LOCUS       XM_039851020           15691 bp    mRNA    linear   MAM 02-MAR-2021
DEFINITION  PREDICTED: Pteropus giganteus argonaute RISC catalytic component 3
            (AGO3), transcript variant X1, mRNA.
ACCESSION   XM_039851020
VERSION     XM_039851020.1
DBLINK      BioProject: PRJNA703023
KEYWORDS    RefSeq.
SOURCE      Pteropus giganteus (Indian flying fox)
  ORGANISM  Pteropus giganteus
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
            Mammalia; Eutheria; Laurasiatheria; Chiroptera; Megachiroptera;
            Pteropodidae; Pteropodinae; Pteropus.
COMMENT     MODEL REFSEQ:  This record is predicted by automated computational
            analysis. This record is derived from a genomic sequence
            (NW_024353787.1) annotated using gene prediction method: Gnomon,
            supported by mRNA evidence.
            Also see:
                Documentation of NCBI's Annotation Process
            
            ##Genome-Annotation-Data-START##
            Annotation Provider         :: NCBI
            Annotation Status           :: Full annotation
            Annotation Name             :: Pteropus giganteus Annotation
                                           Release 100
            Annotation Version          :: 100
            Annotation Pipeline         :: NCBI eukaryotic genome annotation
                                           pipeline
            Annotation Software Version :: 8.5
            Annotation Method           :: Best-placed RefSeq; Gnomon
            Features Annotated          :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA
            ##Genome-Annotation-Data-END##
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..15691
                     /organism="Pteropus giganteus"
                     /mol_type="mRNA"
                     /isolation_source="ENVO:00010625"
                     /db_xref="taxon:143291"
                     /chromosome="Unknown"
     gene            1..15691
                     /gene="AGO3"
                     /note="Derived by automated computational analysis using
                     gene prediction method: Gnomon. Supporting evidence
                     includes similarity to: 13 mRNAs, 35 Proteins, and 100%
                     coverage of the annotated genomic feature by RNAseq
                     alignments, including 70 samples with support for all
                     annotated introns"
                     /db_xref="GeneID:120593272"
     CDS             83..2665
                     /gene="AGO3"
                     /codon_start=1
                     /product="protein argonaute-3 isoform X1"
                     /protein_id="XP_039706954.1"
                     /db_xref="GeneID:120593272"
                     /translation="

MEIGSAGPVGAQPLLMVPRRPGYGSMGKPIKLLANCFQVEIPKIDVYLYEVDIKPDKCPRRVNREVVDSMVQHFKVTIFGDCRPVYDGKRSLYTANPLPVATTGVDLDVTLPGEGGKDRPFKVSIKFVSRVSWHLLHEVLTGRTLPEPLELDKPISTNPVHAVDVVLRHLPSMKYTPVGRSFFSAPEGYDHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIQFMCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYELLAIREACISLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNCFNADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA"

     misc_feature    299..583
                     /gene="AGO3"
                     /note="N-terminal domain of argonaute; Region: ArgoN;
                     pfam16486"
                     /db_xref="CDD:435368"
     misc_feature    611..763
                     /gene="AGO3"
