ver.2
Help
|
Advanced search
|
Japanese
Previous release (v1)
2024-04-27 00:21:46, GGRNA : RefSeq release 222 (Jan, 2024)
Summary:
Results:
Matches are highlighted with green background.
Overlapping matches are dark colored.
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 12035
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14716
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14739
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14741
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14786
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14800
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14806
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14813
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14832
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14873
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14999
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15192
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14795
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14810
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14813
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14819
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14828
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14834
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14876
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14913
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14928
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14952
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14969
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14986
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14988
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 14994
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15003
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15289
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15313
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15328
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15381
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15402
ccctaaagacccagacccagggcaagagatggacattctggctgggcggggctggagggttctgcagatctgagaattcttctccagaggcccaggggctcttcaagcctgtggaacccctctgggtgctgctgcccaccccactcccagggagccctggccagcccagctgtgctaacataagtacttggccagttacactctcccttccctggccttggtggctcctacccctgcctccaccctctgagtgagctttgcatgttccactaaccttgagctggtgacaggtggagatgccaggcagaacactaacctgaccatgggcgggggccctgcggtgtccgcccctcaataaaagcaattccaaccttca
position 15418
Data Export:
Maximum 10000 results can be retrieved as Tab-delimited text or JSON format.
Debug Info:
Redirect URI : http://ggrna.dbcls.jp/rn/seq%3aAGGTGGAGATGCCAGGCAGAACACT
lang : en |
div : |
spe : rn |
query_string : seq:AGGTGGAGATGCCAGGCAGAACACT |
format : html |
download :
0.000 | 0.000 | search_start;
0.088 | 0.087 | count_done; http://172.18.8.71:7700/v1/refsub/query?q=(nt:AGGTGGAGATGCCAGGCAGAACACT)?source=Rattus norvegicus (Norway rat)?to=0&format=json
0.166 | 0.078 | search_done; http://172.18.8.71:7700/v1/refsub/query?q=(nt:AGGTGGAGATGCCAGGCAGAACACT)?source=Rattus norvegicus (Norway rat)?to=49?from=0?snippet=full_search?drilldown=source?get=accession,version,gi,length,symbol,synonym,geneid,division,source,definition&format=json
0.170 | 0.004 | cgi_end;
GGRNA ver.2 by
@meso_cacase at
DBCLS
This page is licensed under a
Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).
If you use GGRNA in your work, please cite:
Naito Y, Bono H. (2012)
GGRNA: an ultrafast, transcript-oriented search engine for genes and transcripts.
Nucleic Acids Res., 40, W592-W596.
[Full Text]