LOCUS       XM_065586283           16719 bp    mRNA    linear   VRT 05-JUN-2024
DEFINITION  PREDICTED: Chrysemys picta bellii argonaute RISC catalytic
            component 2 (AGO2), transcript variant X8, mRNA.
ACCESSION   XM_065586283
VERSION     XM_065586283.1
DBLINK      BioProject: PRJNA1113615
KEYWORDS    RefSeq.
SOURCE      Chrysemys picta bellii (western painted turtle)
  ORGANISM  Chrysemys picta bellii
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
            Archelosauria; Testudinata; Testudines; Cryptodira; Durocryptodira;
            Testudinoidea; Emydidae; Chrysemys.
COMMENT     MODEL REFSEQ:  This record is predicted by automated computational
            analysis. This record is derived from a genomic sequence
            (NC_088792) annotated using gene prediction method: Gnomon.
            Also see:
                Documentation of NCBI's Annotation Process
            
            ##Genome-Annotation-Data-START##
            Annotation Provider         :: NCBI RefSeq
            Annotation Status           :: Full annotation
            Annotation Name             :: GCF_011386835.1-RS_2024_05
            Annotation Pipeline         :: NCBI eukaryotic genome annotation
                                           pipeline
            Annotation Software Version :: 10.2
            Annotation Method           :: Best-placed RefSeq; Gnomon;
                                           cmsearch; tRNAscan-SE
            Features Annotated          :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA
            Annotation Date             :: 05/29/2024
            ##Genome-Annotation-Data-END##
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..16719
                     /organism="Chrysemys picta bellii"
                     /mol_type="mRNA"
                     /isolate="R12L10"
                     /sub_species="bellii"
                     /db_xref="taxon:8478"
                     /chromosome="2"
                     /sex="male"
                     /tissue_type="blood"
                     /dev_stage="adult"
                     /geo_loc_name="USA: Mcleod County, MN"
     gene            1..16719
                     /gene="AGO2"
                     /note="argonaute RISC catalytic component 2; Derived by
                     automated computational analysis using gene prediction
                     method: Gnomon. Supporting evidence includes similarity
                     to: 128 long SRA reads, 7 Proteins"
                     /db_xref="GeneID:101942268"
     CDS             227..2170
                     /gene="AGO2"
                     /codon_start=1
                     /product="protein argonaute-2 isoform X8"
                     /protein_id="XP_065442355.1"
                     /db_xref="GeneID:101942268"
                     /translation="

MMLNIDVSATAFYKAQPVIEFVCEVLDFKSIEEQQKPLTDSQRVKFTKEIKGLKVEITHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQQESGQTVECTVAQYFKDRHKLVLRYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIRATARSAPDRQEEISKLMRSASFNTDPYVREFGIMVKDEMTDVTGRVLQPPSILYGGRNKAIATPVQGVWDMRNKQFHTGIEIKVWAIACFAPQRQCTEVHLKSFTEQLRKISRDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYAGLQLVVVILPGKTPVYAEVKRVGDTVLGMATQCVQMKNVQRTTPQTLSNLCLKINVKLGGVNNILLPQGRPPVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPNRYCATVRVQQHRQEIIQDLAAMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFQQVLHHELLAIREACIKLEKDYQPGITFIVVQKRHHTRLFCTDKNERVGKSGNIPAGTTVDTKITHPSEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNRFSSDELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHTSGQSNGRDHQALAKAVQVHQDTLRTMYFA"

     misc_feature    269..631
                     /gene="AGO2"
                     /note="PAZ domain, argonaute_like subfamily. Argonaute is
                     part of the RNA-induced silencing complex (RISC), and is
                     an endonuclease that plays a key role in the RNA
                     interference pathway. The PAZ domain has been named after
                     the proteins Piwi,Argonaut, and Zwille; Region:
                     PAZ_argonaute_like; cd02846"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    order(425..427,470..472,512..514,524..526,578..580,
                     599..601,605..607)
                     /gene="AGO2"
                     /note="nucleic acid-binding interface [nucleotide
                     binding]; other site"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    764..2041
                     /gene="AGO2"
                     /note="PIWI domain, Argonaute-like subfamily. Argonaute is
                     the central component of the RNA-induced silencing complex
                     (RISC) and related complexes. The PIWI domain is the
                     C-terminal portion of Argonaute and consists of two
                     subdomains, one of which provides the...; Region:
                     Piwi_ago-like; cd04657"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(1175..1177,1187..1189,1223..1234,1241..1243,
                     1265..1267,1274..1276,1286..1288,1298..1300)
                     /gene="AGO2"
                     /note="5' RNA guide strand anchoring site [active]"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(1379..1381,1385..1387,1595..1597,2009..2011)
                     /gene="AGO2"
                     /note="active site"
                     /db_xref="CDD:240015"
     polyA_site      16719
                     /gene="AGO2"
                     /experiment="COORDINATES: polyA evidence [ECO:0006239]"
ORIGIN      

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