LOCUS       XM_077844779           15048 bp    mRNA    linear   MAM 06-DEC-2025
DEFINITION  PREDICTED: Canis aureus argonaute RISC catalytic component 3
            (AGO3), transcript variant X3, mRNA.
ACCESSION   XM_077844779
VERSION     XM_077844779.1
DBLINK      BioProject: PRJNA1372771
KEYWORDS    RefSeq.
SOURCE      Canis aureus (golden jackal)
  ORGANISM  Canis aureus
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
            Mammalia; Eutheria; Laurasiatheria; Carnivora; Caniformia; Canidae;
            Canis.
COMMENT     MODEL REFSEQ:  This record is predicted by automated computational
            analysis. This record is derived from a genomic sequence
            (NC_135623) annotated using gene prediction method: Gnomon.
            Also see:
                Documentation of NCBI's Annotation Process
            
            ##Genome-Annotation-Data-START##
            Annotation Provider         :: NCBI RefSeq
            Annotation Status           :: Full annotation
            Annotation Name             :: GCF_053574225.1-RS_2025_12
            Annotation Pipeline         :: NCBI Eukaryotic Genome Annotation
                                           Pipeline (EGAP)
            Annotation Software Version :: 10.5
            Annotation Method           :: Gnomon; cmsearch; tRNAscan-SE
            Features Annotated          :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA
            Annotation Date             :: 12/03/2025
            ##Genome-Annotation-Data-END##
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..15048
                     /organism="Canis aureus"
                     /mol_type="mRNA"
                     /isolate="CA01"
                     /db_xref="taxon:68724"
                     /chromosome="13"
                     /sex="male"
                     /tissue_type="muscle"
                     /dev_stage="adult"
                     /geo_loc_name="Austria"
     gene            1..15048
                     /gene="AGO3"
                     /note="argonaute RISC catalytic component 3; Derived by
                     automated computational analysis using gene prediction
                     method: Gnomon. Supporting evidence includes similarity
                     to: 1 Protein, and 100% coverage of the annotated genomic
                     feature by RNAseq alignments, including 49 samples with
                     support for all annotated introns"
                     /db_xref="GeneID:144281890"
     CDS             146..2074
                     /gene="AGO3"
                     /codon_start=1
                     /product="protein argonaute-3 isoform X3"
                     /protein_id="XP_077700905.1"
                     /db_xref="GeneID:144281890"
                     /translation="

MISATAFYKAQPVIQFMCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYELLAIREACISLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA"

     misc_feature    173..535
                     /gene="AGO3"
                     /note="PAZ domain, argonaute_like subfamily. Argonaute is
                     part of the RNA-induced silencing complex (RISC), and is
                     an endonuclease that plays a key role in the RNA
                     interference pathway. The PAZ domain has been named after
