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2024-04-18 18:36:43, GGRNA : RefSeq release 222 (Jan, 2024)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with green background. Overlapping matches are dark colored.

PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X41, mRNA. (4843 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 4275
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_054373639.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X41, mRNA. (4843 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 4275
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_017020076.3 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant 3, mRNA. (5696 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5128
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
NM_001198915.2 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X40, mRNA. (5771 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5203
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_054373638.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X40, mRNA. (5771 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5203
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_006719159.5 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X37, mRNA. (5878 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5310
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_054373635.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X37, mRNA. (5878 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5310
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_047429763.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X36, mRNA. (5887 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5319
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_054373634.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X36, mRNA. (5887 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5319
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_047429762.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X3, mRNA. (5901 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5333
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_017020057.3 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant 4, mRNA. (5908 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5340
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
NM_001198916.2 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X32, mRNA. (5911 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5343
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_054373630.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X31, mRNA. (5911 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5343
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_054373629.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X32, mRNA. (5911 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5343
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_017020073.3 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X31, mRNA. (5911 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5343
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_047429759.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X30, mRNA. (5917 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5349
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_054373628.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X30, mRNA. (5917 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5349
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_017020072.3 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X33, mRNA. (5920 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5352
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_054373631.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X28, mRNA. (5920 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5352
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_054373626.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X33, mRNA. (5920 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5352
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_017020071.3 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X28, mRNA. (5920 bp)
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position 5352
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_047429757.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X39, mRNA. (5935 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5367
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_054373637.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X39, mRNA. (5935 bp)
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position 5367
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_047429765.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X25, mRNA. (5941 bp)
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PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X20, mRNA. (5953 bp)
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PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X35, mRNA. (5968 bp)
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position 5412
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XM_054373615.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X17, mRNA. (5980 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5412
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_017020063.3 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant 1, mRNA. (5983 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5415
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
NM_003622.4 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X29, mRNA. (5998 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5430
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_054373627.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)
PREDICTED: Homo sapiens PPFIA binding protein 1 (PPFIBP1), transcript variant X26, mRNA. (5998 bp)
agaagtattagaaaaatattctattttttattcagtgctgcgtaattacccatggtagccaaccctacaaaagacaggttttcacaaattgaggtggaggtgggcggttcagtatctgccactggacttgattataaactgtatttgaatatcagtggtattatcttttaagttgtcagcaagttaccaaggtattcattaaagaacttgtaatatcaaattactatttattcataacaattgatttgatgctaataataattttctttaaactctaccattcattatgtggtaactgtattgaacttactttatttggattttattttaatgtgactagatgtcaccacttcaaaaaatcaatttgttcttagaacctggttgaaaataccaggaaactgttacagacgccattttttttttttttgagacggagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaagctccgcctcctgggttcacgccattctcccacctcagcttcccaagcagctgggactacaggtacctgccaccacgcctggctaattttgtttttgtatttttagtaga...
position 5430
Synonym: hSGT2; hSgt2p; L2; NEDSMBA; SGT2
XM_054373624.1 - Homo sapiens (human) - NCBI - UCSC - RefEx(expression)

Data Export:

Maximum 10000 results can be retrieved as Tab-delimited text or JSON format.

Debug Info:

Redirect URI : http://ggrna.dbcls.jp/hs/seq%3aGTGGTAACTGTATTGAACTTACTTT
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GGRNA ver.2 by @meso_cacase at DBCLS
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Naito Y, Bono H. (2012)
GGRNA: an ultrafast, transcript-oriented search engine for genes and transcripts.
Nucleic Acids Res., 40, W592-W596. [Full Text]