LOCUS       XM_076488767            8965 bp    mRNA    linear   INV 29-AUG-2025
DEFINITION  PREDICTED: Tachypleus tridentatus copper-transporting ATPase 1
            (ATP7), transcript variant X3, mRNA.
ACCESSION   XM_076488767
VERSION     XM_076488767.1
DBLINK      BioProject: PRJNA1303201
KEYWORDS    RefSeq.
SOURCE      Tachypleus tridentatus (Chinese horseshoe crab)
  ORGANISM  Tachypleus tridentatus
            Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Chelicerata;
            Merostomata; Xiphosura; Limulidae; Tachypleus.
COMMENT     MODEL REFSEQ:  This record is predicted by automated computational
            analysis. This record is derived from a genomic sequence
            (NC_134826) annotated using gene prediction method: Gnomon.
            Also see:
                Documentation of NCBI's Annotation Process
            
            ##Genome-Annotation-Data-START##
            Annotation Provider         :: NCBI RefSeq
            Annotation Status           :: Full annotation
            Annotation Name             :: GCF_004210375.1-RS_2025_08
            Annotation Pipeline         :: NCBI eukaryotic genome annotation
                                           pipeline
            Annotation Software Version :: 10.5
            Annotation Method           :: Gnomon; cmsearch; tRNAscan-SE
            Features Annotated          :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA
            Annotation Date             :: 08/27/2025
            ##Genome-Annotation-Data-END##
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..8965
                     /organism="Tachypleus tridentatus"
                     /mol_type="mRNA"
                     /isolate="NWPU-2018"
                     /isolation_source="Ocean"
                     /db_xref="taxon:6853"
                     /chromosome="2"
                     /tissue_type="muscle"
                     /geo_loc_name="China"
                     /collection_date="2018-02"
     gene            1..8965
                     /gene="ATP7"
                     /note="copper-transporting ATPase 1; Derived by automated
                     computational analysis using gene prediction method:
                     Gnomon. Supporting evidence includes similarity to: 58
                     long SRA reads, 12 Proteins, and 100% coverage of the
                     annotated genomic feature by RNAseq alignments, including
                     20 samples with support for all annotated introns"
                     /db_xref="GeneID:143244321"
     CDS             320..4546
                     /gene="ATP7"
                     /codon_start=1
