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Previous release (v1)
2024-03-29 01:31:32, GGRNA : RefSeq release 222 (Jan, 2024)
Summary:
Results:
Matches are highlighted with green background.
Overlapping matches are dark colored.
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position 786
Synonym: NLTP; NSL-TP; SCOX; SCP-2; SCP-CHI; SCP-X; SCPX
NM_001007250.3 -
Homo sapiens (human) -
NCBI -
UCSC -
RefEx(expression)
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position 907
Synonym: NLTP; NSL-TP; SCOX; SCP-2; SCP-CHI; SCP-X; SCPX
NM_001007100.3 -
Homo sapiens (human) -
NCBI -
UCSC -
RefEx(expression)
tagatttgtttcttaatgggtgtgaccaatcctgtttttcctatgctctgggtgaatagagcctgatggtatactactgctttgcggaattgcatacaactgtgcattacaaagttaatatggtaattatggtctggggtaaaattgagtttcagaataaaattaggaacagtaaaatccaaagaactatgtaaacaaaaaagcttttgttttgcttacaaagtatatttaaggattattctgctgaagattcagtttaagagttttccttgggagaactaagtaagaaacacaatgccaacagctggccagtaattagtgttgtgcacttcatgtcattaatcaatttctcaatagttcttaaaattagtgagattaaaaatctaaaaattttgcatttcatgctatcagaaacagtattttcttcccaaatcaaaataaaagaaatatgatcagagcttgaacacaggcttatttttaaaataaaaatatttttaacatgggtttccttattgaaaaatcagtgtattagtcataaaacaccatcattaagaataattgaacaataaagtttgctttcagatgcagttttcaaattat...
position 916
Synonym: NLTP; NSL-TP; SCOX; SCP-2; SCP-CHI; SCP-X; SCPX
NM_001007099.3 -
Homo sapiens (human) -
NCBI -
UCSC -
RefEx(expression)
tagatttgtttcttaatgggtgtgaccaatcctgtttttcctatgctctgggtgaatagagcctgatggtatactactgctttgcggaattgcatacaactgtgcattacaaagttaatatggtaattatggtctggggtaaaattgagtttcagaataaaattaggaacagtaaaatccaaagaactatgtaaacaaaaaagcttttgttttgcttacaaagtatatttaaggattattctgctgaagattcagtttaagagttttccttgggagaactaagtaagaaacacaatgccaacagctggccagtaattagtgttgtgcacttcatgtcattaatcaatttctcaatagttcttaaaattagtgagattaaaaatctaaaaattttgcatttcatgctatcagaaacagtattttcttcccaaatcaaaataaaagaaatatgatcagagcttgaacacaggcttatttttaaaataaaaatatttttaacatgggtttccttattgaaaaatcagtgtattagtcataaaacaccatcattaagaataattgaacaataaagtttgctttcagatgcagttttcaaattat...
position 2035
Synonym: NLTP; NSL-TP; SCOX; SCP-2; SCP-CHI; SCP-X; SCPX
XM_054338136.1 -
Homo sapiens (human) -
NCBI -
UCSC -
RefEx(expression)
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position 2035
Synonym: NLTP; NSL-TP; SCOX; SCP-2; SCP-CHI; SCP-X; SCPX
XM_005271103.5 -
Homo sapiens (human) -
NCBI -
UCSC -
RefEx(expression)
tagatttgtttcttaatgggtgtgaccaatcctgtttttcctatgctctgggtgaatagagcctgatggtatactactgctttgcggaattgcatacaactgtgcattacaaagttaatatggtaattatggtctggggtaaaattgagtttcagaataaaattaggaacagtaaaatccaaagaactatgtaaacaaaaaagcttttgttttgcttacaaagtatatttaaggattattctgctgaagattcagtttaagagttttccttgggagaactaagtaagaaacacaatgccaacagctggccagtaattagtgttgtgcacttcatgtcattaatcaatttctcaatagttcttaaaattagtgagattaaaaatctaaaaattttgcatttcatgctatcagaaacagtattttcttcccaaatcaaaataaaagaaatatgatcagagcttgaacacaggcttatttttaaaataaaaatatttttaacatgggtttccttattgaaaaatcagtgtattagtcataaaacaccatcattaagaataattgaacaataaagtttgctttcagatgcagttttcaaattat...
