LOCUS       XM_040231610           15827 bp    mRNA    linear   MAM 20-MAR-2021
DEFINITION  PREDICTED: Oryx dammah argonaute RISC catalytic component 3 (AGO3),
            transcript variant X2, mRNA.
ACCESSION   XM_040231610
VERSION     XM_040231610.1
DBLINK      BioProject: PRJNA694191
KEYWORDS    RefSeq.
SOURCE      Oryx dammah (scimitar-horned oryx)
  ORGANISM  Oryx dammah
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
            Mammalia; Eutheria; Laurasiatheria; Artiodactyla; Ruminantia;
            Pecora; Bovidae; Hippotraginae; Oryx.
COMMENT     MODEL REFSEQ:  This record is predicted by automated computational
            analysis. This record is derived from a genomic sequence
            (NW_024070212.1) annotated using gene prediction method: Gnomon.
            Also see:
                Documentation of NCBI's Annotation Process
            
            ##Genome-Annotation-Data-START##
            Annotation Provider         :: NCBI
            Annotation Status           :: Full annotation
            Annotation Name             :: Oryx dammah Annotation Release 100
            Annotation Version          :: 100
            Annotation Pipeline         :: NCBI eukaryotic genome annotation
                                           pipeline
            Annotation Software Version :: 8.6
            Annotation Method           :: Best-placed RefSeq; Gnomon
            Features Annotated          :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA
            ##Genome-Annotation-Data-END##
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..15827
                     /organism="Oryx dammah"
                     /mol_type="mRNA"
                     /isolate="SB20612"
                     /db_xref="taxon:59534"
                     /chromosome="Unknown"
                     /sex="male"
                     /tissue_type="liver"
                     /dev_stage="adult"
                     /country="USA: Front Royal, Virginia"
     gene            1..15827
                     /gene="AGO3"
                     /note="Derived by automated computational analysis using
                     gene prediction method: Gnomon. Supporting evidence
                     includes similarity to: 567 long SRA reads, 5 Proteins,
                     and 99% coverage of the annotated genomic feature by
                     RNAseq alignments, including 3 samples with support for
                     all annotated introns"
                     /db_xref="GeneID:120856379"
     CDS             540..2981
                     /gene="AGO3"
                     /codon_start=1
                     /product="protein argonaute-3 isoform X2"
                     /protein_id="XP_040087544.1"
                     /db_xref="GeneID:120856379"
                     /translation="

MMESKDLVPECRKWWLREVVDSMVQHFKVTIFGDRRPVYDGKRSLYTANPLPVATTGVDLDVTLPGEGGKDRPFKVSIKFVSRVSWHLLHEVLTGRTLPEPLELDKPISTNPVHAVDVVLRHLPSMKYTPVGRSFFSAPEGYDHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIQFMCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYELLAIREACISLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA"

     misc_feature    615..899
                     /gene="AGO3"
                     /note="N-terminal domain of argonaute; Region: ArgoN;
                     pfam16486"
                     /db_xref="CDD:435368"
     misc_feature    927..1079
                     /gene="AGO3"
                     /note="Argonaute linker 1 domain; Region: ArgoL1;
