2025-04-04 05:01:52, GGRNA.v2 : RefSeq release 228 (Jan, 2025)
LOCUS XM_055936799 5410 bp mRNA linear VRT 08-MAY-2023 DEFINITION PREDICTED: Salvelinus fontinalis uncharacterized LOC129864137 (LOC129864137), transcript variant X1, mRNA. ACCESSION XM_055936799 VERSION XM_055936799.1 DBLINK BioProject: PRJNA962531 KEYWORDS RefSeq. SOURCE Salvelinus fontinalis (brook trout) ORGANISM Salvelinus fontinalis Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Actinopterygii; Neopterygii; Teleostei; Protacanthopterygii; Salmoniformes; Salmonidae; Salmoninae; Salvelinus. COMMENT MODEL REFSEQ: This record is predicted by automated computational analysis. This record is derived from a genomic sequence (NC_074674) annotated using gene prediction method: Gnomon. Also see: Documentation of NCBI's Annotation Process ##Genome-Annotation-Data-START## Annotation Provider :: NCBI RefSeq Annotation Status :: Full annotation Annotation Name :: GCF_029448725.1-RS_2023_04 Annotation Pipeline :: NCBI eukaryotic genome annotation pipeline Annotation Software Version :: 10.1 Annotation Method :: Gnomon; cmsearch; tRNAscan-SE Features Annotated :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA Annotation Date :: 04/27/2023 ##Genome-Annotation-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 1..5410 /organism="Salvelinus fontinalis" /mol_type="mRNA" /isolate="EN_2023a" /db_xref="taxon:8038" /chromosome="10" /sex="female" /tissue_type="heart" /dev_stage="smolt" gene 1..5410 /gene="LOC129864137" /note="uncharacterized LOC129864137; Derived by automated computational analysis using gene prediction method: Gnomon." /db_xref="GeneID:129864137" CDS 193..3003 /gene="LOC129864137" /codon_start=1 /product="uncharacterized protein LOC129864137 isoform X1" /protein_id="XP_055792774.1" /db_xref="GeneID:129864137" /translation="
MIGGVVVMVILIGVVVMVIMIGGVVMVILIGGVVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVVMVIMLGGVVMMVIMIGVVVMVIMIGGVVMVILIGGVVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVVMVILIGGVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVMVILIGGVVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVMVIMLGGVVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVVMVIMIGVVMVIMIGGVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVMVIMIGGVVMVIMIVGVVVMVIMIGGVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVVMIIMIGGVVVMVILIGGVVVMVMIGGVVVMVILIGGVVVMVIMIGVVVMIIMIGGVVMVIMIGGVVMVIMIGGVVMVIMIGGVVVMVIMISGVVMVIMIGGVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVVTVIMIGDVVVMVIMIGDVVVMVIMIGVVVMVIMIGVVVMVILIGGVVVMVILIGGVVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVMVILIGGVVVMVIMIGVVVMVIMIGGVVVMVIMIGVVVMVIMIGGVVMVIMIGGVVMVIMIGVVVMVIMIGGVVVMVIMIGVVVMVIMIGGVVMVIMIGGVVMMVIMIGGVVMVIMIGGVVVVIMIGGVVVMVILIGGVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVMMVIMIGGVVVMVIMIGGVVMMVILIGGVVVMVILIGGVVMMVIMIGGVVMMVIMIGGVVMVIMIGGVVVVIMIGGVVMVIMIGGVVVMVILIGGVVMVIMIGGVVVMVIMIGGVVMMVIMIGGVVVMVIMIGGVVMVILIGGVVVMVVIMIGGVVMVILIGGVVMMVIMIGGVVMMVIMIGGVVMVIMIGGVVMVIMIGGVVMMVIMIGVVVMVILIGGVVVLVIMIGGVVVM"
ORIGIN
ttctcaagttagtgtgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgaagaagaagatagttgtggtggtgatgaatattggtgtagtgatgaatattggtgtagtgatgaatattggtgtggtgatgatgatgatgataggtggtgtggtgatggtgataatgataggtggtgtggtgatggtataatgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtgttgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgttaggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtgttgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgttaggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtgataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgatagttggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatgataataatgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaatgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtgtggtggtgatgataataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataagtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgacggtaataatgataggtgatgtggtggtgatggtaataatgataggtgatgtggtggtgatggtaataatgataggtgtggtggtgatggtaataatgataggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgattggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtgataatgataggtggtgtggtggtggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtgatggtgataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtgataatgataggtggtgtggtgatgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtgataatgataggtggtgtggtggtggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtgatggtgataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtattggtaataatgataggtggtgtggtggtgatgtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatgtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatgtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtaatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgaggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgaggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgaggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtgataatgttaggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtgtggtgatggtaataatgataggtgttgtggtgatggtaataaggataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtgataatgataggtggtgtggtgatgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtgataatgataggtggtgtggtggtggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtgatggtgataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtggtgtggtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtggtgatggtggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaatattgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatggtaataatgataggtggtgtggtgatgatggtaataatgatag
//
by
@meso_cacase at
DBCLS
This page is licensed under a
Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).
If you use GGRNA in your work, please cite:
Naito Y, Bono H. (2012)
GGRNA: an ultrafast, transcript-oriented search engine for genes and transcripts.
Nucleic Acids Res., 40, W592-W596.
[Full Text]