position 2033
Synonym: NLTP; NSL-TP; SCOX; SCP-2; SCP-CHI; SCP-X; SCPX
NM_001193600.2 -
Homo sapiens (human) -
NCBI -
UCSC -
RefEx(expression)
tagatttgtttcttaatgggtgtgaccaatcctgtttttcctatgctctgggtgaatagagcctgatggtatactactgctttgcggaattgcatacaactgtgcattacaaagttaatatggtaattatggtctggggtaaaattgagtttcagaataaaattaggaacagtaaaatccaaagaactatgtaaacaaaaaagcttttgttttgcttacaaagtatatttaaggattattctgctgaagattcagtttaagagttttccttgggagaactaagtaagaaacacaatgccaacagctggccagtaattagtgttgtgcacttcatgtcattaatcaatttctcaatagttcttaaaattagtgagattaaaaatctaaaaattttgcatttcatgctatcagaaacagtattttcttcccaaatcaaaataaaagaaatatgatcagagcttgaacacaggcttatttttaaaataaaaatatttttaacatgggtttccttattgaaaaatcagtgtattagtcataaaacaccatcattaagaataattgaacaataaagtttgctttcagatgcagttttcaaattat...
position 2093
Synonym: NLTP; NSL-TP; SCOX; SCP-2; SCP-CHI; SCP-X; SCPX
NM_001193599.2 -
Homo sapiens (human) -
NCBI -
UCSC -
RefEx(expression)
tagatttgtttcttaatgggtgtgaccaatcctgtttttcctatgctctgggtgaatagagcctgatggtatactactgctttgcggaattgcatacaactgtgcattacaaagttaatatggtaattatggtctggggtaaaattgagtttcagaataaaattaggaacagtaaaatccaaagaactatgtaaacaaaaaagcttttgttttgcttacaaagtatatttaaggattattctgctgaagattcagtttaagagttttccttgggagaactaagtaagaaacacaatgccaacagctggccagtaattagtgttgtgcacttcatgtcattaatcaatttctcaatagttcttaaaattagtgagattaaaaatctaaaaattttgcatttcatgctatcagaaacagtattttcttcccaaatcaaaataaaagaaatatgatcagagcttgaacacaggcttatttttaaaataaaaatatttttaacatgggtttccttattgaaaaatcagtgtattagtcataaaacaccatcattaagaataattgaacaataaagtttgctttcagatgcagttttcaaattat...
position 2107
Synonym: NLTP; NSL-TP; SCOX; SCP-2; SCP-CHI; SCP-X; SCPX
NM_001193617.2 -
Homo sapiens (human) -
NCBI -
UCSC -
RefEx(expression)
tagatttgtttcttaatgggtgtgaccaatcctgtttttcctatgctctgggtgaatagagcctgatggtatactactgctttgcggaattgcatacaactgtgcattacaaagttaatatggtaattatggtctggggtaaaattgagtttcagaataaaattaggaacagtaaaatccaaagaactatgtaaacaaaaaagcttttgttttgcttacaaagtatatttaaggattattctgctgaagattcagtttaagagttttccttgggagaactaagtaagaaacacaatgccaacagctggccagtaattagtgttgtgcacttcatgtcattaatcaatttctcaatagttcttaaaattagtgagattaaaaatctaaaaattttgcatttcatgctatcagaaacagtattttcttcccaaatcaaaataaaagaaatatgatcagagcttgaacacaggcttatttttaaaataaaaatatttttaacatgggtttccttattgaaaaatcagtgtattagtcataaaacaccatcattaagaataattgaacaataaagtttgctttcagatgcagttttcaaattat...