                     pfam08699"
                     /db_xref="CDD:430160"
     misc_feature    1080..1442
                     /gene="AGO3"
                     /note="PAZ domain, argonaute_like subfamily. Argonaute is
                     part of the RNA-induced silencing complex (RISC), and is
                     an endonuclease that plays a key role in the RNA
                     interference pathway. The PAZ domain has been named after
                     the proteins Piwi,Argonaut, and Zwille; Region:
                     PAZ_argonaute_like; cd02846"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    order(1236..1238,1281..1283,1323..1325,1335..1337,
                     1389..1391,1410..1412,1416..1418)
                     /gene="AGO3"
                     /note="nucleic acid-binding interface [nucleotide
                     binding]; other site"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    1575..2852
                     /gene="AGO3"
                     /note="PIWI domain, Argonaute-like subfamily. Argonaute is
                     the central component of the RNA-induced silencing complex
                     (RISC) and related complexes. The PIWI domain is the
                     C-terminal portion of Argonaute and consists of two
                     subdomains, one of which provides the...; Region:
                     Piwi_ago-like; cd04657"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(1986..1988,1998..2000,2034..2045,2052..2054,
                     2076..2078,2085..2087,2097..2099,2109..2111)
                     /gene="AGO3"
                     /note="5' RNA guide strand anchoring site [active]"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(2190..2192,2196..2198,2406..2408,2820..2822)
                     /gene="AGO3"
                     /note="active site"
                     /db_xref="CDD:240015"
ORIGIN      

ggcttccgggggtggcccccggggaggtcggcggcggcgccgcagtcgtggagggccagtgggagcgtaagcggccgtgggcgacgcaagttccgcacagagctcttcccttctcgcctcacgcttcttcctctctcctagtcgcgtgctgcctcccgacggccgctcgtcctgaccagagctttcggagtgcggtggctgagaagaagccgtcaccaccccgcctcggggccgagtcagggttcttgtcgcgccgcgtcgccccctgcgccgcctccttgccctcagtggcgggcgcccttctcgctcgaagcactccccccagctccatgaatggaaatcggctccgcaggacccgttggggcccagcccctactcatggtgcccagaagacctggctatggcaccatgggcaaacccattaaattgctggctaactgttttcaagttgaaattccaaagattgatgtctacctctatgaggtagatattaaaccagacaagtgtcctaggagagtgaacagtctgtgcaccagagcatgatggaatcaaaagacttggtaccagaatgtaggaagtggtggttgagggaggtggttgactcaatggttcagcattttaaagtgactatatttggggaccgtagaccagtttatgatggaaaaagaagcctttacacagccaatccacttcctgtggcaactacaggggtggatttagatgttactttacctggagaaggtggaaaagaccgacctttcaaagtgtcaatcaaatttgtctctcgggtgagttggcacctactccatgaagtactgacaggacggaccttgcccgaaccgctggaattagacaagccaatcagcactaaccctgtccatgccgttgacgtggtgctacgacatctaccctccatgaaatatacacctgtggggcgttcctttttctcagctccagaaggatacgaccaccctctgggagggggcagggaagtttggtttggatttcatcagtctgttcggcctgccatgtggaaaatgatgcttaatattgatgtttctgccactgccttctacaaagcacaacctgtaattcagttcatgtgtgaagttcttgatatacataatattgatgagcaaccaagacctctgactgattctcatagggtaaaattcaccaaagagataaaaggtctgaaggttgaagtgactcattgtggaacaatgagacggaaatatcgtgtttgtaatgtaacaagaaggcctgccagtcatcaaacctttcctttacagttagaaaatggccaaactgtggagagaacagtagcacagtatttcagagaaaagtatactcttcagctgaagtacccacaccttccctgtctgcaagtggggcaggaacagaaacatacctacctgccactagaagtctgtaatattgtggcagggcaacgatgtatcaagaagctaacggacaatcaaacctccactatgatcaaagccacagcaagatctgcaccagatagacaagaggaaattagcagattggtaagaagtgcaaattatgaaacagatccatttgttcaagagtttcaatttaaagttcgagatgaaatggctcatgtaaccggacgcgtacttccagcacctatgctccaatatggaggccggaaccggactgtagcaacaccaagccatggagtatgggacatgcgagggaaacagttccacacaggagttgaaatcaaaatgtgggctatagcttgttttgccacacagaggcagtgtagagaagaaatattgaagggttttaccgaccagctgcggaagatttccaaggacgcagggatgcccatccagggccagccttgcttctgcaaatacgcgcagggggcagacagcgtggagcccatgttccggcatctcaagaacacctactcagggctgcagctcattattgttatcctgcctgggaagacgccagtgtatgcggaggtgaaacgtgtcggagatacacttttgggtatggctacacaatgtgttcaagtcaagaatgtaataaaaacatcccctcaaactctctcaaacctgtgcctgaagataaatgttaaacttggagggatcaataatattcttgtacctcatcaaagaccttctgtgttccagcaaccagtgatctttttgggagcagatgtcactcatccgccagctggtgatgggaagaagccttctattgctgctgttgtaggtagtatggatgcccacccaagcagatactgtgctaccgtaagagttcagagaccccgacaggagatcatccaggacctcgcctccatggtccgagaacttctcattcagttttataagtcaactcggttcaagcctactcgtatcatcttctatcgggatggtgtttcagaggggcagttcaggcaggtattatattatgaactcctagcaattcgagaagcctgcatcagtttggagaaagactatcaacctggaataacctacattgtagttcagaagagacaccacactcgactgttttgtgctgatagaactgaaagggttggaagaagtggcaatatcccagctggaacaacggtcgacacagacattacccacccgtatgagtttgatttttacctctgtagtcatgctgggatacagggtaccagccgaccttcacactatcatgttttgtgggatgataactgctttactgcagatgaacttcagctgctaacttaccagctctgccacacttacgtgcgctgtacacgatctgtttctatacctgcaccagcgtattatgctcacctggtggcgtttagagccagatatcatctcgtggacaaagaacatgacagtgctgaaggaagtcacgtttcaggacagagcaatggacgagatccacaagctctcgccaaggctgtacagattcaccaagataccttacgcacaatgtactttgcttaaaaagtctaaggatattctctgagaggaagaactggaagatgaatcgacatgcaacttatgtttccagtggagtcagctgggtgaggatgcctccagccatacagaaaccaacactgcatgggggccagggtctgattttatgttgatgcaggaagattgtttacttcatcgaggaacacagcaccattatgcaatatgaaaccagccaactgcttttttgtgcggtctcctgtaggaagtatcgcggttgttttgttttcactttcttgtagtctaacccttttaatgcctttacctcaagttgcttggcagcacaactctttgcaaaaaaaaaaaaagtaaagaaaaagtaaatgaaggttttttttttttttttaaaaaaaactacacctatatgaataatcaaagtgattgttcacaatgatgtgtgcaaaaaaattaatgtgcattcatgtattcttgtaaaagttatctgtatattttacatatatacatgcatactgcatatgcatatatatctagatctacactgatagtagatatacatgcatctctgtatatattttatagttcattccattggggaaccgcctttcccttttattattctcccaccgccattgtcatttttctctctacctcccttgccacagtttttttccctgatgctaccagtgacattcaaatattcatgtatctggttcatttgaatatgaagcatggcaaactagatttttattttgcacaccctactcctgtctcttgtctcacacacaattttgagtcctcaactcttggtattgctttcctaagaaacaaaattattttatatatacatatatatatataaaatatggttttgtgagagtgaatgtctgccccctccagccctcagcttacatttgccatttgtgcaatgtgtacataagcagtagcacctaaactattctttttctttagtgaatttgttaaagctgctattaaaaaaaaaacaaaaaacgtcaaaagttgtaactctctctataactgatgctactattctaaagtcttctgtttctatgtgttatacatggaaatcccttaaagcttttataaagggcaaatgttttacatgattggaatcgtgtagggttgaggtctctgaaattgggtagagagaaggggttgttgaagtttcttttaattttttttgctagtttacttgctgcctctcataccttaatgtgattttcatatatatatttttatatatatgtgttgtatatataaacatatatgtatgtgttttgaagtatagcttccttttcttttatatttattagaatagtgctttaataattatagaatcgtattggcaacatcttttatagaaatataatcatgtttattttaagaactgacaatttgtttttgctctcttttagtgcaataagcagttttaaaagaaagctgtgtctgttttacatctttaccacaaatcgtgggagaaacaggcacctccataattttaaaagggcaaagtaatatagccttaatttcagaaggaaagttttataatttttaagtttaaagcatgtcttataaaaatcattatgaaaatgacggaagttaaatttcataaatgagtcttgaccttgaatattagaaataaagttgaagaactttgatttaattaatgacaatgactaggttaagatatagaagacatttaaatttttgaaaagagctcatgtttgttgaagaatcatactggtaagctgccagttttcatttactaaaacgagtcaggaaaatataaaatgatatttttaaaactttatttgcttatttatcactagtgtaactttccttttaaaattagggagatggtgacaaaggaagttaggactttgatcatttggaatgagttaaatcactgaaatgttgaaaaacttttttgcagaacttttgttttattaacttcactttaagatcttaaaaaatactataaagctgtcaaaaccgagtttatcagtaacc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