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2025-10-20 17:41:53, GGRNA.v2 : RefSeq release 232 (Sep, 2025)

LOCUS       NM_001442894            4410 bp    mRNA    linear   VRT 01-SEP-2025
DEFINITION  Danio rerio claudin-3-like (LOC100333863), mRNA.
ACCESSION   NM_001442894
VERSION     NM_001442894.1
KEYWORDS    RefSeq.
SOURCE      Danio rerio (zebrafish)
  ORGANISM  Danio rerio
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
            Actinopterygii; Neopterygii; Teleostei; Ostariophysi;
            Cypriniformes; Danionidae; Danioninae; Danio.
COMMENT     VALIDATED REFSEQ: This record has undergone validation or
            preliminary review. The reference sequence was derived from
            JBMGRA010000015.1.
            
            ##Evidence-Data-START##
            Transcript is intronless :: SRR32588723.3786949.1,
                                        SRR32588722.1962049.1 [ECO:0000345]
            ##Evidence-Data-END##
PRIMARY     REFSEQ_SPAN         PRIMARY_IDENTIFIER PRIMARY_SPAN        COMP
            1-4410              JBMGRA010000015.1  2732425-2736834
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..4410
                     /organism="Danio rerio"
                     /mol_type="mRNA"
                     /strain="Tuebingen"
                     /db_xref="taxon:7955"
                     /chromosome="15"
                     /map="15"
     gene            1..4410
                     /gene="LOC100333863"
                     /note="claudin-3-like"
                     /db_xref="GeneID:100333863"
     exon            1..4410
                     /gene="LOC100333863"
                     /inference="alignment:Splign:2.1.0"
     CDS             87..734
                     /gene="LOC100333863"
                     /codon_start=1
                     /product="claudin-3-like"
                     /protein_id="NP_001429823.1"
                     /db_xref="GeneID:100333863"
                     /translation="
MSFGLELVGIILCVLGWLLAIVACAIPMWRVTAFIGSNIVTAQIIWDGLWMSCVVQSTGQMQCKVYDSMLALSQDLQAARALTVISILLTVLAVLVSIGGAKCTNCIEEESSKAKVMIFGGVLFILAGLMQLIPVSWSANSIIRDFYNPLLPDAQRREMGAGLYIGWAAAALLIMGGSLLCCSCPPQEKKYNPSRMPYPASRSTGGVGYDRRDYV"
ORIGIN      
actccatttgctctgaaattcgtcttgaatcgcaggtgctcaaatttccccgtttactctccagctctggaatttctcagcaagccatgtctttcggattggagctcgtggggattattctatgtgtcttaggctggcttttggctattgtggcctgtgctatcccgatgtggagggtcaccgccttcatcggctccaacatagtgaccgcgcagatcatctgggacggtttgtggatgtcctgcgtggttcagagcaccggacagatgcagtgtaaagtctacgactccatgttggctctgtcccaggacctccaggcggctcgagcgctgaccgtcatatccatccttctgaccgtcctggccgtcttagtgtccatcggaggagccaaatgcacaaactgcatcgaggaagagtcatccaaagccaaagtcatgatcttcggaggggtgctcttcattttggctggtctcatgcagctgattcccgtgtcctggtcggctaatagtatcatcagggacttttataaccctttgctgcctgatgctcagaggcgagagatgggtgccgggttatacattggatgggccgcggccgcacttttaattatggggggatccttgctttgttgctcctgccctcctcaggagaagaaatacaacccgtctaggatgccgtatcccgcatctcgctctacaggtggggtagggtacgacagaagagactacgtgtgaaataaacaaactctttgcctcaattggtgggcatcatttttttcgaggggcgcgggggggggtctaaatatgccatgcattcaacatttgtgtgattgtctaagagttttgatgtttcctcatgtgagtacagtcttaatagtgatgctgttgagtataaattaggactgaatggtaattacatgcatgttttggtaacactttagtatatggctgcattaatgttaacaatgtccatatttagtgactcacaagggtttcttgtttatttatgtttgtgaattgcattatgggatgttgatctctgctttgtccacttttttgatgttgataattcaactctacagttgaacaaagtgacttttattgtctttattacaaggtttttgtagcatagtacacaaaacctgacgctaaatcactctaaactaataaaaatgttaataaaagtcactttttcaaacttttcaaggttaaacgttgttggaaaaagagattaaagtcccataatgcagttcaaaagcattaataaatggggaaaaataaaaatatgaatcacaaaatatggaaaacgctactttacggttattttttttacagtttagttgatgtatttactaacctgaacgtttttattcagttttgttgatgtaatttgataaataaatgttttttttagctcttgctgactcacagtatatgttagcaagaactaaattgaattttaaggatcattcttgggtaaaaagtaatgtgttaccattaaaaaagatgtttaaattgcaaaaaataacatcctttcacatttctaatcttgaaaagtaggtaaataaggagaaaatatgccatgtattctccatcgacttgtttaattatcttgtttgatgttcctcatgtaagttcagtcctaaattagatgttattaagtacaaactgggactaaattgaaatgcatgctttggtaacactttagaatatggctgcattaatgttaacaatgtccatattttgtgactcacaagtgtttcttgtttatttatgtttgtgaattgcattatgggatgttgatctctgctttgtccacttttttgatgttgataattcaactctacagttgaacaaagtgacttttattgacatttattacaaggtttctgtagcatagtacacaaaacctgacgctaaatcactctaaactataaaaaatgttaataaaagtccctttttcaaacttttcaaggttaaacgttgttggaaaaagagattaaagtcccatattgcagttcaaaagcattaataaatgggaaaaataaaaatatgaatcacaaaatatggaaaacgctactttacggtcatttttttacagtttagttgatgtatttactaacctgaacgtatttattcagttttgttgatgtaatttgataaataaatgtttttttagctcttgctgactcacagtatatgttagcaagaactaaattgaattttaaggatcattcttgggtaaaaagtaatgtgttaccattaaaaaagatgtttaaattgcaaaaaataacatcctttcacatttctaatcttgaaaagtaggtaaataaggagaaaatatgccatgtattctccatcgacttgtttaattatcttgtttgatgttcctcatgtaagttcagtcctaaattagatgttattaagtacaaactgggactaaattgaaatgcatgctttggtaacactttagaatatggctgcattaatgttaacaatgtccatattttgtgactcacaagtgtttcttgtttatttatgtttgtgaattgcattatgggatgttgatctctgctttgtccacttttttgatgttgataattcaactctacagttgaacaaagtgacttttattgacatttattacaaggtttctgtagcatagtacacaaaacctgacgctaaatcactctaaactataaaaaatgttaataaaagtccctttttcaaacttttcaaggttaaacgttgttggaaaaagagattaaagtcccatattgcagttcaaaagcattaataaatgggaaaaataaaaatatgaatcacaaaatatggaaaacgctactttacggttattttttttttacagtttagttgatgtatttactaacctgaacgtatttattcagttttgttgatgtaatttgataaataaatgtttttttagctcttgctgactcacagtatatgttagcaagaactaaattgaattttaaggatcattcttgggtaaaaagtaatgtgttaccattaaaaaagatgtttaaattgcaaaaataacataatttcacacttgttatcttgttcctgatgtaatttcagtcgttattgactataaactgggactgaatttaaatgaaatgtgtgttttggtaacaatttacaataatgttgcattagttaatgtatttactgacaggaacagtacatttattacagtatttgttcattattcatcactgtcgacgttaatgaaaataaagatattgttagttcttgctaacacagtgtataatagcaattatgaatttggattttaatgatcagtgttgggtaaaaagtaatatgtcagcagcattaaaaagatgtgtaaatttaaaaataacatacagtaatttcactcttcttatcttaaaaagcaactaagtgagggtaaaataggccatgtattctccatcgacttgtttaattaagttgctggatgttcctgatggaagttcagtcctaaatgtgacgttatggagtacaaagtggaattggttttaaaggaaatgcatgttttggtaacattttacgaagaggttgcattagttaatgtatttactgacatgaacagacaaggaacagtacatttattacagtatctgatcatctttgttgacgttaatgaaaagcaaagttattattagtccttgcgaactcacagtgtagcaagaacaaatgtggattttaatgatgtttcttgggtacaaagtaatatattacagttttaagcctaaaagttaatcttacactttttaaaacatgcaaaaacaacgaaacagacacgttcacatttcttaaaagtaaccaacatattttaaaagtgacaatagatatgagtaattagtaagattagtagatattagatattagtaatgttactgttttcccaacactgttaataatagtaaaggttgagctgtgaataatattaaatgatgtacaaaactgttagaaaatacattaacagcaaaatgaaaccttattatcaagtgtgaccaaagttgtaagctaaacgtgttgaatatagcttcactttagataatttagccgacgttttacatctatttgttctcattccttttatcaatctatctttctttttttaaggattagttgcactaagattttttatctgattcatattttattatggcaaagtcaagttgattgtgtgttcacgatgctaatttaaacatttcattacccttttttattgaatattaggcacaagcagcttttcatgctggattttgttttaattcaatttgttattattgtttatttatacatttttttgctgtagaaatgattacattttgataaccaaattgtttgctaataaattaaaaaagcgcctgtgttcatc
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by @meso_cacase at DBCLS
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Naito Y, Bono H. (2012)
GGRNA: an ultrafast, transcript-oriented search engine for genes and transcripts.
Nucleic Acids Res., 40, W592-W596. [Full Text]