LOCUS       XM_019938127           15152 bp    mRNA    linear   MAM 07-MAY-2025
DEFINITION  PREDICTED: Tursiops truncatus argonaute RISC catalytic component 3
            (AGO3), transcript variant X8, mRNA.
ACCESSION   XM_019938127
VERSION     XM_019938127.3
DBLINK      BioProject: PRJNA625792
KEYWORDS    RefSeq.
SOURCE      Tursiops truncatus (common bottlenose dolphin)
  ORGANISM  Tursiops truncatus
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
            Mammalia; Eutheria; Laurasiatheria; Artiodactyla; Whippomorpha;
            Cetacea; Odontoceti; Delphinidae; Tursiops.
COMMENT     MODEL REFSEQ:  This record is predicted by automated computational
            analysis. This record is derived from a genomic sequence
            (NC_047034.1) annotated using gene prediction method: Gnomon.
            Also see:
                Documentation of NCBI's Annotation Process
            
            On May 7, 2025 this sequence version replaced XM_019938127.2.
            
            ##Genome-Annotation-Data-START##
            Annotation Provider         :: NCBI RefSeq
            Annotation Status           :: Full annotation
            Annotation Name             :: GCF_011762595.2-RS_2025_04
            Annotation Pipeline         :: NCBI eukaryotic genome annotation
                                           pipeline
            Annotation Software Version :: 10.3
            Annotation Method           :: Best-placed RefSeq; Gnomon;
                                           cmsearch; tRNAscan-SE
            Features Annotated          :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA
            Annotation Date             :: 04/30/2025
            ##Genome-Annotation-Data-END##
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..15152
                     /organism="Tursiops truncatus"
                     /mol_type="mRNA"
                     /isolate="mTurTru1"
                     /db_xref="taxon:9739"
                     /chromosome="1"
                     /sex="male"
                     /tissue_type="spleen"
                     /geo_loc_name="USA: Baltimore, Maryland"
                     /lat_lon="39.2851 N 76.6083 W"
                     /collection_date="11-Nov-2018"
                     /collected_by="Leigh Clayton, Jill Arnold, Winston Timp,
                     Norah Hilger"
     gene            1..15152
                     /gene="AGO3"
                     /note="argonaute RISC catalytic component 3; Derived by
                     automated computational analysis using gene prediction
                     method: Gnomon. Supporting evidence includes similarity
                     to: 1 Protein"
                     /db_xref="GeneID:101337551"
     CDS             176..2056
                     /gene="AGO3"
                     /codon_start=1
                     /product="protein argonaute-3 isoform X5"
                     /protein_id="XP_019793686.1"
                     /db_xref="GeneID:101337551"
                     /translation="

MCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYELLAIREACISLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA"

     misc_feature    176..517
                     /gene="AGO3"
                     /note="PAZ domain, argonaute_like subfamily. Argonaute is
                     part of the RNA-induced silencing complex (RISC), and is
                     an endonuclease that plays a key role in the RNA
                     interference pathway. The PAZ domain has been named after
                     the proteins Piwi,Argonaut, and Zwille; Region:
                     PAZ_argonaute_like; cd02846"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    order(311..313,356..358,398..400,410..412,464..466,
                     485..487,491..493)
                     /gene="AGO3"
                     /note="nucleic acid-binding interface [nucleotide
                     binding]; other site"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    650..1927
                     /gene="AGO3"
                     /note="PIWI domain, Argonaute-like subfamily. Argonaute is
                     the central component of the RNA-induced silencing complex
                     (RISC) and related complexes. The PIWI domain is the
                     C-terminal portion of Argonaute and consists of two
                     subdomains, one of which provides the...; Region:
                     Piwi_ago-like; cd04657"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(1061..1063,1073..1075,1109..1120,1127..1129,
                     1151..1153,1160..1162,1172..1174,1184..1186)
                     /gene="AGO3"
                     /note="5' RNA guide strand anchoring site [active]"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(1265..1267,1271..1273,1481..1483,1895..1897)
                     /gene="AGO3"
                     /note="active site"
                     /db_xref="CDD:240015"
     polyA_site      15152
                     /gene="AGO3"
                     /experiment="COORDINATES: polyA evidence [ECO:0006239]"
ORIGIN      

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