position 2165
Synonym: NLTP; NSL-TP; SCOX; SCP-2; SCP-CHI; SCP-X; SCPX
NM_002979.5 -
Homo sapiens (human) -
NCBI -
UCSC -
RefEx(expression)
tagatttgtttcttaatgggtgtgaccaatcctgtttttcctatgctctgggtgaatagagcctgatggtatactactgctttgcggaattgcatacaactgtgcattacaaagttaatatggtaattatggtctggggtaaaattgagtttcagaataaaattaggaacagtaaaatccaaagaactatgtaaacaaaaaagcttttgttttgcttacaaagtatatttaaggattattctgctgaagattcagtttaagagttttccttgggagaactaagtaagaaacacaatgccaacagctggccagtaattagtgttgtgcacttcatgtcattaatcaatttctcaatagttcttaaaattagtgagattaaaaatctaaaaattttgcatttcatgctatcagaaacagtattttcttcccaaatcaaaataaaagaaatatgatcagagcttgaacacaggcttatttttaaaataaaaatatttttaacatgggtttccttattgaaaaatcagtgtattagtcataaaacaccatcattaagaataattgaacaataaagtttgctttcagatgcagttttcaaattat...
position 4706
Synonym: NLTP; NSL-TP; SCOX; SCP-2; SCP-CHI; SCP-X; SCPX
XM_054338135.1 -
Homo sapiens (human) -
NCBI -
UCSC -
RefEx(expression)
tagatttgtttcttaatgggtgtgaccaatcctgtttttcctatgctctgggtgaatagagcctgatggtatactactgctttgcggaattgcatacaactgtgcattacaaagttaatatggtaattatggtctggggtaaaattgagtttcagaataaaattaggaacagtaaaatccaaagaactatgtaaacaaaaaagcttttgttttgcttacaaagtatatttaaggattattctgctgaagattcagtttaagagttttccttgggagaactaagtaagaaacacaatgccaacagctggccagtaattagtgttgtgcacttcatgtcattaatcaatttctcaatagttcttaaaattagtgagattaaaaatctaaaaattttgcatttcatgctatcagaaacagtattttcttcccaaatcaaaataaaagaaatatgatcagagcttgaacacaggcttatttttaaaataaaaatatttttaacatgggtttccttattgaaaaatcagtgtattagtcataaaacaccatcattaagaataattgaacaataaagtttgctttcagatgcagttttcaaattat...
position 4706
Synonym: NLTP; NSL-TP; SCOX; SCP-2; SCP-CHI; SCP-X; SCPX
XM_047427504.1 -
Homo sapiens (human) -
NCBI -
UCSC -
RefEx(expression)
Data Export:
Maximum 10000 results can be retrieved as Tab-delimited text or JSON format.
Debug Info:
Redirect URI : http://ggrna.dbcls.jp/hs/seq%3aAACACAATGCCAACAGCTGGCCAGT
lang : en |
div : |
spe : hs |
query_string : seq:AACACAATGCCAACAGCTGGCCAGT |
format : html |
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0.087 | 0.087 | count_done; http://172.18.8.71:7700/v1/refsub/query?q=(nt:AACACAATGCCAACAGCTGGCCAGT)?source=Homo sapiens (human)?to=0&format=json
0.198 | 0.110 | search_done; http://172.18.8.71:7700/v1/refsub/query?q=(nt:AACACAATGCCAACAGCTGGCCAGT)?source=Homo sapiens (human)?to=49?from=0?snippet=full_search?drilldown=source?get=accession,version,gi,length,symbol,synonym,geneid,division,source,definition&format=json
0.199 | 0.001 | cgi_end;
GGRNA ver.2 by
@meso_cacase at
DBCLS
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Naito Y, Bono H. (2012)
GGRNA: an ultrafast, transcript-oriented search engine for genes and transcripts.
Nucleic Acids Res., 40, W592-W596.
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