LOCUS       XM_016147246           16316 bp    mRNA    linear   MAM 28-SEP-2020
DEFINITION  PREDICTED: Rousettus aegyptiacus argonaute RISC catalytic component
            3 (AGO3), transcript variant X9, mRNA.
ACCESSION   XM_016147246
VERSION     XM_016147246.2
DBLINK      BioProject: PRJNA665208
KEYWORDS    RefSeq.
SOURCE      Rousettus aegyptiacus (Egyptian rousette)
  ORGANISM  Rousettus aegyptiacus
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
            Mammalia; Eutheria; Laurasiatheria; Chiroptera; Megachiroptera;
            Pteropodidae; Pteropodinae; Rousettus.
COMMENT     MODEL REFSEQ:  This record is predicted by automated computational
            analysis. This record is derived from a genomic sequence
            (NW_023416284.1) annotated using gene prediction method: Gnomon,
            supported by mRNA evidence.
            Also see:
                Documentation of NCBI's Annotation Process
            
            On Sep 28, 2020 this sequence version replaced XM_016147246.1.
            
            ##Genome-Annotation-Data-START##
            Annotation Provider         :: NCBI
            Annotation Status           :: Full annotation
            Annotation Name             :: Rousettus aegyptiacus Annotation
                                           Release 101
            Annotation Version          :: 101
            Annotation Pipeline         :: NCBI eukaryotic genome annotation
                                           pipeline
            Annotation Software Version :: 8.5
            Annotation Method           :: Best-placed RefSeq; Gnomon
            Features Annotated          :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA
            ##Genome-Annotation-Data-END##
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..16316
                     /organism="Rousettus aegyptiacus"
                     /mol_type="mRNA"
                     /isolate="mRouAeg1"
                     /db_xref="taxon:9407"
                     /chromosome="Unknown"
                     /sex="male"
                     /tissue_type="muscle"
                     /dev_stage="adult"
                     /country="USA: Berkeley (captive colony)"
                     /collection_date="2017"
                     /collected_by="Sonja Vernes"
     gene            1..16316
                     /gene="AGO3"
                     /note="Derived by automated computational analysis using
                     gene prediction method: Gnomon. Supporting evidence
                     includes similarity to: 8 mRNAs, 4 Proteins, and 100%
                     coverage of the annotated genomic feature by RNAseq
                     alignments, including 27 samples with support for all
                     annotated introns"
                     /db_xref="GeneID:107512084"
     CDS             1476..3356
                     /gene="AGO3"
                     /codon_start=1
                     /product="protein argonaute-3 isoform X5"
                     /protein_id="XP_016002732.1"
                     /db_xref="GeneID:107512084"
                     /translation="

MCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYETDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYELLAIREACISLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNCFNADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA"

     misc_feature    1476..1817
                     /gene="AGO3"
                     /note="PAZ domain, argonaute_like subfamily. Argonaute is
                     part of the RNA-induced silencing complex (RISC), and is
                     an endonuclease that plays a key role in the RNA
                     interference pathway. The PAZ domain has been named after
                     the proteins Piwi,Argonaut, and Zwille; Region:
                     PAZ_argonaute_like; cd02846"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    order(1611..1613,1656..1658,1698..1700,1710..1712,
                     1764..1766,1785..1787,1791..1793)
                     /gene="AGO3"
                     /note="nucleic acid-binding interface [nucleotide
                     binding]; other site"
                     /db_xref="CDD:239212"
     misc_feature    1950..3227
                     /gene="AGO3"
                     /note="PIWI domain, Argonaute-like subfamily. Argonaute is
                     the central component of the RNA-induced silencing complex
                     (RISC) and related complexes. The PIWI domain is the
                     C-terminal portion of Argonaute and consists of two
                     subdomains, one of which provides the...; Region:
                     Piwi_ago-like; cd04657"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(2361..2363,2373..2375,2409..2420,2427..2429,
                     2451..2453,2460..2462,2472..2474,2484..2486)
                     /gene="AGO3"
                     /note="5' RNA guide strand anchoring site [active]"
                     /db_xref="CDD:240015"
     misc_feature    order(2565..2567,2571..2573,2781..2783,3195..3197)
                     /gene="AGO3"
                     /note="active site"
                     /db_xref="CDD:240015"
ORIGIN      

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