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2024-04-16 22:25:04, GGRNA : RefSeq release 222 (Jan, 2024)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with green background. Overlapping matches are dark colored.

Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant 2, mRNA. (7615 bp)
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position 7305
Synonym: Dyna III
NM_001136127.3 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant 1, mRNA. (7627 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccttaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 7317
Synonym: Dyna III
NM_015569.5 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant 4, mRNA. (7645 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccttaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 7335
Synonym: Dyna III
NM_001350204.2 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant 7, non-coding RNA. (7661 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccttaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 7351
Synonym: Dyna III
NR_146559.2 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant X5, mRNA. (7583 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccttaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 7273
Synonym: Dyna III
XM_017000980.2 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant X6, mRNA. (7657 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccctaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 7347
Synonym: Dyna III
XM_054335885.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant X6, mRNA. (7657 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccttaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 7347
Synonym: Dyna III
XM_005245079.2 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant X3, mRNA. (7771 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccctaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 7461
Synonym: Dyna III
XM_054335882.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant X3, mRNA. (7771 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccttaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 7461
Synonym: Dyna III
XM_017000978.2 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant X2, mRNA. (7789 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccctaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 7479
Synonym: Dyna III
XM_054335881.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant X2, mRNA. (7789 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccttaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 7479
Synonym: Dyna III
XM_017000977.2 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant X1, mRNA. (7801 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccctaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 7491
Synonym: Dyna III
XM_054335880.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant X1, mRNA. (7801 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccttaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 7491
Synonym: Dyna III
XM_017000976.2 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant X5, mRNA. (9542 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccctaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 9232
Synonym: Dyna III
XM_054335884.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens dynamin 3 (DNM3), transcript variant X7, mRNA. (21968 bp)
gagtgtttgtcttaagacctgttcatactggtatattggtgagacttctcacttctggttggaggtttcacatatggctcaactcaagtcattaatctctttttaatttttactcttgaattccttaaacttcgctcattatgaaatgttttaaaattatgacaaaaattactctgtctaaccacttgccttgtctgctaccagtttgttaaaaattattccccccaaccagtaattccaccagtactacttgatttgtgttatatttcctatgtacatgtacagcctttgttttgcttgcttgtctatttttactttcccttttttgggtcaaatttttcttttgctttgtttgaagaaggaatatacagaagtaaaatcttgtcttctctgctgattctttaattaatatgagccggatactttccactgtcttcttggcactttcaggatttcttaatgctgatatatggactcttagaatggaatttttgaagaaaaatctcaaagcctgtatcgttcttgaaggtcacatgtacctattgtgaaaatgtgaagctgtatttctgaagctgaaataaattataacatttgaagga
position 21658
Synonym: Dyna III
XM_017000982.3 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)

Data Export:

Maximum 10000 results can be retrieved as Tab-delimited text or JSON format.

Debug Info:

Redirect URI : http://ggrna.dbcls.jp/hs/seq%3aTTGTTTTGCTTGCTTGTCTATTTTT
lang : en | div : | spe : hs | query_string : seq:TTGTTTTGCTTGCTTGTCTATTTTT | format : html | download : 

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0.365 | 0.278 | search_done; http://172.18.8.71:7700/v1/refsub/query?q=(nt:TTGTTTTGCTTGCTTGTCTATTTTT)?source=Homo sapiens (human)?to=49?from=0?snippet=full_search?drilldown=source?get=accession,version,gi,length,symbol,synonym,geneid,division,source,definition&format=json
0.367 | 0.002 | cgi_end;

GGRNA ver.2 by @meso_cacase at DBCLS
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Naito Y, Bono H. (2012)
GGRNA: an ultrafast, transcript-oriented search engine for genes and transcripts.
Nucleic Acids Res., 40, W592-W596. [Full Text]