ver.2
Help
|
Advanced search
|
Japanese
Previous release (v1)
2024-05-08 13:44:41, GGRNA : RefSeq release 222 (Jan, 2024)
Summary:
Results:
Matches are highlighted with green background.
Overlapping matches are dark colored.
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 11999
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14680
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14703
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14705
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14750
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14764
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14770
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14777
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14796
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14837
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14963
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15156
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14759
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14774
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14777
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14783
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14792
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14798
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14840
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14877
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14892
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14916
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14933
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14950
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14952
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14958
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14967
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15253
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15277
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15292
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15345
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15366
ccccttgtaagtgccttctgtgtccttgtacccaggccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15382
Data Export:
Maximum 10000 results can be retrieved as Tab-delimited text or JSON format.
Debug Info:
Redirect URI : http://ggrna.dbcls.jp/rn/seq%3aGAGCTTTGCATGTTCCACTAACCTT
lang : en |
div : |
spe : rn |
query_string : seq:GAGCTTTGCATGTTCCACTAACCTT |
format : html |
download :
0.000 | 0.000 | search_start;
0.086 | 0.086 | count_done; http://172.18.8.71:7700/v1/refsub/query?q=(nt:GAGCTTTGCATGTTCCACTAACCTT)?source=Rattus norvegicus (Norway rat)?to=0&format=json
0.167 | 0.081 | search_done; http://172.18.8.71:7700/v1/refsub/query?q=(nt:GAGCTTTGCATGTTCCACTAACCTT)?source=Rattus norvegicus (Norway rat)?to=49?from=0?snippet=full_search?drilldown=source?get=accession,version,gi,length,symbol,synonym,geneid,division,source,definition&format=json
0.171 | 0.004 | cgi_end;
GGRNA ver.2 by
@meso_cacase at
DBCLS
This page is licensed under a
Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).
If you use GGRNA in your work, please cite:
Naito Y, Bono H. (2012)
GGRNA: an ultrafast, transcript-oriented search engine for genes and transcripts.
Nucleic Acids Res., 40, W592-W596.
[Full Text]