GGRNA ver.2 Home | Help | Advanced search    Previous release (v1)

2025-04-03 08:41:28, GGRNA.v2 : RefSeq release 228 (Jan, 2025)

LOCUS       XM_064375260            2390 bp    mRNA    linear   PRI 10-APR-2024
DEFINITION  PREDICTED: Aotus nancymaae uncharacterized LOC135274299
            (LOC135274299), transcript variant X1, mRNA.
ACCESSION   XM_064375260
VERSION     XM_064375260.1
DBLINK      BioProject: PRJNA1095488
KEYWORDS    RefSeq.
SOURCE      Aotus nancymaae (Ma's night monkey)
  ORGANISM  Aotus nancymaae
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
            Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
            Platyrrhini; Aotidae; Aotus.
COMMENT     MODEL REFSEQ:  This record is predicted by automated computational
            analysis. This record is derived from a genomic sequence
            (NW_026988422) annotated using gene prediction method: Gnomon.
            Also see:
                Documentation of NCBI's Annotation Process
            
            ##Genome-Annotation-Data-START##
            Annotation Provider         :: NCBI RefSeq
            Annotation Status           :: Full annotation
            Annotation Name             :: GCF_030222135.1-RS_2024_04
            Annotation Pipeline         :: NCBI eukaryotic genome annotation
                                           pipeline
            Annotation Software Version :: 10.2
            Annotation Method           :: Best-placed RefSeq; Gnomon;
                                           cmsearch; tRNAscan-SE
            Features Annotated          :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA
            Annotation Date             :: 04/07/2024
            ##Genome-Annotation-Data-END##
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..2390
                     /organism="Aotus nancymaae"
                     /mol_type="mRNA"
                     /isolate="86718"
                     /db_xref="taxon:37293"
                     /chromosome="Unknown"
                     /sex="female"
                     /tissue_type="blood"
     gene            1..2390
                     /gene="LOC135274299"
                     /note="uncharacterized LOC135274299; Derived by automated
                     computational analysis using gene prediction method:
                     Gnomon."
                     /db_xref="GeneID:135274299"
     CDS             162..1520
                     /gene="LOC135274299"
                     /codon_start=1
                     /product="uncharacterized protein LOC135274299"
                     /protein_id="XP_064231330.1"
                     /db_xref="GeneID:135274299"
                     /translation="
MKTSLAGQTWGTNRGKDMISIFRSPWDGNKTTIFVSLMIMKMMTMTGMMTTLMTMTMTKVRVMVMMMVMMVVMVTVMVMMVMMVMVMVMMVMTVMVMVMVMVMTVMVMVIMVMMVIMVMMVMVMTVMVMVMMMVMVMMVMVMVIMVIMVMVMVMMVMTVMVMVMMMVMVMVMTVMVMVIMVMMVIMVMMVMVMTVMVMVMVIMVIMVMVMVMMVMMVIMVMMVMVMTVMVMVMVIMVIMVMVMVMMVMMVMVMMVMTVMVMVMVMVMVMTVMVMVIMVMMVIMVMMVMVMTVMVMVMMMVMMVMVMVIMVIMVMVMVMMMTVMVMMMVMVMVMTVMVMVIMVMMVIMVMMVMVMTVMVMMMVIMVIMVMVMVMMVMMVMTVMVMVIMVIMVMVMMVMVMMMVMVMTVMVMVMVIMVIMVMVMVMMVMMVMTVMVMVMVIMVVMVMITVVRVL"
ORIGIN      
aaggtctttgggtgttggtgcagtggcacgggactgcgatcccggagacgatggaagccagtgaggttcaacaacagattagagacagaaggagagtcagcatcttgaagacagacaatttctatgtcatctggagaacagagactggtgacttctagaacatgaaaacctcccttgcaggccagacttgggggacaaatagaggcaaggacatgatcagcatcttcagatctccctgggacgggaacaaaaccacaatctttgtcagcttgatgataatgaagatgatgacaatgacagggatgatgacaacactgatgacaatgaccatgacaaaggtgagggtgatggtgatgatgatggtgatgatggtggtgatggtgacagtgatggtgatgatggtgatgatggtgatggtgatggtgatgatggtgatgacggtgatggtgatggtgatggtgatggtgatgacggtgatggtgatggtgataatggtgatgatggtgataatggtgatgatggtgatggtgatgacggtgatggtgatggtgatgatgatggtgatggtgatgatggtgatggtgatggtgataatggtgattatggtgatggtgatggtgatgatggtgatgacggtgatggtgatggtgatgatgatggtgatggtgatggtgatgacggtgatggtgatggtgataatggtgatgatggtgataatggtgatgatggtgatggtgatgacggtgatggtgatggtgatggtgataatggtgattatggtgatggtgatggtgatgatggtgatgatggtgataatggtgatgatggtgatggtgatgacggtgatggtgatggtgatggtgataatggtgattatggtgatggtgatggtgatgatggtgatgatggtgatggtgatgatggtgatgacggtgatggtgatggtgatggtgatggtgatggtgatgacggtgatggtgatggtgataatggtgatgatggtgataatggtgatgatggtgatggtgatgacggtgatggtgatggtgatgatgatggtgatgatggtgatggtgatggtgataatggtgattatggtgatggtgatggtgatgatgatgacggtgatggtgatgatgatggtgatggtgatggtgatgacggtgatggtgatggtgataatggtgatgatggtgataatggtgatgatggtgatggtgatgacggtgatggtgatgatgatggtgataatggtgattatggtgatggtgatggtgatgatggtgatgatggtgatgacggtgatggtgatggtgataatggtgattatggtgatggtgatgatggtgatggtgatgatgatggtgatggtgatgacggtgatggtgatggtgatggtgataatggtgattatggtgatggtgatggtgatgatggtgatgatggtgatgacggtgatggtgatggtgatggtgataatggtggtgatggtgatgatcacggtggtgagggtgttgtgatggtgataatggtgatgattgtgatggtgatggtgattatggtgatggtgatgatggcggtggtgagggtgtggtggtggtgataatgacgatgatgacacccatcttttgttaagcaccaagtacatgttaggtactcatttgattctcacaaccatttagaaaggtaaatggcatgccctccctccatggaggagcaaacccagactcctcaaccttaaatgttcaccagagtggatacagagctagagtcaagcccgaggctcaggctcgcctgcccctgccaggccctaccgccaagtggaggtgcagggctgggctgtgtgagccctggcatcgtttgctgaactctctcagcaagtctgttatggatgctactttacagatgaggaaagtgggtcccagaggggcttagtgactcaataaaagccaaagctccaccagcaagtggcgggtctgagggggagcatcgtgtcccagagcgctggagaggcaggcagaggtctggccgcttggcaactgtgagcctccgtgtcttcatctcatctgtcattatagcagtaagagtcatcctcaccatcttagaggtgccccagatgacccacggaacatcaggcaccctccagatgctcggtaaatcccgcagcatctagccagtcccagaagcaggctgtggctcccagtcctgggctcccgcgctgtgctgccctcgctcctctggccagacctccatggccatcagtgaactcaggtcgtggcctgggaagcttcagacctgagtggggagaagacggtgaggggcggctagaggccaggcctcctccagcacccccaccaggacagccctgcaacagggaaacggtgaaggcc
//

by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).

If you use GGRNA in your work, please cite:
Naito Y, Bono H. (2012)
GGRNA: an ultrafast, transcript-oriented search engine for genes and transcripts.
Nucleic Acids Res., 40, W592-W596. [Full Text]