LOCUS       XM_055254950           20290 bp    mRNA    linear   PRI 17-JUL-2024
DEFINITION  PREDICTED: Symphalangus syndactylus protein argonaute-3
            (LOC129468935), transcript variant X4, mRNA.
ACCESSION   XM_055254950
VERSION     XM_055254950.2
DBLINK      BioProject: PRJNA946760
KEYWORDS    RefSeq.
SOURCE      Symphalangus syndactylus (siamang)
  ORGANISM  Symphalangus syndactylus
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
            Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
            Catarrhini; Hylobatidae; Symphalangus.
COMMENT     MODEL REFSEQ:  This record is predicted by automated computational
            analysis. This record is derived from a genomic sequence
            (NC_072441) annotated using gene prediction method: Gnomon.
            Also see:
                Documentation of NCBI's Annotation Process
            
            On Mar 6, 2024 this sequence version replaced XM_055254950.1.
            
            ##Genome-Annotation-Data-START##
            Annotation Provider         :: NCBI RefSeq
            Annotation Status           :: Updated annotation
            Annotation Name             :: GCF_028878055.3-RS_2024_07
            Annotation Pipeline         :: NCBI eukaryotic genome annotation
                                           pipeline
            Annotation Software Version :: 10.3
            Annotation Method           :: Gnomon; cmsearch; tRNAscan-SE
            Features Annotated          :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA
            Annotation Date             :: 07/16/2024
            ##Genome-Annotation-Data-END##
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..20290
                     /organism="Symphalangus syndactylus"
                     /mol_type="mRNA"
                     /isolate="Jambi"
                     /db_xref="taxon:9590"
                     /chromosome="12"
                     /sex="male"
                     /cell_line="Jambi"
                     /cell_type="lymphoblastoid"
                     /tissue_type="blood"
     gene            1..20290
                     /gene="LOC129468935"
                     /note="protein argonaute-3; Derived by automated
                     computational analysis using gene prediction method:
                     Gnomon. Supporting evidence includes similarity to: 52
                     long SRA reads, 11 Proteins"
                     /db_xref="GeneID:129468935"
     CDS             10957..12837
                     /gene="LOC129468935"
                     /codon_start=1
                     /product="protein argonaute-3 isoform X4"
                     /protein_id="XP_055110925.1"
                     /db_xref="GeneID:129468935"
                     /translation="

MCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYELLAIREACISLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA"

     misc_feature    10957..11298
                     /gene="LOC129468935"
                     /note="PAZ domain, argonaute_like subfamily. Argonaute is
                     part of the RNA-induced silencing complex (RISC), and is
                     an endonuclease that plays a key role in the RNA
                     interference pathway. The PAZ domain has been named after
                     the proteins Piwi,Argonaut, and Zwille; Region:
                     PAZ_argonaute_like; cd02846"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    order(11092..11094,11137..11139,11179..11181,11191..11193,
                     11245..11247,11266..11268,11272..11274)
                     /gene="LOC129468935"
                     /note="nucleic acid-binding interface [nucleotide
                     binding]; other site"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    11431..12708
                     /gene="LOC129468935"
                     /note="PIWI domain, Argonaute-like subfamily. Argonaute is
                     the central component of the RNA-induced silencing complex
                     (RISC) and related complexes. The PIWI domain is the
                     C-terminal portion of Argonaute and consists of two
                     subdomains, one of which provides the...; Region:
                     Piwi_ago-like; cd04657"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(11842..11844,11854..11856,11890..11901,11908..11910,
                     11932..11934,11941..11943,11953..11955,11965..11967)
                     /gene="LOC129468935"
                     /note="5' RNA guide strand anchoring site [active]"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(12046..12048,12052..12054,12262..12264,12676..12678)
                     /gene="LOC129468935"
                     /note="active site"
                     /db_xref="CDD:240015"
     polyA_site      20290
                     /gene="LOC129468935"
                     /experiment="COORDINATES: polyA evidence [ECO:0006239]"
ORIGIN      

