2024-03-28 19:49:12, GGRNA.v2 : RefSeq release 222 (Jan, 2024)
LOCUS XM_040231612 17295 bp mRNA linear MAM 20-MAR-2021 DEFINITION PREDICTED: Oryx dammah argonaute RISC catalytic component 3 (AGO3), transcript variant X4, mRNA. ACCESSION XM_040231612 VERSION XM_040231612.1 DBLINK BioProject: PRJNA694191 KEYWORDS RefSeq. SOURCE Oryx dammah (scimitar-horned oryx) ORGANISM Oryx dammah Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Laurasiatheria; Artiodactyla; Ruminantia; Pecora; Bovidae; Hippotraginae; Oryx. COMMENT MODEL REFSEQ: This record is predicted by automated computational analysis. This record is derived from a genomic sequence (NW_024070212.1) annotated using gene prediction method: Gnomon. Also see: Documentation of NCBI's Annotation Process ##Genome-Annotation-Data-START## Annotation Provider :: NCBI Annotation Status :: Full annotation Annotation Name :: Oryx dammah Annotation Release 100 Annotation Version :: 100 Annotation Pipeline :: NCBI eukaryotic genome annotation pipeline Annotation Software Version :: 8.6 Annotation Method :: Best-placed RefSeq; Gnomon Features Annotated :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA ##Genome-Annotation-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 1..17295 /organism="Oryx dammah" /mol_type="mRNA" /isolate="SB20612" /db_xref="taxon:59534" /chromosome="Unknown" /sex="male" /tissue_type="liver" /dev_stage="adult" /country="USA: Front Royal, Virginia" gene 1..17295 /gene="AGO3" /note="Derived by automated computational analysis using gene prediction method: Gnomon. Supporting evidence includes similarity to: 549 long SRA reads, 3 Proteins, and 98% coverage of the annotated genomic feature by RNAseq alignments, including 4 samples with support for all annotated introns" /db_xref="GeneID:120856379" CDS 2569..4449 /gene="AGO3" /codon_start=1 /product="protein argonaute-3 isoform X3" /protein_id="XP_040087546.1" /db_xref="GeneID:120856379" /translation="
MCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYELLAIREACISLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA"
misc_feature 2569..2910 /gene="AGO3" /note="PAZ domain, argonaute_like subfamily. Argonaute is part of the RNA-induced silencing complex (RISC), and is an endonuclease that plays a key role in the RNA interference pathway. The PAZ domain has been named after the proteins Piwi,Argonaut, and Zwille; Region: PAZ_argonaute_like; cd02846" /db_xref="CDD:239212" misc_feature order(2704..2706,2749..2751,2791..2793,2803..2805, 2857..2859,2878..2880,2884..2886) /gene="AGO3" /note="nucleic acid-binding interface [nucleotide binding]; other site" /db_xref="CDD:239212" misc_feature 3043..4320 /gene="AGO3" /note="PIWI domain, Argonaute-like subfamily. Argonaute is the central component of the RNA-induced silencing complex (RISC) and related complexes. The PIWI domain is the C-terminal portion of Argonaute and consists of two subdomains, one of which provides the...; Region: Piwi_ago-like; cd04657" /db_xref="CDD:240015" misc_feature order(3454..3456,3466..3468,3502..3513,3520..3522, 3544..3546,3553..3555,3565..3567,3577..3579) /gene="AGO3" /note="5' RNA guide strand anchoring site [active]" /db_xref="CDD:240015" misc_feature order(3658..3660,3664..3666,3874..3876,4288..4290) /gene="AGO3" /note="active site" /db_xref="CDD:240015" ORIGIN
ctcctctcctttattaactagttttagccaacatagtattattatattgttcattatgattttacttaaatttctactacttgactctcaactttgactctgttgctataaagtgtgccctcagttagtttattctactttttatgattgttctgtttttcgtgtatttgtatatactgttattcccatggttttgagcatgtaacagttacattccatttgtgttcatcttaaatctacagttatatgtattggtgctaattgcaagtccttttgctaaaatgtttccggtcatctcttggttgcagtttgtcctcaagttacttcaggccttcctgaagtgacttccttactcatatgagtaagaactgaggttttttgcatattgaaaaccatttgtctatagccttattcctaaaggggactgcttggttagacataaaatgattgaatcacactttttttttctaattctgttttcttattgaagtatggttgatatacaaattgtgccagtatctactgcacagcatagttactcagctatagatgtatatacattctttttttaaaaaatattcttttccattatggcttatctgaattacactttcttgagatactttcttgagatacactttctgatagatactttcccactgtcttctgacactgaattttcagtagagaattaggatgtcagctgattttcttgtcccttataagtacctactttttttgtctgattgctgaaaatattttttacaattattttgctagatttttttcttcaatgttgactattttgagtcagttttatttaaaacatgggatcccctttgaggatgtaggttcaactcttttatctttttttttttttaatctgtcattttattttctttttaaaaaattctatcctgctgttctttactgtttcttttatggtataatttttaccatttgctcattgtagttttgtcttcatttttttaatttaaaaagtctttttcttccatttctttcatgagttctgcagtgcttatttcattttctcctcttagctgtttgtctttccctgagttcttaaatttctgctctgagatctttcttcatagctgcattaagaaatttcggattcatattgaaaactagtgttatagttttatctattttgtagtggtgtattctgttgagttttctttgtccgggatgttgtgctgcttttttacattttttaaatggtatttttgtatggatacttgcctcttttgttacttgtatttgagtgagataagttttctcaaaccacctattagaagaaactggagtgggagaaggaggtgggacaggacattaggagcaaggtgcttttccaggtttctctgctcaagacctctattctcttctgttctgatggattctttcttcagaataaagccacatctcctttgcctctcagtaatatatgtttaaggactttctgctaccaaggaatttagctcttgccttttaaagtatgtgctcaaatgttaacagttagagaatctgtgaagggtatatggtagttcattgtactattcattcaacttttcttcaagtttgaaattacagagggacaatgcatgccttggttttaaaagggagtcctatctgagacctgtcacttctagttcaccctcaattgactctcatgacactttctacactcctttctctacttccttctgagattcccccattcagtttcagtactaaacactgcagttcccatttaggataagaccctctctttctggagtgaaaatttgctgctgttgccccattagagtttctttcatctttcatgactttctcctttgcagaggttcccaagtattttgggccatatttacttacagtttggcactttcaggttttaattgtctcctaggttcattgaagatatagggtttcttctcttttcttttttctctctcttttcagattatctttgttggtctgtaatgagttctagggggaaagtgggaaattttggaaataaactgttgctattttcctattggaacttacaaagttctgctttggatattacaaaaatttctaaataactcattggtcgaagaaaattttaaatattttaaactaaagagtaatgaaaatagtacataccagaattggtatgattagctaaagcaattcttagaatttaaaaccttaaatgcctattagaaagggagaaaagcatcaatgacctatatattcatcttaataagttagaaaaataacataattaaatgcaaagaaaaatagaaggaaataagagtttaaaaaaattaatgaaatagaaaacaaatttacctctatcctgtacgtaggaagacttcaaaaattttaaagaaggatagtgacatgatcatatttgttttccagaaagagacctctggcagcagtgtggagaatagatagaggagaaaaaaactaatctgagaagccagttaggaggctttttcaatcactagttcagtttctgccactgccttctacaaagcacaacctgtaattcagttcatgtgtgaagttcttgatatacataatattgatgagcaaccaagacctctgactgattctcatagggtaaaattcaccaaagagataaaaggtctgaaggttgaagtgactcattgtggaacaatgagacggaaatatcgtgtttgtaatgtaacaagaaggcctgccagtcatcaaacctttcctttacagttagaaaatggccaaactgtggagagaacagtagcacagtatttcagagaaaagtatactcttcagctgaagtacccacaccttccctgtctgcaagtggggcaggaacagaaacatacctacctgccactagaagtctgtaatattgtggcagggcaacgatgtatcaagaagctaacggacaatcaaacctccactatgatcaaagccacagcaagatctgcaccagatagacaagaggaaattagcagattggtaagaagtgcaaattatgaaacagatccatttgttcaagagtttcaatttaaagttcgagatgaaatggctcatgtaaccggacgcgtacttccagcacctatgctccaatatggaggccggaaccggactgtagcaacaccaagccatggagtatgggacatgcgagggaaacagttccacacaggagttgaaatcaaaatgtgggctatagcttgttttgccacacagaggcagtgtagagaagaaatattgaagggttttaccgaccagctgcggaagatttccaaggacgcagggatgcccatccagggccagccttgcttctgcaaatacgcgcagggggcagacagcgtggagcccatgttccggcatctcaagaacacctactcagggctgcagctcattattgttatcctgcctgggaagacgccagtgtatgcggaggtgaaacgtgtcggagatacacttttgggtatggctacacaatgtgttcaagtcaagaatgtaataaaaacatcccctcaaactctctcaaacctgtgcctgaagataaatgttaaacttggagggatcaataatattcttgtacctcatcaaagaccttctgtgttccagcaaccagtgatctttttgggagcagatgtcactcatccgccagctggtgatgggaagaagccttctattgctgctgttgtaggtagtatggatgcccacccaagcagatactgtgctaccgtaagagttcagagaccccgacaggagatcatccaggacctcgcctccatggtccgagaacttctcattcagttttataagtcaactcggttcaagcctactcgtatcatcttctatcgggatggtgtttcagaggggcagttcaggcaggtattatattatgaactcctagcaattcgagaagcctgcatcagtttggagaaagactatcaacctggaataacctacattgtagttcagaagagacaccacactcgactgttttgtgctgatagaactgaaagggttggaagaagtggcaatatcccagctggaacaacggtcgacacagacattacccacccgtatgagtttgatttttacctctgtagtcatgctgggatacagggtaccagccgaccttcacactatcatgttttgtgggatgataactgctttactgcagatgaacttcagctgctaacttaccagctctgccacacttacgtgcgctgtacacgatctgtttctatacctgcaccagcgtattatgctcacctggtggcgtttagagccagatatcatctcgtggacaaagaacatgacagtgctgaaggaagtcacgtttcaggacagagcaatggacgagatccacaagctctcgccaaggctgtacagattcaccaagataccttacgcacaatgtactttgcttaaaaagtctaaggatattctctgagaggaagaactggaagatgaatcgacatgcaacttatgtttccagtggagtcagctgggtgaggatgcctccagccatacagaaaccaacactgcatgggggccagggtctgattttatgttgatgcaggaagattgtttacttcatcgaggaacacagcaccattatgcaatatgaaaccagccaactgcttttttgtgcggtctcctgtaggaagtatcgcggttgttttgttttcactttcttgtagtctaacccttttaatgcctttacctcaagttgcttggcagcacaactctttgcaaaaaaaaaaaaagtaaagaaaaagtaaatgaaggttttttttttttttttaaaaaaaactacacctatatgaataatcaaagtgattgttcacaatgatgtgtgcaaaaaaattaatgtgcattcatgtattcttgtaaaagttatctgtatattttacatatatacatgcatactgcatatgcatatatatctagatctacactgatagtagatatacatgcat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Naito Y, Bono H. (2012)
GGRNA: an ultrafast, transcript-oriented search engine for genes and transcripts.
Nucleic Acids Res., 40, W592-W596.
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