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2025-07-03 17:51:09, GGRNA.v2 : RefSeq release 229 (Mar, 2025)

LOCUS       XM_071095581           26126 bp    mRNA    linear   PRI 03-FEB-2025
DEFINITION  PREDICTED: Macaca nemestrina claudin 8 (LOC105472758), transcript
            variant X24, mRNA.
ACCESSION   XM_071095581
VERSION     XM_071095581.1
DBLINK      BioProject: PRJNA1213823
KEYWORDS    RefSeq.
SOURCE      Macaca nemestrina (pig-tailed macaque)
  ORGANISM  Macaca nemestrina
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
            Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
            Catarrhini; Cercopithecidae; Cercopithecinae; Macaca.
COMMENT     MODEL REFSEQ:  This record is predicted by automated computational
            analysis. This record is derived from a genomic sequence
            (NC_092128) annotated using gene prediction method: Gnomon,
            supported by mRNA evidence.
            Also see:
                Documentation of NCBI's Annotation Process
            
            ##Genome-Annotation-Data-START##
            Annotation Provider         :: NCBI RefSeq
            Annotation Status           :: Full annotation
            Annotation Name             :: GCF_043159975.1-RS_2025_01
            Annotation Pipeline         :: NCBI eukaryotic genome annotation
                                           pipeline
            Annotation Software Version :: 10.3
            Annotation Method           :: Best-placed RefSeq; Gnomon;
                                           cmsearch; tRNAscan-SE
            Features Annotated          :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA
            Annotation Date             :: 01/24/2025
            ##Genome-Annotation-Data-END##
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..26126
                     /organism="Macaca nemestrina"
                     /mol_type="mRNA"
                     /isolate="mMacNem1"
                     /db_xref="taxon:9545"
                     /chromosome="4"
                     /sex="male"
                     /tissue_type="blood"
                     /dev_stage="adult"
                     /geo_loc_name="USA: Seattle, Washington"
                     /lat_lon="47.655548 N 122.303200 W"
                     /collection_date="2021-05-12"
                     /collected_by="Washington National Primate Research Center
                     (WaNPRC) at the University of Washington"
     gene            1..26126
                     /gene="LOC105472758"
                     /note="claudin 8; Derived by automated computational
                     analysis using gene prediction method: Gnomon. Supporting
                     evidence includes similarity to: 1 mRNA, 6 Proteins"
                     /db_xref="GeneID:105472758"
     CDS             6314..6988
                     /gene="LOC105472758"
                     /codon_start=1
                     /product="claudin-8 isoform X2"
                     /protein_id="XP_070951682.1"
                     /db_xref="GeneID:105472758"
                     /translation="
MAFYPLQIAGLVLGFLGMVGTLATTLLPQWRVSAFVGSNIIVFERLWEGLWMNCIRQARARLQCKFYSSLLALPPVLETARALMCVAVALSLIALLIGICGMKQVQCTGSNERAKAYLLGTSGVLFILTGIFVLIPVSWTANVIIRDFYNPAVHIGQKRELGAALFLGWASAAVLFIGGGLLCGFCCCNRKKQRYRYPVPGHCVPHTDKRRNMKMPSNTSTSYV"
ORIGIN      
tgggtacctgtaatttcagctactcaggaggctgaaacaggagaatcgcttgaacctgggaggtggagattacattgagctcagattgcgccactgcactccatcctaggtgatagaatgaggctccatctccaaaaaagaaacaaataaacaaacaaaaaaacaaaatagacatacagtaagttgtgagaatgtttgaatgttttctgatttggaaaccctgggggttccaaatagtacttcccctgaagggaagacaaggaaagaggaggatgctttgagtcctaatttttccgttgagatgttatacctctactcctattcatttcaagctgatgctgcaagtaaaaccaacacatttttacaaaggaaaacaaaaaactcctcaacctaaattagattccctaagacctcagtacaagtcttaggaggacataagaatacaattagtcaacagcccttattagcagattcatctcactgattgtgatctaatcagagacaatttgtggatgggatggaggttatggattcttgcatatgtgtacagccctgattgtccctaagtgctccaaaacatctaattcctataaattattttctggtatggctcacaggcagctcagacttcacatctaaaaagtgaacccttaatctttttctaaaaggtcactcaaccttcaatgtctcacatcatggtaaacgcaaccccgagtacaatgatgctcatgtcaacaatacaacaggcatctctgaaaccttcccctacctccagtccatcacccactttcaccaattgtagctcctctacacagtgtaaagccatccactcctacattgcccctactcaatccagcttctatcatctctcacttggactatcgcaataaccttctaaatggtttcttcgtgttcagttttgttctttctaattaatttctccaaaatagccatagccatattgttttggtggttggtgttttctctgttttttttttttttttttttttttgatacagagtcttgctgtcactcaggctggagtacagtgctgcaatctcggctcactacaaccatcgcctcccggattcaagcgattctcctgcctcagcctcctgagtagctaggattacaagcacatgccaccacaaccagctaattttcatatttttagtagagatggggtttcaccatgttggtcaggctggtctcgaactcctgacctcatgatctgcccacctcggcctcccagagtgctgggattacaggtatgagccaccgtgtatagctcttttcttgttttttaagcagacttgagtcttgattgtgtgagtcccatgctgaaaatctctaactggctttgcattgctcttaggagattattacatggtttacattgtttgcatatctggaccttgtctacatttgcaacgtcatctcaattatctcactctcctcggggttggtcttccacttgcattagacccaaactctctttgcctgcagtgcccttacccagatggtctcttgtgcccagaattctctttctctcactctttgttgagttatctggctaattcctactcaagcttcaggttgcagtttaaatgttgttttatcagagtgcccttccttcattagagaactcttagttaaagttaaaatcatttctgtttataccctatatattttaaccatagctataccttaatgtttaataatatatattttggcaattgcatgtttagtatttatcatgcttactaaaatgtaagctccgtgaaggcatggaatggagtcatggtcagaggctaagttttaaagttgggcagaggtcattcaaaaattggtctctcacgtcatgctaaggaatttggatcttattttacaggcaatagagaaataatgaaaaattttaagtaaggtcttaggtggcatgtatagagtttgatcctgcaaggttttattgttcttcaatagaaaatgaatcagaaagtagtaaggacgggcaaaggcaaggagattaggtaagacattcttgaaatggtacagatgaggcatgtcaaaggactgaattaagacacagcatagaacagaaaacatatttaatccatttgaataaggtgtcaatcaatggttgggttccctgagcacgagactctgaggcagagattagtgtgcattatgtttattataagatcaacaccttaggaaaagaaggcaaggaagaggattggccatatagagaagtttagttgggatgccgggctaatgaaggccttagcagaccacacagtgagctctggagctagaatagcccctgagtgttaaccccatggggctaacagggctagttgtcaggaccatattgatgagtcactggatatgggctacatctatgaatggggaataatttgagtgacatgcctatttccaggtaatacctgaatggggctgagagctgggggtgttctgcccatagcactctaagcagctgaaagagatatctgggtggaacatcacagtgtccactctaggcatgtatttattaaagaataagaaagaaaaattagctgagaatgacagacagaaacaggcctgggctaaatacaacagattcagaacttgcagcctgacaggaggtaggcaatgctgtgcagacataggtgaggtgccttagggagagtgtgctgagtgagaagagtactgaggtgtatcagcaagtctggaagaaaacaaacaaaacaaacatggcgaagggcacctagagaaagaagagagagaatgcgtctgtggagaagtagtaaggacgataatacaacaaatactaatgagacaaatattaacagaaaaactttcctgggtgtttgctcaggaccggttctttgcacacattccatttaatcttcaaggcagccctgtgagtttgatgttatgattatcctgatttcatagaccaggcacttttgttgggggagggagttcaaaaacatgcctgagatggatggctaaggcatcaagcctagagtgaaccaagtctctctccagagcacacgcccttcactgtctctcgttggatgacagtggtttgttgtgacttttactgaaacatcaataagcagaaatatggaagtgtttttgtaaagatagtagttaggacgtccaagaagtctgtaacatttctaggaaggttttcgtggatcacatgatgactaaaggccgatttcaatgtgtatagcagtgggaaatgtgagagaggaccaaaagatgtgtagagacacatggcaaggaatacagatctggcaagatggaattttattttattatttttatttatttctattatatttttataatttcaacttttattttacaataaaataaaagttactatagaggctgaagcaggagaatcatttgaacactggaggtggagattgcacatgtgtaagtcgtttactgatgctgagatctgggtgtgaatgatcccatcacctagatagcgagcatagtacccagtcgttggcttttcaacccttatctccctcttcccttccctctctagtagtccccagtgtctgttgctgccatctttatctccaagtgtccctgatgtttagctctcacttataggtgaaaacatgcgagatttggttttctgtttctgtattaattcacttagtataatggcctcagctgcatccatgttgctgtaaatgacaggatataattattttatatggctgcatagtattccatgatgtatacattccaagatggagttttaaaatagaagaaaattgagtatgtttattttctaagggactcctcagagagagggagaaggtgtcagtgcaatgaaaggaggaagtgatcaatagagcaagtcccactgaggaggtagaaggggatgagattcatagaaaggttggagaggaaagcagtatcttcccctaaatacaaaggagagaaagttaaaatgtttttaacaatcggctttgtctgtgagaggcaaagaccaagaactcctacgttatttatgtttttcaggttattcatttcttgggggttgggaatagggtctcactctgttgcccaggctggagtgcagtaaagcaatcacagttcactgcagttttgacctcccaggctcaagcaatcctcccacttcagcctcccgagtagctgagactgcaggcgtttgccaccacatccagctaatttttatttttttgtagaaacacagtgtcactatttgcctaggctggcctcaaactcctgggctcaaaaaatcctcctgcctcagcctcccaaagtgttgtgattatagatgggagccactatacccagcctcagatttttatatttaaacaaacgtatgttttcacttataatacagacaatatgctctagctgatgagaaagcaaataattggaaaaaaattttggaaacttccaggacaaaatgagcatagcaatacatctgagatagaatgaggaagaggaactagaatgaggaagaggaactagaatgaggaagaagacccagaagtaacaagtcagagtaatgctggaaaatcctgtcagggagggaatggttaagcctatgtctcagtaaccatgaacaaagggccaaggaaacccttcatccaatctggtgttgagaaactgttaacaacacagaagtcatctgtttgctcaatgattcacattccttagagagggagttctcagaccaatcatcttgaaaactcaatggttttcacattcatgaagtcagtgaatggactctaaatctggttgccattggaccacccattaaatctttggcctgtaactgattgagatggaggacattttgcaaaccgtgatgtctcccacctggagtgtggttggcgttcttgctttggagtcattttcatctttacaatagatcccttgccagtgggatgtaaaaggaaaaggaaaaaggtccacttttcccacacgaagccccccac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Naito Y, Bono H. (2012)
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