                     /note="Argonaute linker 1 domain; Region: ArgoL1;
                     pfam08699"
                     /db_xref="CDD:430160"
     misc_feature    764..1126
                     /gene="AGO3"
                     /note="PAZ domain, argonaute_like subfamily. Argonaute is
                     part of the RNA-induced silencing complex (RISC), and is
                     an endonuclease that plays a key role in the RNA
                     interference pathway. The PAZ domain has been named after
                     the proteins Piwi,Argonaut, and Zwille; Region:
                     PAZ_argonaute_like; cd02846"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    order(920..922,965..967,1007..1009,1019..1021,1073..1075,
                     1094..1096,1100..1102)
                     /gene="AGO3"
                     /note="nucleic acid-binding interface [nucleotide
                     binding]; other site"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    1259..2536
                     /gene="AGO3"
                     /note="PIWI domain, Argonaute-like subfamily. Argonaute is
                     the central component of the RNA-induced silencing complex
                     (RISC) and related complexes. The PIWI domain is the
                     C-terminal portion of Argonaute and consists of two
                     subdomains, one of which provides the...; Region:
                     Piwi_ago-like; cd04657"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(1670..1672,1682..1684,1718..1729,1736..1738,
                     1760..1762,1769..1771,1781..1783,1793..1795)
                     /gene="AGO3"
                     /note="5' RNA guide strand anchoring site [active]"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(1874..1876,1880..1882,2090..2092,2504..2506)
                     /gene="AGO3"
                     /note="active site"
                     /db_xref="CDD:240015"
ORIGIN      

ctccgtgctgccccctgcaccgccttctggcccccagtggcgggcgcccttctcactcgaagcactccccccagctccatgaatggaaatcggctccgcaggacccgttggggcccagcccctactcatggtgcccagaagacctggctatggctctatgggcaaacccattaaattactggctaactgttttcaagttgaaattccaaagattgatgtctacctttatgaggtagatattaaaccagacaagtgtcctagaagagtgaacagggaggtggttgactcaatggttcaacattttaaagtaactatatttggggactgtagaccagtttatgatggaaaaagaagcctttacacagccaatccacttcctgtggcaactactggggtagatttagatgttactttacctggggaaggtggaaaagatcgaccttttaaggtgtcaatcaaatttgtctctcgggtgagttggcacctactacatgaagtcctgacaggacgtaccttgcctgagccactggaattagacaagccaatcagcactaatcctgtccatgctgtcgatgtggtgctacgacatctgccctccatgaaatacacgcctgtggggcgttcctttttctcagctccagaaggatatgaccaccctcttggaggaggcagggaagtatggtttggattccatcaatctgttcggcctgccatgtggaaaatgatgcttaatattgatgtttctgccactgccttctacaaagcacaacctgtaattcagttcatgtgtgaagttcttgacattcataatattgatgagcaaccaagacctctgactgattctcatcgggtaaaattcaccaaagagataaaaggtctgaaggttgaagtgactcattgtggaacaatgagacggaaataccgtgtttgtaatgtaacaagaaggcctgccagtcatcaaacctttcctttacagttagaaaatggccaaactgtggagagaacagtagcacaatatttcagagaaaagtatactcttcagctgaagtacccacaccttccctgtctgcaagtggggcaggagcagaaacatacgtatctgccactagaagtctgtaatattgtggcagggcaacgatgtatcaagaagctaaccgacaatcagacttccactatgatcaaagcaacagcaagatctgcaccagatagacaagaggaaattagcagattggtaagaagtgcaaattatgaaacagatccatttgttcaggagtttcaatttaaagttcgggatgaaatggcccatgtaaccggacgcgtacttccagcacctatgctccagtatggaggacggaatcgtacagtagcaacaccaagccatggagtatgggacatgcgaggaaaacagttccacacaggagttgaaatcaaaatgtgggctatagcttgttttgccacacagaggcagtgcagagaagaaatattgaagggtttcacggaccagctgcgtaagatttctaaagatgcggggatgcccatccagggccagccttgcttctgcaaatatgcgcagggggcagacagcgtggagcccatgttccggcatctcaagaacacatactctgggctgcagctcattattgtcatcctgccagggaagacgcccgtgtatgcggaggtgaaacgtgtaggagatacacttttgggtatggctacacagtgtgttcaagtcaagaatgtaataaaaacatcccctcaaactctctcaaacctgtgcctaaagataaatgttaaactcggagggatcaataatattcttgtacctcatcaaagaccatctgtgttccagcaaccagtgatctttttgggagcagatgtcactcatccaccagctggtgatgggaagaagccttctattgctgctgttgtaggtagtatggacgcccacccaagcagatactgtgccacagtaagagttcagagaccccgacaggagatcatccaggacttggcctccatggtccgagaacttctcattcaattttataagtcaactcggttcaaacctactcgtatcatcttttatcgggatggtgtttcagagggacagtttcggcaggtgttatattatgaactactagcaattcgagaagcctgcatcagtttggagaaagattatcaacctggaataacttacattgtagttcagaagagacatcacactcgattattttgtgctgacaggacagaaagggttggaaggagtggcaatatcccagctggaacaacagttgatacagacattacacacccatatgagtttgatttttacctctgtagccatgctggaatacagggtaccagccgtccttcacactatcatgttttatgggatgataactgctttaatgcagatgaacttcagctgctaacttaccagctctgccacacttatgtgcgctgtacacgatctgtttctatacctgcaccagcgtattatgctcacctggtggcattcagagccagatatcatctcgtagacaaagaacatgacagtgctgaaggaagtcacgtttcaggacagagcaatgggcgagatccacaagctcttgccaaggctgtacagattcaccaagataccttacgcacaatgtactttgcttaaaaagtccaagattattctctgagaggaagaactgaaagatgaatcgacatacaacgtgtttccagtggagttcgttgagtggggatgcctgcagccatacagaaaccaacactgtggggaccagggtctgatttttatgttgatacaagtaagattgtttacttcatcaaggaacacagcactattatgcaatatgaaaccagccaacagcgcttttgtgcggtctcctgtaggaagtatcgccaatgttttgttttcactttctttgtagtctaacccttttaatgcctttacctcaagttgcttggcagcacaactatctttgcaaaaaaaaaaggtaaatgatggtttaaaaaaaaacacctacatgaataatcagtgattgttcacaattgtgtgtgcaaaaaaattaatgtgcattcatgtattgtaaaaggtatctgtatattttaaatatatacatatatacttcatatgcatatatatctggatctacatttataatagatatatatgttctttgtatatattttatagttcattccattggggaacttcctttcccttttattatcctcccaccaccacttttatttctctctctacctcccttgccttcatcgcctacatttttttcccctgatgctaccagtgacattcaaatgttcatgtatctggttcatttgaatatgaagcatggcaaactagacttttttgttttgttttgcacaccctctcctgtctcttgtctcatacacaattctgagccctcaactcgatattgctttcttaagaaacaaaattattttatatatatatggttttatgagagtttgtgtttgccccctccaaatttacatttgccatttgtgcaatgtgtacataagcagtagcaacctaaactattctttttctttagtgagtttgttaaagctgctataaatataaaaccttgtcaaaagtttaactctttctctctacaagtgatgtgtattctaaagccttttgtttctatgggttatacatggaaatctctaaaagcttttatgaagagtaaatattttaaatgattagaacaaaatagggttgaggcctctgaagttgggtcaagagagaagggattgttgaggtatttttaatttttttttttttttttgctagtttacttgctgcctctcataccttaatgtgcttttcatatatatatttttatatatatgtttgtatatatataaacatatatgtatgtgttttgaagtatagcttccttttcttttctatttattagaatagtgttttaataattatagaaccatattggcaacatcttttatagaaataatcatgtttattttaagaactgacaacttgtttttgctatcttttagtgcaataagcagttttaaaggaaagctgtgtctgtttgatgtttttatcacagatagtggaagaaacaggcaccttcataattttaaaagggcaaagtaatacagccttaatttcagaaggaaagttttgtaattttcaagtctcaagcatgtctttaaaaatcataatgaaaatgaaggaagttaatatcctagataagtctgaccttgaatattaaaaataaagttgaattttgatttaagatatgaccacgatagatgaaaatttataaagtatttaaattttttgaaaataaattatgtttattgaagaatcatactggttacattcccattttcattgactaaaattaatcaggaaaatgtggccatttaaacttttttttttttttttttgcttatttattaccagtgtaactttccttttaaaattagggttatggtgacaaaggaagttaagactttattttaaatgcgctaagtcagtgaaatgtggaaaaaagttttgcaaaactttcattatataattatttcactttaaggtattaaaaagtactatgaagttgtcaaaaccaagttcaccagtaacattggattcaggggagctttgcactttgtgactcatgaaaatgcattttaattattattattttttttttttttgcactggttcagagtataaatattacagattgtttccagtgggcattgttgttaaccttttggaattccatctgctcatgaaaacgaatggattagttctacagtttctctcttacctataacccactcttattgccaatttactgtattttgagcctaaaacctgagcccatgtcctccaacaggtatgaaatcttttatccccctgccagaaaactaagtactgtattttgtatgtttattatattgaaatgtctgaaatgtaatttacaacactgtttcaa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