2025-04-04 04:55:18, GGRNA.v2 : RefSeq release 228 (Jan, 2025)
LOCUS XM_032441822 1818 bp mRNA linear VRT 18-FEB-2020 DEFINITION PREDICTED: Coturnix japonica NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2-like (LOC116652677), mRNA. ACCESSION XM_032441822 VERSION XM_032441822.1 DBLINK BioProject: PRJNA314147 KEYWORDS RefSeq; includes ab initio. SOURCE Coturnix japonica (Japanese quail) ORGANISM Coturnix japonica Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Archelosauria; Archosauria; Dinosauria; Saurischia; Theropoda; Coelurosauria; Aves; Neognathae; Galloanserae; Galliformes; Phasianidae; Perdicinae; Coturnix. COMMENT MODEL REFSEQ: This record is predicted by automated computational analysis. This record is derived from a genomic sequence (NW_015439980.1) annotated using gene prediction method: Gnomon. Also see: Documentation of NCBI's Annotation Process ##Genome-Annotation-Data-START## Annotation Provider :: NCBI Annotation Status :: Full annotation Annotation Name :: Coturnix japonica Annotation Release 101 Annotation Version :: 101 Annotation Pipeline :: NCBI eukaryotic genome annotation pipeline Annotation Software Version :: 8.3 Annotation Method :: Best-placed RefSeq; Gnomon Features Annotated :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA ##Genome-Annotation-Data-END## ##RefSeq-Attributes-START## ab initio :: 2% of CDS bases ##RefSeq-Attributes-END## FEATURES Location/Qualifiers source 1..1818 /organism="Coturnix japonica" /mol_type="mRNA" /isolate="7356" /db_xref="taxon:93934" /chromosome="Unknown" /sex="male" /tissue_type="blood" /geo_loc_name="France: Tours, INRA PEAT" gene 1..1818 /gene="LOC116652677" /note="Derived by automated computational analysis using gene prediction method: Gnomon. Supporting evidence includes similarity to: 97% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments" /db_xref="GeneID:116652677" CDS 97..1818 /gene="LOC116652677" /codon_start=1 /product="NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2-like" /protein_id="XP_032297713.1" /db_xref="GeneID:116652677" /translation="
MVPIMTMVMVLMVTMMVIMVILVTLMVILVTLMVILVILVTMMVIMVTMMVIMVTLMVIMVIMLTTMVIMVTLMVIKVIMVIMETMMVILVTMMLIMVTMMVIMVIMVTMMVLMVILVTMMVIMVTMMVIMVILVTMMVIMVTLMVIWVTMMLIMVTMMVTMVTLMVIMATMMVIMVILVTMMVIMVMMMVLMVILVTMMVILVTMMPILVTMMVIMMILVTMMVIMVTLMVILVTMMLIMVTMMAILVTMMVVLVTMMVIMVTLMVLMVILVTMMVIMVTMMVIMVIMVTMMVLMVILVTMMVILVTMILIMVILVTMMVILVTMMVIMVTMMVIMVILVTMMVIMVITVTLMVIIMIMLTTMVIMVTMMVTMVIMVTQMVIKVIMVIMETMMVIMVTMMVIMVTLMVLMVILVTMMVLMVISVTMMAIMVTLMVLMVIMVLMVTMMVLMVTMMVIMVILVTMMVIMVTLMVILVIWVTMMVILVTMMVIMVTLMVIMVIMMVIMVILVTMMVIIVIMMLLMVILVTMMVIMIILVTMMVIMVTMMVIMVTLMVIMVIMMVLMVTALSAVSS"
ORIGIN
taatggtgataatggtgttaatggtgattatggtgttaatggtgataatggtgacatcccccccaggtgacggcgttatccgcagtgatagtaataatggttcccattatgacaatggtgatggtgctaatggtcacaatgatggtgataatggtgatattggtcacactgatggtgatattggtgacactgatggtgatactggtgatattggtcacaatgatggtgataatggtcacaatgatggtgataatggtgacactgatggtgataatggtgataatgctgacaacaatggtgataatggtgacactgatggtgataaaggtgataatggtgataatggagacaatgatggtgatattggtcacaatgatgctgataatggtcacaatgatggtgataatggtaataatggtgacaatgatggtgttaatggtgatattggtcacaatgatggtgataatggtgacaatgatggtgataatggtgatattggtcacaatgatggtgataatggtgacactgatggtgatatgggtcacaatgatgctgataatggtcacaatgatggtgacaatggtgacactgatggtgataatggccacaatgatggtgataatggtgatattggtcacaatgatggtgataatggtgatgatgatggtgttaatggtgatattggtcacaatgatggtgatattggtcacaatgatgccgatattggtcacaatgatggtgataatgatgatactggtcacaatgatggtgataatggtgacactgatggtgatattggtcacaatgatgctgataatggtcacaatgatggcgatattggtcacaatgatggtggtattggtcacaatgatggtgataatggtgacactgatggtgttaatggtgatattggtcacaatgatggtgataatggtcacaatgatggtgataatggtaataatggtcacaatgatggtgttaatggtgatactggtcacaatgatggtgatattggtcacaatgattttgataatggtgatattggtcacaatgatggtgatattggtcacaatgatggtgataatggtcacaatgatggtgataatggtgatattggtcacaatgatggtgataatggtgataacggtgacactgatggtgataattatgataatgctgacaacgatggtgataatggtgacaatgatggtgacgatggtgataatggtgacacagatggtgataaaggtgataatggtgataatggagacaatgatggtgataatggtcacaatgatggtgataatggtgacactgatggtgttaatggtgatattggtcacaatgatggtgttaatggtgatatcggtcacaatgatggcgataatggtgacactgatggtgttaatggtgataatggtgttaatggtgacaatgatggtgctaatggtcacaatgatggtgataatggtgatattggtcacaatgatggtgataatggtgacactgatggtgatactggtgatatgggtcacaatgatggtgatattggtcacaatgatggtgataatggtcacgctgatggtgataatggtgataatgatggtgataatggtgatattggtcacaatgatggtgataatagtgataatgatgttgttaatggtgatattggtcacaatgatggtgataatgattatattggtcacaatgatggtgataatggtcacaatgatggtgataatggtgacactgatggtgataatggtcattatgatggtgttaatggtgacggcgctatccgcagtgagcagctga
//
by
@meso_cacase at
DBCLS
This page is licensed under a
Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).
If you use GGRNA in your work, please cite:
Naito Y, Bono H. (2012)
GGRNA: an ultrafast, transcript-oriented search engine for genes and transcripts.
Nucleic Acids Res., 40, W592-W596.
[Full Text]