgacct)%7C(nt:aggtcagcatgacct)%7C(nt:aggtcacaatgacct)%7C(nt:aggtcactatgacct)%7C(nt:aggtcacgatgacct)%7C(nt:aggtcaccatgacct)%7C(nt:aggtcaaagtgacct)%7C(nt:aggtcaatgtgacct)%7C(nt:aggtcaaggtgacct)%7C(nt:aggtcaacgtgacct)%7C(nt:aggtcatagtgacct)%7C(nt:aggtcattgtgacct)%7C(nt:aggtcatggtgacct)%7C(nt:aggtcatcgtgacct)%7C(nt:aggtcagagtgacct)%7C(nt:aggtcagtgtgacct)%7C(nt:aggtcagggtgacct)%7C(nt:aggtcagcgtgacct)%7C(nt:aggtcacagtgacct)%7C(nt:aggtcactgtgacct)%7C(nt:aggtcacggtgacct)%7C(nt:aggtcaccgtgacct)%7C(nt:aggtcataatgacct)%7C(nt:aggtcatattgacct)%7C(nt:aggtcatagtgacct)%7C(nt:aggtcatactgacct)%7C(nt:aggtcattatgacct)%7C(nt:aggtcattttgacct)%7C(nt:aggtcattgtgacct)%7C(nt:aggtcattctgacct)%7C(nt:aggtcatgatgacct)%7C(nt:aggtcatgttgacct)%7C(nt:aggtcatggtgacct)%7C(nt:aggtcatgctgacct)%7C(nt:aggtcatcatgacct)%7C(nt:aggtcatcttgacct)%7C(nt:aggtcatcgtgacct)%7C(nt:aggtcatcctgacct)%7C(nt:aggtcacaatgacct)%7C(nt:aggtcacattgacct)%7C(nt:aggtcacagtgacct)%7C(nt:aggtcacactgacct)%7C(nt:aggtcactatgacct)%7C(nt:aggtcactttgacct)%7C(nt:aggtcactgtgacct)%7C(nt:aggtcactctgacct)%7C(nt:aggtcacgatgacct)%7C(nt:aggtcacgttgacct)%7C(nt:aggtcacggtgacct)%7C(nt:aggtcacgctgacct)%7C(nt:aggtcaccatgacct)%7C(nt:aggtcaccttgacct)%7C(nt:aggtcaccgtgacct)%7C(nt:aggtcaccctgacct))?to=0&format=json
1.001 | 0.769 | search_done; http://172.18.8.71:7700/v1/refsub/query?q=((nt:aggtcaaaatgacct)%7C(nt:aggtcaatatgacct)%7C(nt:aggtcaagatgacct)%7C(nt:aggtcaacatgacct)%7C(nt:aggtcataatgacct)%7C(nt:aggtcattatgacct)%7C(nt:aggtcatgatgacct)%7C(nt:aggtcatcatgacct)%7C(nt:aggtcagaatgacct)%7C(nt:aggtcagtatgacct)%7C(nt:aggtcaggatgacct)%7C(nt:aggtcagcatgacct)%7C(nt:aggtcacaatgacct)%7C(nt:aggtcactatgacct)%7C(nt:aggtcacgatgacct)%7C(nt:aggtcaccatgacct)%7C(nt:aggtcaaagtgacct)%7C(nt:aggtcaatgtgacct)%7C(nt:aggtcaaggtgacct)%7C(nt:aggtcaacgtgacct)%7C(nt:aggtcatagtgacct)%7C(nt:aggtcattgtgacct)%7C(nt:aggtcatggtgacct)%7C(nt:aggtcatcgtgacct)%7C(nt:aggtcagagtgacct)%7C(nt:aggtcagtgtgacct)%7C(nt:aggtcagggtgacct)%7C(nt:aggtcagcgtgacct)%7C(nt:aggtcacagtgacct)%7C(nt:aggtcactgtgacct)%7C(nt:aggtcacggtgacct)%7C(nt:aggtcaccgtgacct)%7C(nt:aggtcataatgacct)%7C(nt:aggtcatattgacct)%7C(nt:aggtcatagtgacct)%7C(nt:aggtcatactgacct)%7C(nt:aggtcattatgacct)%7C(nt:aggtcattttgacct)%7C(nt:aggtcattgtgacct)%7C(nt:aggtcattctgacct)%7C(nt:aggtcatgatgacct)%7C(nt:aggtcatgttgacct)%7C(nt:aggtcatggtgacct)%7C(nt:aggtcatgctgacct)%7C(nt:aggtcatcatgacct)%7C(nt:aggtcatcttgacct)%7C(nt:aggtcatcgtgacct)%7C(nt:aggtcatcctgacct)%7C(nt:aggtcacaatgacct)%7C(nt:aggtcacattgacct)%7C(nt:aggtcacagtgacct)%7C(nt:aggtcacactgacct)%7C(nt:aggtcactatgacct)%7C(nt:aggtcactttgacct)%7C(nt:aggtcactgtgacct)%7C(nt:aggtcactctgacct)%7C(nt:aggtcacgatgacct)%7C(nt:aggtcacgttgacct)%7C(nt:aggtcacggtgacct)%7C(nt:aggtcacgctgacct)%7C(nt:aggtcaccatgacct)%7C(nt:aggtcaccttgacct)%7C(nt:aggtcaccgtgacct)%7C(nt:aggtcaccctgacct))?to=49?from=0?snippet=full_search?drilldown=source?get=accession,version,gi,length,symbol,synonym,geneid,division,source,definition&format=json
1.067 | 0.066 | cgi_end;

GGRNA ver.2 by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).

If you use GGRNA in your work, please cite:
Naito Y, Bono H. (2012)
GGRNA: an ultrafast, transcript-oriented search engine for genes and transcripts.
Nucleic Acids Res., 40, W592-W596. [Full Text]