LOCUS       XM_055095460           29595 bp    mRNA    linear   PRI 06-MAR-2024
DEFINITION  PREDICTED: Pan paniscus argonaute RISC catalytic component 3
            (AGO3), transcript variant X4, mRNA.
ACCESSION   XM_055095460
VERSION     XM_055095460.2
DBLINK      BioProject: PRJNA950461
KEYWORDS    RefSeq.
SOURCE      Pan paniscus (pygmy chimpanzee)
  ORGANISM  Pan paniscus
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
            Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
            Catarrhini; Hominidae; Pan.
COMMENT     MODEL REFSEQ:  This record is predicted by automated computational
            analysis. This record is derived from a genomic sequence
            (NC_073249) annotated using gene prediction method: Gnomon.
            Also see:
                Documentation of NCBI's Annotation Process
            
            On Mar 6, 2024 this sequence version replaced XM_055095460.1.
            
            ##Genome-Annotation-Data-START##
            Annotation Provider         :: NCBI RefSeq
            Annotation Status           :: Full annotation
            Annotation Name             :: GCF_029289425.2-RS_2024_02
            Annotation Pipeline         :: NCBI eukaryotic genome annotation
                                           pipeline
            Annotation Software Version :: 10.2
            Annotation Method           :: Best-placed RefSeq; Gnomon;
                                           cmsearch; tRNAscan-SE
            Features Annotated          :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA
            Annotation Date             :: 02/27/2024
            ##Genome-Annotation-Data-END##
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..29595
                     /organism="Pan paniscus"
                     /mol_type="mRNA"
                     /db_xref="taxon:9597"
                     /chromosome="1"
                     /sex="male"
                     /cell_line="PR00251"
                     /cell_type="fibroblast"
                     /dev_stage="adult"
     gene            1..29595
                     /gene="AGO3"
                     /note="argonaute RISC catalytic component 3; Derived by
                     automated computational analysis using gene prediction
                     method: Gnomon. Supporting evidence includes similarity
                     to: 398 long SRA reads, 12 Proteins"
                     /db_xref="GeneID:100968913"
     CDS             10969..12849
                     /gene="AGO3"
                     /codon_start=1
                     /product="protein argonaute-3 isoform X3"
                     /protein_id="XP_054951435.1"
                     /db_xref="GeneID:100968913"
                     /translation="

MCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYELLAIREACISLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA"

     misc_feature    10969..11310
                     /gene="AGO3"
                     /note="PAZ domain, argonaute_like subfamily. Argonaute is
                     part of the RNA-induced silencing complex (RISC), and is
                     an endonuclease that plays a key role in the RNA
                     interference pathway. The PAZ domain has been named after
                     the proteins Piwi,Argonaut, and Zwille; Region:
                     PAZ_argonaute_like; cd02846"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    order(11104..11106,11149..11151,11191..11193,11203..11205,
                     11257..11259,11278..11280,11284..11286)
                     /gene="AGO3"
                     /note="nucleic acid-binding interface [nucleotide
                     binding]; other site"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    11443..12720
                     /gene="AGO3"
                     /note="PIWI domain, Argonaute-like subfamily. Argonaute is
                     the central component of the RNA-induced silencing complex
                     (RISC) and related complexes. The PIWI domain is the
                     C-terminal portion of Argonaute and consists of two
                     subdomains, one of which provides the...; Region:
                     Piwi_ago-like; cd04657"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(11854..11856,11866..11868,11902..11913,11920..11922,
                     11944..11946,11953..11955,11965..11967,11977..11979)
                     /gene="AGO3"
                     /note="5' RNA guide strand anchoring site [active]"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(12058..12060,12064..12066,12274..12276,12688..12690)
                     /gene="AGO3"
                     /note="active site"
                     /db_xref="CDD:240015"
     polyA_site      29595
                     /gene="AGO3"
                     /experiment="COORDINATES: polyA evidence [ECO:0006239]"
ORIGIN      