gccatattctgtattgggtggtggatttctttatgatgtgtgtacataaattttatatataattatacatactggtgtctcgaagtaatatttggacatgtattatgatctactggaaaaacctttatatttttattacatttcatttagaaagcctgtagaacttatcttggaatgctggtaaacatgaagcatgcacatgaagccagatttaaaagccctgacgattatctgagcaatcttctattataactcacttttgtccttttaactctaagccaacattttattatgaaatatatattttaagaaagataattctgttggtcatggtgacccacagatgttatacccactgctggtcttagtgtgatgctaattgcattctcgtttttaggtgttttcttacaaaatattttcaagcttatataaaagcagagagagtagtatgatgaactaccatataggtagccattgctcagattgtcagaaatttttctacctttgcataatccgaatacatttcttcctctacagtagtgtttttaaatctaattccagacggcatgttattttgtccctactacttcaatgtgtacctctaaaactgtggatattttcttatagcagcaatgtcattatcatatgtaggaaaattataaacaagcatttatttgtaccctctaatacctgtccataatcagatttccctgattgtctgaaatgtgccttttccttgttagctggttctaatcagaatccaaacaaggtccacacatcacatttgattattgtgtcttttgcgatctagtagtcccatttccttccctgttttcttgtttctttatgccattgacgttttacaaaaactcggccacttgttctgtagaatatgttcaaatctgattttgtctttttgttttcttgtgttattaccttgttcctctgtcccctgtattttctgaaaatgaaagttagcttagaagtttcattccattctggttcaaaatgcttaagtgctttatgtcatgtcatattaggaaacacagtatctagtggtcccaattttagtgattcaaaaatcagtctctaggttcagagattaatcagtagaggcagagatctgtccattgtaaatttcttaattaacctttgaattgctaatgttctgttcactgatcattgtgacccaaattatttatttcactagggattacgaactggtaatttttctgttattctttttgcattaggtggaatttttctgtggaaaagctcagtgtcctattgataattcgtaaatgtttgaaagctttcttgttttcgggcacagcaggatattccttgctcatcttatatttcctgcgcagtacctgaaattagatattcctccaaggatccctggatccttccagattagggtatagtttcctcattttttcagctgcacctaccattgtgtaatatatgattgaggaggggatatataaccagttttctttagatgtatactagggttatttttaactattttctattttacatcattttatgtatattaagatatgtctgtaagataaattcctggaggttagactgatgagttaagggcaaatgtattaatatttgtaatttgtatcattattgccaatcttacatcaatgaacgagagtaccagtttccttatatctttgccactagaatcatcaaactcttagattttcgtcaatcagatttgcaagaaatagttttcttatgtcctcttaatttgtatttgactaccttttcacaaatgtaagggccacttatgtttcttttttaatgaactgttagtttatatcttttgcccttttatttctattggatttttggtcttcttatttactgagaatgctttctaaattaaggaagttagctcttcatctgtcatgagttgcagatattttacctaggttgctatttgtcttttgacgtttggtattgtggaggttttttttttttgccatgcagaagtctgtttgtatgttggtgtatgcacacatacatatgtattggtcagtcacttcttttatgacttttaatatctgataggactagtcctactttctcttttcagggttttccaggccattcttatgtataagctttagaaattccttgtttagtagtgagtgggagaggacagattgttatttttattgagatcctattagatttataaattaagttaggacaaattggcatctttaaggtgttgtcttttctttcaaagaatatactatgtctttctatttgttcaagattactttcattttcaagagttcttaaagctttcttcacataaattttgcacatttcttttttttctttctttcttttcttttttctttcttttttttgagacagagttttgctctggagtacaatggagtgatctcggctcacggcaacctccgcctcccaggttcaagcaactgtgattacaggcatgcaccaccacacccagctaattttgtatttttagtagagatggggtttcaccatgttggtcaggctggtctcgaattcctgacctcaggtgatccacccacctcagcctcccagagtgctgggattacaggcgtgagctactgcacccaggccatttcttgttattccaggatattttctcctttttgttgctattaaatgggtttatagatactaactggttattgcttatatatattcaggcttttgatttctgtatactttctctctttctgtgttattgaattccattattgtttgtggtattttttcaggtgattttattggggcttctaggttataatcatcacctgcaactagtgataagtttacctcttcctttggatttttatacctctaatttttttatcagattatatagactaattggggtgggattaagtagtagtgattaatgtgcgtcctttttctttcttgctctagaagcattaagtattgtatgtatatattgtcatattaaggaatatctgtttcttattttattaagtacgtttatcaagagtatatgttaaattttgtcagatgccttttcagcatctatggagctgatgatgtgatatttctcttatttttaacattgaactaaacagcactcctagattcttttaattgatgctagattctgtttgctaatactttccttttataaattaacatgcaaaagtcagattaatctgcagccttccctttttgtacaatctttgtcaagttttggtaaaacttctaaaacattcagaagttttccattttctaaaatgtgtaacagttttaaaatagtattgatattatcagctcttttatgatttcgtagaattcccctataaaaccttgtgacctgctgttttttatttggtttggtttggtttgctaggtagctgttttaaaactcccctcatttattttgtgaaaatcagtctaataatttatcatacatttaaaaatgactaaaaatataattggattgttggtaacacaaagaaagggtaaatgcttgaggtaacggataccccatttactctgatctgattattatgtattatatgcctgtatcaaaagctcgtgtaacccatagatatatacatctgctatgtacccataaaaattttttttaattaaaaaaaaaaaaaacagtctgttcaggctgtttaggttcacttttggtagctcacatttgactggaaaattattgtattcatatgtaatttaattatacagagttttacaaagtagtttctattgttactatgatttttttttttttgagacagggtcttgctctgtcacccaggctggagtgcagtagtgtaatcttggctcactgcaacctccgcctcccagggtcaagcgatcttcccactacagcctcctgagcagctgggactacagacacatgtcaccacacctggctaatttttgtattttttgtagagacaagatttcaccatgttgcccaggctggtctcgaactcctgggctcaagagatctgcctgccttggcctcccaaagtgcggggattacaggcgtgtgccaccgtgcccggccagtttctattagtttttgaaattctgtgtatttctgtggttttctcagtttgttattttgcatatgtatgctttgttctttttacttttttttcaggtggtgaaattgagtggtatttatttttctccatctttttcaagctttcaacaataagcatctattactttttatcaaaaaactagaaaaaagacgttatggcatcataaatatttattttagaaaacaaaatgtatttattgagtgctttctgattaagaacaaaatatagttaatgaatgctatctgattgtttaattaaatactttaatccttaaccttttttcctatgccctgacttcttttttggtaacatattcttcccaattaatgaattactgaaacctataataaagaatcttttctattattctatctcaggtgtatatttagtacttcagcttaaatacttgaatcaatgaaataaaatcttgatgaactctttctagagaagtaaggtacccaaatttcttgacacaattttttttttttttttttttttgagtttcacccttgtcacccaggctggagtgtagtggctcgatctcaactcactgcaacctctgcctccctggttcaaacgattgttctgcctcagcctcccaagtagctgggattacagatgcgcgccacgacgcccggctaattttttcgtatttttagtagagatggggtgtcaccatgttggtcaggctggtcttgaactcctgacctcaggtgatccgcctgcctcggcctcccaaagtgctaggattacaggcgtgagccactgcacctggcctgaaaacaattttttattaacgtgaaactcactagaaaactctcaagaattgtgttgaagatcatttgaaaatatatctgccaacttcct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