                     the proteins Piwi,Argonaut, and Zwille; Region:
                     PAZ_argonaute_like; cd02846"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    order(329..331,374..376,416..418,428..430,482..484,
                     503..505,509..511)
                     /gene="AGO3"
                     /note="nucleic acid-binding interface [nucleotide
                     binding]; other site"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    668..1945
                     /gene="AGO3"
                     /note="PIWI domain, Argonaute-like subfamily. Argonaute is
                     the central component of the RNA-induced silencing complex
                     (RISC) and related complexes. The PIWI domain is the
                     C-terminal portion of Argonaute and consists of two
                     subdomains, one of which provides the...; Region:
                     Piwi_ago-like; cd04657"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(1079..1081,1091..1093,1127..1138,1145..1147,
                     1169..1171,1178..1180,1190..1192,1202..1204)
                     /gene="AGO3"
                     /note="5' RNA guide strand anchoring site [active]"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(1283..1285,1289..1291,1499..1501,1913..1915)
                     /gene="AGO3"
                     /note="active site"
                     /db_xref="CDD:240015"
     polyA_site      15048
                     /gene="AGO3"
                     /experiment="COORDINATES: polyA evidence [ECO:0006239]"
ORIGIN      

gaatagatagaggagaaaaaactaatctcagaagccagttaggaggctttttcaatcactagttcaggtttcactctacacgttacttccttgagaagcagtatttgacacctttctcccccccacatccagccatcccccaagaatgatttctgccactgccttctacaaagcacaacctgtaattcagttcatgtgtgaagttcttgacattcataatattgatgagcaaccaagacctctgactgattctcatcgggtaaaattcaccaaagagataaaaggtctgaaggttgaagtgactcattgtggaacaatgagacggaaataccgtgtttgtaatgtaacaagaaggcctgccagtcatcaaacctttcctttacagttggaaaatgggcaaactgtggagagaacagtagcacagtatttcagagaaaagtatactcttcagctcaagtacccacaccttccttgtctgcaagtggggcaggaacagaaacatacctacctgccgctagaagtctgtaatatcgtggcagggcaacgatgtatcaagaagctaacggacaatcagacttccactatgatcaaagcaacagcaagatctgcaccagatagacaagaggaaattagcagattggtaagaagtgcaaattatgaaacagatccatttgttcaagagtttcaatttaaagttcgggatgaaatggcccatgtaaccggacgtgtacttccagcacctatgctgcagtatggaggacggaatcggacagtagcaacaccaagccatggagtatgggacatgcgggggaagcagtttcacacaggagttgagataaaaatgtgggctatagcttgctttgccacacagaggcagtgcagagaagaaatactgaagggtttcacagaccagctgcggaagatttccaaggatgcagggatgcccatccagggccagccttgcttctgcaaatatgcacagggggcagacagcgtggagcccatgttccggcatctcaaaaacacctactctgggctgcagctcattattgtcatccttccaggaaagacgccagtgtatgcggaagtgaaacgtgtaggagatacacttctgggtatggccacacagtgtgtccaagtgaagaatgtaataaaaacatcccctcaaactctctcaaacctgtgcctaaagataaatgttaaactcggagggatcaataatattcttgtacctcatcaaagaccttctgtgttccagcaaccagtgatctttttgggagcagacgtcactcatccaccagctggtgatgggaagaaaccttctattgctgctgttgtaggtagtatggatgcccacccaagcagatactgtgccacagtaagagttcagagaccccgacaggagatcatccaggacttggcctccatggttcgagaacttctcattcagttttataagtcaactcggttcaaacctactcgtatcatcttttatcgggatggtgtttcagagggacagtttaggcaggtattatattatgaactactagcaattcgagaagcctgcatcagtttggagaaagactatcaacctggaataacctacattgtagttcagaagagacatcacactcgattattttgtgctgataggacagaaagggttggaagaagtggcaatatcccagctggaacaacagtcgatacggatatcacacacccgtatgagtttgatttttacctctgtagccatgctggaatacagggtaccagccgtccttcacactatcatgttttatgggatgataactgctttactgcagatgaacttcagctgctaacttaccagctctgccacacttatgtgcgctgtacacgatctgtttctatccctgcaccagcgtattatgctcacctggtggcattcagagccagatatcatctcgtggacaaagaacatgacagtgctgaaggaagtcatgtttcaggacagagcaacgggcgagatccacaagctctcgccaaggctgtacagattcaccaagataccttacgcacaatgtactttgcttaaaaagtccaagaatattctgtgagaggaagaactgaaagatgcatcgacatacagcatatgtttccagttgagtggggatgcctccagccatacagcaaccaacactgtgtggggaccagggtctgatttttatgttgatacaaggaagattgtttacttcatcaaggaacacagcaccattatgcaatatgaaaccagccaactgcttttttgtgcggtctccttaggaagtatcgccattgttttgttttcactttcttgtagtctaacccttttaatgcctttacctcaagttgcttggcagcacaactatctttgcaaaaaaagtaaagaaaaagtaaatgacagtttaaaaaaaaaaaaacacacctacatgaataatcagtgattgttcacgattatgtgtgcaaaaaaattaatgtgcattcgtgtattcttgtaaaaagtatctgtgtatattttaaatatatacatgtatacttcatatgcatatatatctggatctacattgctaatagatatatatgtctgtgcgtgtattttatagttcattccattggggaactttcccttttatcatcttcccaccaccactttgatttttctctctacctccctcgcaacctcatcatctacattttttttcttgatgctaccagtgacattcagatgttcatgtatttagttcatttggatataaagcatggcaaaactagatttttatttttattttgcacatcctactcctgtctcttgtctcatacacaattctaagtcctcaactcttgatactgctttcttaagaaacaaaattattatatatatatatataactgtgtatatatatacatatatatatatatatatatatactgtttctgtgagagtactgtctgccccctcctgctccgaacttacatttgccatttgtgcaatgtgtacataagcagtagcaaccttaaactattctttttctttagtttgttaaagctgctataaatataaaaccttgtcagaagttgtaactcaaaaatttccctctataagtgatgtgtatcctaaaaccttctgtttctatgggttatacatgaaaatcccttatagcttttataaagggcaaatattttaaatgattggaagtctttagggttgaggcctctgaaattgggtggagagagagaaggggttattgaggatttttttaattttaattttttttgctagtttacttgctgcctctcataccttaatgtgattttcatatatatatatttttatatatatgtgtgtatatataaacatatatgtatgtgttttgaagtacagcttccttttcttttatatttattagaatagtgctttaataattagagaactgtattggcaacatcttttatagaaatgtaatcatgtttattttaagaactgacaacttgtttttgctgtcttttagtgcaataagcagttttaaaggaaagctgtgtctgtttgatatctttaccacagatagtgggagaaacaggcacctccataattttaaaagggcaaagtaatacagccttaatttcagaaggaaagttttttgtaatttttcaagtttaaagcatgtcttttaaaaatcaaaatgaaaatgaaggaagttgaatttcctacgtgagtctgacattgaatattagagacagagatgagctttgatttaggaaatgatggtgaataggggcacctggctggctcagtcactagagcatgtgactcttgatcttcgatttgtgagtccaagccgcatgttgggcatggagcctacttacaaaaatagcttaagatttagaagacatttaattctttgaaaatagatcgtgtttattgaacaatcatactggttaggtgcccattttcatttactaaaattaatcaagaaaatgtaaaatgatactttaaaaacatttttttgccaatttatcagcagtgtaactttccttttaaaattagggttatgatggcaaaggaagttaggactttgatcattttaaataagttaaatcactgaaatgtggaaaaagttttataaaacttctgttttattggtttcattcactttaagatattaaaagtattatagagctgtcaaaatcgagttcatcagtaacatggaatcaggggagctttgcactttgtgactcatgaaaattgcattttaatttttttttttttgcactggttcagagtatagatactacagattgtttccagtgggcattgttaaacctttcagaattccatctgcacatgataacaaatggattagttctttagtttctctcttacctataattcgctcttatttgccaatttactgtattttgagcctaaaatctgagcccatgtcctccaacaggtatgaaatctttcgttcctctgccagaaaactaagaaagtactgtattttgtatgtttattattgaagtgtctgaaatgcaatttacaacactgtttcaaagctctttacatgaagtaatatttgtatagtatatacattttttctcccaaccctccccttctcctacaaaaatttcctataaagcatgtatttttttttttacatagaaatttcactaaatatagtcaggaacatgaaaaccgtatatcctagatggtaaaaacttgattgctgtatgttctctcagtatgagtaatataccttcctttaccaatagaagttacacagacttatgtggaaaactgtagggcccagggaagaactgtagatacctttttcctatttactgcttcacctaattttcagttacttagctttccatgtgctagaatgaaacccgtaatttaaatctatttaggacttttaccgaggaaaaaccatttttttaaatataaagctttacctttaaagtaagttcttttttagggt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