2025-10-20 17:41:53, GGRNA.v2 : RefSeq release 232 (Sep, 2025)
LOCUS NM_001442894 4410 bp mRNA linear VRT 01-SEP-2025 DEFINITION Danio rerio claudin-3-like (LOC100333863), mRNA. ACCESSION NM_001442894 VERSION NM_001442894.1 KEYWORDS RefSeq. SOURCE Danio rerio (zebrafish) ORGANISM Danio rerio Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Actinopterygii; Neopterygii; Teleostei; Ostariophysi; Cypriniformes; Danionidae; Danioninae; Danio. COMMENT VALIDATED REFSEQ: This record has undergone validation or preliminary review. The reference sequence was derived from JBMGRA010000015.1. ##Evidence-Data-START## Transcript is intronless :: SRR32588723.3786949.1, SRR32588722.1962049.1 [ECO:0000345] ##Evidence-Data-END## PRIMARY REFSEQ_SPAN PRIMARY_IDENTIFIER PRIMARY_SPAN COMP 1-4410 JBMGRA010000015.1 2732425-2736834 FEATURES Location/Qualifiers source 1..4410 /organism="Danio rerio" /mol_type="mRNA" /strain="Tuebingen" /db_xref="taxon:7955" /chromosome="15" /map="15" gene 1..4410 /gene="LOC100333863" /note="claudin-3-like" /db_xref="GeneID:100333863" exon 1..4410 /gene="LOC100333863" /inference="alignment:Splign:2.1.0" CDS 87..734 /gene="LOC100333863" /codon_start=1 /product="claudin-3-like" /protein_id="NP_001429823.1" /db_xref="GeneID:100333863" /translation="
MSFGLELVGIILCVLGWLLAIVACAIPMWRVTAFIGSNIVTAQIIWDGLWMSCVVQSTGQMQCKVYDSMLALSQDLQAARALTVISILLTVLAVLVSIGGAKCTNCIEEESSKAKVMIFGGVLFILAGLMQLIPVSWSANSIIRDFYNPLLPDAQRREMGAGLYIGWAAAALLIMGGSLLCCSCPPQEKKYNPSRMPYPASRSTGGVGYDRRDYV"
ORIGIN
actccatttgctctgaaattcgtcttgaatcgcaggtgctcaaatttccccgtttactctccagctctggaatttctcagcaagccatgtctttcggattggagctcgtggggattattctatgtgtcttaggctggcttttggctattgtggcctgtgctatcccgatgtggagggtcaccgccttcatcggctccaacatagtgaccgcgcagatcatctgggacggtttgtggatgtcctgcgtggttcagagcaccggacagatgcagtgtaaagtctacgactccatgttggctctgtcccaggacctccaggcggctcgagcgctgaccgtcatatccatccttctgaccgtcctggccgtcttagtgtccatcggaggagccaaatgcacaaactgcatcgaggaagagtcatccaaagccaaagtcatgatcttcggaggggtgctcttcattttggctggtctcatgcagctgattcccgtgtcctggtcggctaatagtatcatcagggacttttataaccctttgctgcctgatgctcagaggcgagagatgggtgccgggttatacattggatgggccgcggccgcacttttaattatggggggatccttgctttgttgctcctgccctcctcaggagaagaaatacaacccgtctaggatgccgtatcccgcatctcgctctacaggtggggtagggtacgacagaagagactacgtgtgaaataaacaaactctttgcctcaattggtgggcatcatttttttcgaggggcgcgggggggggtctaaatatgccatgcattcaacatttgtgtgattgtctaagagttttgatgtttcctcatgtgagtacagtcttaatagtgatgctgttgagtataaattaggactgaatggtaattacatgcatgttttggtaacactttagtatatggctgcattaatgttaacaatgtccatatttagtgactcacaagggtttcttgtttatttatgtttgtgaattgcattatgggatgttgatctctgctttgtccacttttttgatgttgataattcaactctacagttgaacaaagtgacttttattgtctttattacaaggtttttgtagcatagtacacaaaacctgacgctaaatcactctaaactaataaaaatgttaataaaagtcactttttcaaacttttcaaggttaaacgttgttggaaaaagagattaaagtcccataatgcagttcaaaagcattaataaatggggaaaaataaaaatatgaatcacaaaatatggaaaacgctactttacggttattttttttacagtttagttgatgtatttactaacctgaacgtttttattcagttttgttgatgtaatttgataaataaatgttttttttagctcttgctgactcacagtatatgttagcaagaactaaattgaattttaaggatcattcttgggtaaaaagtaatgtgttaccattaaaaaagatgtttaaattgcaaaaaataacatcctttcacatttctaatcttgaaaagtaggtaaataaggagaaaatatgccatgtattctccatcgacttgtttaattatcttgtttgatgttcctcatgtaagttcagtcctaaattagatgttattaagtacaaactgggactaaattgaaatgcatgctttggtaacactttagaatatggctgcattaatgttaacaatgtccatattttgtgactcacaagtgtttcttgtttatttatgtttgtgaattgcattatgggatgttgatctctgctttgtccacttttttgatgttgataattcaactctacagttgaacaaagtgacttttattgacatttattacaaggtttctgtagcatagtacacaaaacctgacgctaaatcactctaaactataaaaaatgttaataaaagtccctttttcaaacttttcaaggttaaacgttgttggaaaaagagattaaagtcccatattgcagttcaaaagcattaataaatgggaaaaataaaaatatgaatcacaaaatatggaaaacgctactttacggtcatttttttacagtttagttgatgtatttactaacctgaacgtatttattcagttttgttgatgtaatttgataaataaatgtttttttagctcttgctgactcacagtatatgttagcaagaactaaattgaattttaaggatcattcttgggtaaaaagtaatgtgttaccattaaaaaagatgtttaaattgcaaaaaataacatcctttcacatttctaatcttgaaaagtaggtaaataaggagaaaatatgccatgtattctccatcgacttgtttaattatcttgtttgatgttcctcatgtaagttcagtcctaaattagatgttattaagtacaaactgggactaaattgaaatgcatgctttggtaacactttagaatatggctgcattaatgttaacaatgtccatattttgtgactcacaagtgtttcttgtttatttatgtttgtgaattgcattatgggatgttgatctctgctttgtccacttttttgatgttgataattcaactctacagttgaacaaagtgacttttattgacatttattacaaggtttctgtagcatagtacacaaaacctgacgctaaatcactctaaactataaaaaatgttaataaaagtccctttttcaaacttttcaaggttaaacgttgttggaaaaagagattaaagtcccatattgcagttcaaaagcattaataaatgggaaaaataaaaatatgaatcacaaaatatggaaaacgctactttacggttattttttttttacagtttagttgatgtatttactaacctgaacgtatttattcagttttgttgatgtaatttgataaataaatgtttttttagctcttgctgactcacagtatatgttagcaagaactaaattgaattttaaggatcattcttgggtaaaaagtaatgtgttaccattaaaaaagatgtttaaattgcaaaaataacataatttcacacttgttatcttgttcctgatgtaatttcagtcgttattgactataaactgggactgaatttaaatgaaatgtgtgttttggtaacaatttacaataatgttgcattagttaatgtatttactgacaggaacagtacatttattacagtatttgttcattattcatcactgtcgacgttaatgaaaataaagatattgttagttcttgctaacacagtgtataatagcaattatgaatttggattttaatgatcagtgttgggtaaaaagtaatatgtcagcagcattaaaaagatgtgtaaatttaaaaataacatacagtaatttcactcttcttatcttaaaaagcaactaagtgagggtaaaataggccatgtattctccatcgacttgtttaattaagttgctggatgttcctgatggaagttcagtcctaaatgtgacgttatggagtacaaagtggaattggttttaaaggaaatgcatgttttggtaacattttacgaagaggttgcattagttaatgtatttactgacatgaacagacaaggaacagtacatttattacagtatctgatcatctttgttgacgttaatgaaaagcaaagttattattagtccttgcgaactcacagtgtagcaagaacaaatgtggattttaatgatgtttcttgggtacaaagtaatatattacagttttaagcctaaaagttaatcttacactttttaaaacatgcaaaaacaacgaaacagacacgttcacatttcttaaaagtaaccaacatattttaaaagtgacaatagatatgagtaattagtaagattagtagatattagatattagtaatgttactgttttcccaacactgttaataatagtaaaggttgagctgtgaataatattaaatgatgtacaaaactgttagaaaatacattaacagcaaaatgaaaccttattatcaagtgtgaccaaagttgtaagctaaacgtgttgaatatagcttcactttagataatttagccgacgttttacatctatttgttctcattccttttatcaatctatctttctttttttaaggattagttgcactaagattttttatctgattcatattttattatggcaaagtcaagttgattgtgtgttcacgatgctaatttaaacatttcattacccttttttattgaatattaggcacaagcagcttttcatgctggattttgttttaattcaatttgttattattgtttatttatacatttttttgctgtagaaatgattacattttgataaccaaattgtttgctaataaattaaaaaagcgcctgtgttcatc
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Naito Y, Bono H. (2012)
GGRNA: an ultrafast, transcript-oriented search engine for genes and transcripts.
Nucleic Acids Res., 40, W592-W596.
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