gaagtaatatttggacatgtattatgatctactggagaaacctttatatttttattacatttcatttagaaagcctgtagaatttaccttggaatgctgctaaacatgaagcaagcacatgaagacagatttaaaagccctgatgattatctgagcaatcttctattataactcacttttgcccttttaactctaagccaacattttattatgaaatatatattttaagaaagataattctgttgggcatggtgacccccagatgttatacccactgctggtcttaatgtgatgctaattgcattcttgtttttaggtgttttcttacaaaatattttcaagcttatgtaaaaacagagagagtagtattatgaactaccacataggtagccattactcagattgtcagaatttttctacctttgcataatccgagtacatttcttcctctacagtagtgtttttaaatctaattccagacagcatgttattttatccctattacttcaatgtgtacctctaaaactatggatattttcttatagcagcaatggcattatcatatgtaggaaaattataaacaagcatttatttgtaccatctaatacctgtccacaatcagatttccctgattgtctgaaatatgcctttttcttgttagctggttctaatcagaatccaaacaagatccacacatcacatttgattattgtgccttttgcaatctagtagtcccatttccttccctgttttcttatttctttatgccattgacattttacaaaaactgggtcacttgttctgtagaatatgttcaaatctgattttgtctttttgttttcttgtgttattaccttgttcctctatcccctgttttttctgaaaatgaaagttagcttagaagtttcattccattctggttcaaaatgcttaagtgctttatgtcgtgtcatattaggaaacacagtatctagtggtcccaattttagtgattcaaaaatcagtctctaggttcagagattaatcagtagattcagagatctctctattgtaaatttcttaattaacctttgaattgctaatgttctgttcactgatcgttgtgacccaaattatttatttcactagggattacgaactggtaatttttctgttattctttttgcattaggtggaatttttctgtggaaaagctcagtgtcctattgaaaattagtaaatgtttgaaagctttcttgctttcgggcacagcaggatattccttgctcatcttatatttcctgcccagtacctgaaattagacattcctccaaggatccctggatccttccagattagggtatagtttcctcattttttcagctgcacctaccattgtgtaatatatgattgaggaggggatatatttaaccagttttctttagatgtatactagggttatttttaactgttttctattttacatcattttatgtatattaagatatgtctgtaagataaattcctggaggttagactgatgagttaagggcaaatgtattaatatttgtaatttgtatcattgttgccagattgcactccatagagatagtaaatattttgcatcaatgaatgagagtaccagtttccttatatctttgccactagaatcatcaaactcttagattttcttcaatcagatttgcaagaaacagttttcttgtgtcttcttaatttgtatttgactaccttttcacaaatataagggccacttgtgtttcttttttaatgaactgttagtttatatcttttgcccttttttttctattggatttttcgtcttcttatttactgagaatgctttctaaattaaggaagttagctgttcatctgtcatgagttgcagatattttacctaggttgctatttgtcttttgacctttggtattgtgatgttttttttgtttgtttttgtttttgccatgcagaagtttgtttgtatgttggtgtgtgcacacatacatatgtattggtcagtcatttcttttatgacttttaatatctgataggactagtcccatttttctcttttcagggttttccagaccattcttatgtataagctttaggaattccttgtttagatccagtgagtgggagaggacagattgttatttttattgagatcctattagatttataaattaagttaggacaaattggcatatttaaggtgttgtcttttctgtcaaagaatatactatgtctttctatttgttaaagattactttcattttcaagagatcttaaagcttcacataaattttgcacatttctttttttttttctttcttttcttttttctttcttttttttgagacagagtttcgctctggagtacaatggagtgatctcggctcacggcaacctccgcctcccaggttcaagcaattctcatgcctcagcctcccaagcaactgtgattacaggcatgcaccaccacacccagctaattttgtatttttaatagagatggggtttcaccatgttggtcaggctggtctcgaactcctgatttcaggtggtccactcacctcagcctcccagagtgctgggattacaggcgtgagccactgcacccaggccatttcttgttattccaggatattttctcctttttgttgctattaaatgggtttatagatactaactggttattgcttatatatattcaggcttttgagttctgtatactttctctctttctgtgttattgaattccattattgtttgtggtattttttcaagcgattttattggggcttctaggttataatcatcacctgcaactagtgataagtttacctcttcctttggatttttatacctctaatttttttatcagattatatagactaattagacagggtaggattaaatagtagtgattaatgtgcgtcctttttctttcttgctctagaagcattaagcattgtatgtatacattgtcatattaaggaatatctgtttcttattaagtacgtttatcaagagtgtgttaaattttgtcagatgccttttcagcatctatggagctgatgatgtgatatttctcttatttttaacaaacattgaaccaaaccaggactcctagactcttttaattgatgctggattctgtttgctaatactttccttttataaattaacatgcaaaagtcatattaatctgcagccttccctttttgtacaatctttgtcaagttttggtattatttcctaaaaaattcagaagttttccattttctaaaatgtataacagttttaaaatagtattgatattatcagctcttttatgatttcgtagaattcccctataaaaccttgtgacctgctgttttttgtttggtttggtttggtttgctaggtagctgttttaaaacttccctcatttattttgtgaaaatcagtctaataatttatcgtacaattaaaaatgactaaaaatataattggattgttggtaacataaaggataaatgcttgaggtaatggataccccatttaccctgatctgattattatgcattatatgcttgtatcaaaagctcgtgtaacccatagatatatacatccagtatgtacccataaaaattttttttaattaaaaaaaaagtctgttcaagctgtttaggttcacttttggtagctcacattttactggaaaattattttattcatatgtaatttaattatacagagttttacaaagtagtttctatcgttattatgattttttttttttttttttgagacagggtcttgctctgtcacccaggctggagtgcagtggtgtaatcttggctcactgcaacctccacctcccagggtcaagtgatcttcccactacagcctcctgagcagctgggactacagacacatgttaccacacctggctaatttttgtattttttgtagagacaagatttcaccatgttgcccaggctggtctcgaactcctggtctcaagagatctgcctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgtgccaccgtgcccggctagtttctattagtttttgaaattctgtgtatttttgtgtttttcccagtttgttattttgcatatgtatgctttgttctttttacttttttttcaggtagtgaaattcagtggtatttatttttctccatctttttcaagctttcaacaataagcatctattacttcttatcaaaaaactaaaaaaaagacggtatggcatcataaatatttattttagaaaacaaaatgtatttattgagtgctttctgattaagaacaaagtatagttaatgaatgctgattgtttaattaaatactttaatccttaaccttttttcctatgccctgacttcttttttggtaacatagtcttcccaattaatgaattactgaaacctataataaagaatattttctattattctagctcaggtgtatatttagtacttaaacttaaatacttgaatcaatgaaataaaatcttgatgaactctttctagagaagtaaggtacccaaatttcttgacacaattttttttgagttttgctcttgtcacccaggctggagtgtagtggctcgatctcgactcactgcaacctccgcctccctggttcaagcgattgtcctgcctcagcctcccaagtagctgggattacagatgcatgccacaacacccagctaatttttttctatttttagtagagatggggtttcaccatgttggtcaggctggtctcgaactcctgacctcaggtgatccgcctccctccgccttccaaagtgctgggattacaggcgtggccatcgcacctggcctgaaaacaattttttttttttattaacgttaaactcactaggaaactctcaagaattgtgttgaagatcatttgaaaatatatctgccaacttcctcttccttcctgaagtgtgtttacagacagagcaa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