                     /product="copper-transporting ATPase 1 isoform X1"
                     /protein_id="XP_076344882.1"
                     /db_xref="GeneID:143244321"
                     /translation="

MADYTTSVVAVEGMTCQSCVNTIEKNISSVPGVKSIKVYLGRKEAEITFDNGVITIKELAAQIEDMGFEACPRDAGVSQPTLQDVTLRVQGMTCESCVHNIERHVSLQAGVHTVEVSLQEELARIVYNINETNPQTLLNIVNEMGFTATVSPENTKSTISQKHSSNLASSRNYSSVVKIHIKGMTCQSCVSKIEEHLIKNQGVRNIIVSLEDGLATVKYNPLELTPEQLRNMIEDMGYEATLPSDKTKNVTVCSQDSNSHKMNSDQATGILTVKGMTCMSCVHNIEDHIGKVKGIIGIKVSLQEKAATVQYQPSLISLQQIAEMIDNMGFECEIQDSHKLVMDPWVPRFSHPENALTGCDQTDIGIEKRGPSSNKPKKQYTKILLADGDDLEKCFIRITGMTCASCVAAIEKHLAQLDGVHYVLVALMAQKAEVKFDPAYIMPSQIANAISELGYSASVIEDVSSAQGELELEIHGMTCVSCVHSIESNLIKHPGIISVSIALATQIGKFQFDPEVTGPRDIVDAIKDLGFGASTITDHRRDASYLSQKEEVKKWRNSFLFSLVFGLPSMAVMMYFMGIRMSTGKHDICCLIPGLSTENLFLWILATPVQFIGGRYFYVHAMKAIKHRMANMDVLIMLATNIAYFYSVAVLIYFMIDGADHSPKTFFETPPMLLVFISLGRWLEHIAKGKTSEALAKLISLQATEATLVDLDSDCQIISEKQIDVELVQRGDILKVVPGEKIPVDGRVTYGNSMADESLITGESLPVAKRPGSQVIGGSINQNGMLLISATHIGKDTTLAQIVKLVEEAQTSKAPIQQLADKIAGYFVPSVVAVAVFTLLAWVIVGYNSVEVIRKFHKKGHTEMTDSEIIFQFAFQCALTVLSIACPCSLGLATPTAVMVGTGVGALNGILIKGAEPLEVLHKVKSVVFDKTGTITNGVPVMTRICIFVEEKICPLPKLLALVGTAETNSEHPIAVAITKFVKETLQVQTFGKCEEFSAVPGCGLRCKISNIEPMLKAAEDAEKMVNVGNGSLSPDQQYHIRIGDVVVDHGSSMISNYNSATNLANSLLKSLNGPEQANNSREQRSKSYFVLIGNREWMLRNGLSVNEEVDSIMKEHENKGQTAVLVAIDGAIVCVMAVADTVKPEAHLAVYTLKKMGLDVILLTGDNKKTAAAIAKQVGITRVFAEVLPSHKVMKVEQLQKKGIKVAMVGDGVNDSPALAKANVGIAIANGTDVAVEAADVVLIRNDLLDVVGAIDLSHRTVHRIRLNFLFASIYNLLGIPIAAGVFMPFGLVLKPWMGSAAMAASSVSVVCSSLLLKLYHKPTRQSLQTSEYQETLKKSQLYSSEWDDISVHRGLDDIEMPELKGSMLSTNLSRVLNIVQGGKQISKNGHLLSDDDENMELSPLNC"

     polyA_site      8965
                     /gene="ATP7"
                     /experiment="COORDINATES: polyA evidence [ECO:0006239]"
ORIGIN      

ggtgttagtacttacaggtgtgaaatgggtctgtcctttcgataagttatttatattttacttggaagttgaaggtgaagtttattgagttatttgctgagagattggttgtcacgtgggttgagtaccttctcctgccaggactggaaaggccaacttcaggtgactgaaggctaaactatcgaacaaaaagtcgtcttttcactcatcctggcaagaaagttagaaaggtcgacgcgtacttgttactacacgtgaagcttttaacgagcaacagaagttgggtagagttgattgtgagcaggtgcaagaattcgccatggccgactacacaacgtcagtagttgcagtagaaggtatgacttgtcagtcatgtgtcaacactattgagaaaaatatttcaagcgttcctggggtgaagagtattaaggtttatcttggaagaaaggaagctgaaatcacgtttgataatggggtgatcacaataaaggaattagcagcccaaattgaagacatggggtttgaggcatgtcctcgtgatgctggcgtttcacagccaacactacaggacgtcacgttacgagtacagggtatgacttgtgaatcatgcgttcataacatcgaaagacacgtgtcgttacaggcgggtgtgcataccgtggaagtttctcttcaggaagaattagcaaggattgtatacaatattaatgaaacaaatccacagacgttacttaacatcgttaacgagatgggtttcacggccactgtttctccggaaaatactaaatcaacaatatcacaaaaacattcaagtaatttagcatcttccagaaattattcgtctgttgtgaaaatccacattaagggaatgacatgccagtcctgcgttagtaagatagaagaacatttaattaaaaaccagggagtcagaaatataatagtgtcactagaggatggtttagccactgttaaatataaccccttagaacttacaccagagcaactacggaatatgatagaagacatgggatatgaagccactcttccatcagataaaactaagaatgttactgtgtgtagtcaagatagtaacagtcataaaatgaactctgaccaagctactggaattttaacagtcaaaggtatgacctgtatgtcttgtgttcataatattgaagatcatattggcaaagtgaaaggtatcatcggtattaaagtgtcattacaggagaaagcagctactgttcaatatcagccttctttgataagccttcaacagatagcagaaatgatagacaacatgggatttgaatgtgaaatacaagactctcataagctagtaatggacccatgggtacctcgtttctctcatcctgagaatgctttaactggttgtgaccaaacagacattggaattgagaagagaggaccaagctccaacaaacctaagaaacaatacactaagatactacttgctgacggagatgacttagaaaaatgtttcatccgaataacaggcatgacttgcgcatcatgtgttgctgccatagaaaaacatttagcacagttggatggagtacattatgtgttggttgcacttatggctcagaaggcagaggtgaagtttgatccagcttatatcatgccatctcagatagcaaatgctatttcagaattaggctacagtgcttcagtaatagaagatgtgagctcagctcagggagaacttgaattagagatccatggaatgacatgcgtttcctgtgtacattctattgagagtaatttgataaaacaccctggcatcatctcagtgtccattgctcttgccacacagataggtaaatttcagtttgatcctgaagttacaggccctcgggatattgttgatgctattaaggatttgggctttggtgcttcaactattacagaccacagaagggatgctagttacttatctcaaaaagaagaggtgaaaaagtggagaaattctttcttgttttctcttgtctttggcctcccttctatggcagttatgatgtattttatgggaatacgtatgtcaactggaaaacatgacatatgctgtcttataccagggctgtcaacagaaaatctgtttctatggattctagccacccctgttcagttcataggaggacgatatttttatgttcatgccatgaaagccataaaacacagaatggcaaacatggatgtacttattatgctggccacaaatattgcctacttctatagtgtagcagttctgatttacttcatgatagatggagctgatcacagtccaaaaacattttttgagactccaccaatgcttttggtgtttatttcacttggccgatggttggaacacatagcaaaaggtaagacttctgaggctctagcaaaactgatttctctacaagcaacagaagctacacttgtggatttagactctgattgtcagattatatctgaaaaacaaattgatgtagaacttgttcaacgtggagatattttaaaggtagttcctggtgaaaaaataccagttgatggcagagttacttatggaaattcaatggcagatgaatcacttattacgggagaatctctacctgttgccaaacgtccaggttctcaggttattggaggttctatcaaccaaaatggcatgctacttatcagtgctacccatataggaaaagacacaacattagcccagattgttaaactcgttgaagaagcacagacctcaaaggctccaattcagcaattagcagacaaaatagctggctactttgtaccatctgtggtggcagtggctgtcttcacactattggcatgggttattgttgggtataacagtgtagaagtcatcagaaaatttcacaaaaaaggtcacacagaaatgacagattctgaaattattttccagtttgctttccagtgtgctcttacagtgttatctatagcttgcccatgctctctaggtctagctacacccacagcagtgatggtaggaactggagtaggtgctctaaatggtattcttatcaaaggtgctgagccactagaagtattgcacaaggtgaaaagtgttgtttttgacaaaactgggacaattactaatggtgtacctgtgatgacacgtatttgtatatttgtggaagaaaaaatatgtcctttaccaaaattgcttgcattggttggtacagctgagacaaacagtgaacaccctatagctgtggcaattactaaatttgtgaaagaaacattacaggtacaaacatttggaaaatgtgaagagttttctgctgtacctggttgtggtcttcgatgtaagatatctaacatcgagccaatgttgaaagcagcagaggacgcagagaagatggttaatgttggaaatgggtctttgtcaccagaccaacagtaccacatccgtataggagatgtggtggtggaccatgggagtagtatgataagtaactataatagtgctacaaacttagcaaacagtttactcaaaagtttgaatggtccagagcaagctaacaacagtagagaacaaagaagtaagagctactttgtgctaattggaaacagagagtggatgctcaggaatggtttgagcgtaaatgaagaagtagattcaattatgaaggaacatgaaaacaaagggcaaacagcagtgttagttgccattgatggtgccattgtctgtgtaatggctgtagctgataccgtcaaaccagaagcccatcttgctgtgtacacactgaagaagatgggactagatgtgattctactgacaggagacaacaaaaagactgctgctgctatagccaaacaagttggcatcactcgagtttttgcagaagttcttccatcccacaaggtgatgaaagtggagcagttacagaaaaagggtattaaagtagccatggttggagatggagttaatgattctccggctttagctaaggctaacgtaggaatagctattgctaatggaactgatgtagcagtagaagctgctgatgttgttctcatcaggaatgacttactggatgttgttggagccattgacttatctcacaggacagtccatcgtatccgtctgaatttcctttttgcaagcatttataaccttcttggaattcctattgctgcaggtgtttttatgccatttgggcttgtacttaaaccttggatgggatcggctgcaatggctgcatcttcagtgtctgtagtgtgctcttctttgcttttaaaactctatcataagccaacaagacaaagtcttcagacctctgaataccaagaaacactaaaaaaatcacagctgtattcatctgaatgggatgatatctcagtccatcgaggccttgatgacattgaaatgcctgaacttaaaggatctatgctaagtactaatcttagtcgagtgttaaacattgtacagggaggtaagcaaatatctaaaaatgggcacttgttaagtgatgatgatgaaaacatggaactctctcctcttaactgctaaaaatgtacatataatagctatttaagtgtttaagttcagagttaagcctaatgaaacattgtatttcactgttcatttaccatcagtaatggatttgaatttgtgtattgttgtattttgtcattatgaattggggagaactgaaagctttccttcatatgcagaggaacaagattttcttcatctgatgaaaatgttatttaaataaaaataacctaaaagctactgttgcaaacttttcaaaatattttatggatgtaggatatttcagtttttttgtaatgttatatagtgtgaaataagtgtcatatgatgaaaatatatcctactaatttatatagaaaactataatagatgattctttcttgtcatataacacttaattgagaaaataagcatacattttgtactgatagaaatatagtgaaagtaatttggaagagatagaatacctgaagagattctgttacgaaaccaatcaggggacagaactcccatttttgtaaaagtaatttgaatgtcctactgtacattgaaggatacatgatattgattgctgtatcgattattgtagaaactagtcagttctaaaatattgttttctgttttgtaattaaactaaacagttgtgtttccactaacaaattcatttaagctaattttgcactgtaagttctacttgacaagcttagacctcttttgtgtgaaaatattcatgtttaccattaaacatgttattacataattaatttataactgtagaaaaaacaagtttacttattggtacctcatgttgagggctactctgaaaatataaacagtaggaattcgtattcttacaaagtttattttgttcagtgataagttatggcacacagcttattccagttagacatttgaaatgtgtattgattcagaccagaaatacaaaaaggtggaaagtaatagatttgcatgtcttacatttagttacattttttaatatggtttaaactgcttcttcacttacagaatggctcctgataaacaaatctggcattcatattaagtctcatgatattacagtgatgaaactaagattgatactagccacactgttctggtattaaactgttgtttaacctgtctgttgacaaaattcataattattctacagtgcttttaggtcaatattgcttacagtttaccaggtcacactattatcctctggctggcagtgctaacagtatcactaaaatacacttttatcatttgttggttagcaaagtttctattaggacacctgttgaacttcactaaatagttttttgtttaaaaataacatcatcgagaactgttaaaaaaaaacaacaaacttgctataatgatttgtgactagacaaatgtacttgtgttggtcagagaataacctttttctgaaagcattgaacatctatattgttacctgttagtgtttttaaaaacttagacagttatactgatttttttttaaagttctcacagaagaccattatcttcatttgaattgtcaaaatggctgtacattagaattatttttatctaacaaaattatttgtagcattcacaaattgaagaaaatgaatgagtgtatagatatatcactcaggaattttattttttccccagataacatacaagtattactgtacattgactatgtactaacttattgttccaacattcctggtaagcatagtagataacctgcattaaatatcatacatgatatttgtggcactttagtttccaatttggttttaagtgtaatttttatatttttgttttaaagttaagagattctgagcaatcagactgttggctgttacatgtaatatgaggatctgtcaagtatgtttaagcatatagtaaatattaagtttgatcttctacaagtgaaaacacaaacaaagaatctcagattctttttgttacattgtatttgaataaaatattccattgattaaaaaagtttattaattaacaagttttgtggctgttcatcagaatgttttgttgttgattatttttgctgaaattatgatttgaaaatattcaaggttttgatacagctggaatttaactttattcctgtcctggacattgtacatgattcataagagtttcatatgagtatcatgtgaagctcaaagcccatgtaaatgagaagttggtttcacttgagaaaatacaaatgtaggatacacattttttttgttaatttggtaaagatagcatttgcttttacctacttggctaagtatggtagtcatataagcatacccattaaaaattcaatgacctaaaacagagaaagagttgaaaagtaacctagaaatattatagttacatttcaaaaattatggatatgaatttttggaaaatcccaaaatgcacaatcatcaaagtagaatattagcattaaagtgtcattcatgctaagttctgaagttaaacgaggttacttaaaaatatttttaagaatattccttttttaggtagctctgccatactgaaaaatagttaaaaatgattaggtagttttaaagggcaggtaatgtaaacataatgtatattagtattctgagaaattgatgcacgttaatttctggttaacttgaaagaaaatagctcttaaagtgtgtgaactttctttatctttatacatgcatacaaataatcaaccttggttttcctggttcaattttttttattcaacatatttttgtacacttagaacttctttgtacaaaatatacatacaaacatatgctatataatgagagaatcatgcaccttgattcaaaataaaatatctgctggtggatcagtggcaagcttatgatcttacaccattaaaatccttagtttagttcttcattgttaacagatagcttgttgtacagcttcatgataaaagtctacgacattcaaacgatttaaacttgtaacttgaaagggacattagtcacacatttctggagtggtcgatttagatcagttcagtttttgttttttctttactgttttgttttaagtactttagaggtgtttcttcttgtcagaaactgtttgaaatagtgagtggtcattttgatatttacaaaccagattaaaccattgtcttttctgttgcatattttgaaaaaaatgtttgtattttatacaagaaatagtgaattatttgctgtttttggtaaagccaacttggtcttccatttatttttatgtaatttctgtttcacacatttgttaattattattactacagtagaaaacattaagttgttagtttttgttgtgcaactttgagattaacattcatgataaaaacaaactaaattcctttaatcttttaaattttaaaagactatgttcaacattaatgaggacaaaatgtttttcactgttatctctgctagatttacaggtttttgagaaatggcaaaacatataaaaaaagttatataaaccttaaagatatttcattttgtttatcatgcttgtactcagttgattgcaaaatattatgctttgcagcacaaaggaaaagtgtagttaacaatgtgaagtattgatttttaaaccaatgtttcatattgatttatttttccttgtctcaatttgttggtcagtataattgtggtaattagagtccttatttgtgtaccatgttctttgaaatttataaaaggaaaaaattgtttgttacttttgtgtttccatgtttgtgtgtgtttataatgtagttattgtttcaataccattcacattatgtagctttctctgtggtattcaccgctgttacctatattttttatcagttcttaatatttgtacacagataagcaagtatcatgacactttacattaaaactgataatgatgcaaagatatgtaaaaagttttattacaggcctggattatgtatgtatgcaaatacttgtgttgttatgtgaagtaccagaagataactgtaatacagtttacaactgaattgataactacttgaagaagtagtcagcagttcagtgatgtatgattggtaattttcactctctgtttgaactgtattttaattatttttgcagttaggtcactgatgttagagtgatagattaagtttgaccatttactttttataaatgttgaacttgaaaaaattaacagttagccctaaaatatcttttcattatgtgaaagtgttttcatggactttctcactaatgagaaaacaaaagttaatggaaatgaacctgaagttacagttaatgatcgtatgtttgtgtttggatcttctgtaacatttctaagctgtagtgctaatataattactatattatttttataaagtataacttaaaattattctctgataaataaaagaaaaagtaagataaa

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